Genome Mapping and Genomics in Fishes and Aquatic Animals

Genome Mapping and Genomics in Fishes and Aquatic Animals pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:
作者:Kole, Chittaranjan 编
出品人:
页数:180
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价格:$ 236.17
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isbn号码:9783540738367
丛书系列:
图书标签:
  • Fish Genomics
  • Aquatic Animal Genomics
  • Genome Mapping
  • Comparative Genomics
  • Molecular Biology
  • Aquaculture
  • Evolutionary Biology
  • Genetic Diversity
  • Fish Genetics
  • Genomics
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具体描述

Mapping of animal genomes has generated huge databases and several new concepts and strategies, which are useful to elucidate origin, evolution and phylogeny. Genetic and physical maps of genomes further provide precise details on chromosomal location, function, expression and regulation of academically and economically important genes. The series Genome Mapping and Genomics in Animals provides comprehensive and up-to-date reviews on genomic research on a large variety of selected animal systems, contributed by leading scientists from around the world. This volume summarizes the first era of genomic studies of aquaculture species, in which the tools and resources necessary to support whole-genome sequencing were developed. These tools will enhance efforts toward selective breeding of aquaculture species. Included in this volume are summaries of work on salmonids, cyprinids, catfish, tilapias, European sea bass, Japanese flounder, shrimps and oysters.

现代水产养殖中的基因组学应用与生物技术进展 图书简介 本书聚焦于现代水产养殖领域的前沿进展,深入探讨了基因组学、分子生物学技术以及先进生物技术在提升水产动物健康、生产效率和可持续性方面所扮演的关键角色。本书旨在为水产科学家、研究人员、行业专业人士及高年级学生提供一个全面、深入且实用的知识框架,用以理解和应用最新的遗传学工具来应对当前水产养殖业所面临的挑战。 第一部分:水产动物基因组学的理论基础与方法论 第一章:水产动物基因组学的研究范式 本章首先阐述了从传统的表型选择育种向现代基因组选择(Genomic Selection, GS)和精准育种(Precision Breeding)转型的必要性与基础。讨论了水产生物(如鱼类、甲壳类和软体动物)基因组的独特性质,包括多倍性、性别决定系统的多样性,以及基因组组装和注释的挑战。详细介绍了新一代测序(NGS)技术,特别是全基因组重测序(WGS)和转录组测序(RNA-seq)在水产物种中的应用。强调了高质量参考基因组在分子育种中的基石作用,并对比了不同物种基因组组装策略的优劣。 第二章:群体遗传学与遗传多样性评估 深入探讨了群体遗传学在水产资源管理中的应用。本章详细介绍了如何利用高密度单核苷酸多态性(SNP)芯片和海量测序数据,对水产种群的遗传结构、有效种群大小(Ne)和遗传漂变进行精确评估。重点讨论了遗传多样性与抗病性、环境适应性之间的关联,并提出了维持和恢复濒危或人工选育群体遗传完整性的策略。阐述了利用基因组学方法识别潜在的近交衰退(Inbreeding Depression)信号及其对生产性能的负面影响。 第三章:功能基因组学与基因功能注释 本章侧重于解析基因在水生生物生命活动中的具体功能。详细介绍了转录组微阵列、ChIP-seq(染色质免疫沉淀测序)和ATAC-seq(亲和力转移测序)等技术在揭示环境胁迫(如温度、盐度、低氧)下基因表达调控网络中的应用。讨论了利用CRISPR/Cas9等基因编辑技术在鱼类模型中进行精确基因功能验证的方法,包括基因敲除、基因编辑对代谢通路和免疫反应的调控机制研究。 第二部分:基因组学驱动的精准育种与健康管理 第四章:分子标记辅助育种的优化 系统梳理了分子标记辅助选择(MAS)的发展历程及其在水产选育中的具体实践。详细介绍了QTL(数量性状基因座)定位、GWAS(全基因组关联研究)在解析复杂经济性状(如生长速度、饲料转化率、胴体组成)遗传基础中的应用。本章着重讲解了如何构建和验证高预测力的基因组选择模型(GS Models),并通过案例研究展示了GS在加速育种周期和提高育种准确性方面的显著优势,尤其是在传统育种周期较长的物种中。 第五章:水产动物抗病育种的基因组学策略 抗病性是水产养殖业可持续发展的核心。本章聚焦于通过基因组学手段识别和利用抗病相关基因。详细介绍了如何利用混合模型(Mixed Models)进行抗病性状的遗传力估计,并识别出与特定病原体(如病毒、细菌、寄生虫)具有抵抗力的关键基因组区域。讨论了新型疫苗开发中基于基因组学数据设计抗原靶点的前景,以及利用基因组学工具监控病原体进化和耐药性发展的方法。 第六章:环境适应性与资源保育的基因组学视角 随着气候变化对水产养殖环境的压力日益增加,本章探讨了如何利用基因组学工具预测和增强物种对非生物胁迫的适应能力。内容涵盖热休克蛋白(HSPs)基因家族的分析、渗透压调节相关基因的鉴定,以及低氧耐受性的遗传基础研究。此外,本章也讨论了基因组学在水生野生种群保护中的作用,包括识别适应性基因组区域,指导保护区划设和人工增殖放流的遗传管理。 第三部分:前沿生物技术与未来展望 第七章:基因编辑技术在水产改良中的伦理与应用 本章深入探讨了以CRISPR/Cas9为代表的基因编辑技术在水产动物育种中的实际操作与潜力。详细介绍了基因编辑在实现性别控制(如培育单性系)、去除过敏原、或快速性状改良中的应用案例。同时,本书以严肃的态度讨论了基因编辑水生生物商业化应用所涉及的生态风险评估、公众接受度和监管框架的建立,强调了负责任创新的重要性。 第八章:表观遗传学与环境-基因组交互作用 本章拓展了研究视野至表观遗传学领域。解释了DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA(如miRNA和lncRNA)如何介导环境因子对水产生物基因表达的长期调控。讨论了表观遗传标记在预测早期发育、压力耐受性和遗传稳定性方面的潜力,并阐述了表观遗传组学如何与传统基因组学相结合,为理解复杂性状的遗传机制提供更精细的视角。 第九章:数据整合与生物信息学工具链 本章关注于从海量测序数据中提取生物学意义的关键流程。详细介绍了水产基因组学数据分析所需的核心生物信息学工具包,包括基因组组装的软件选择、变异检测流程、以及如何构建高效的基因组数据库。重点讨论了整合多组学数据(基因组学、转录组学、蛋白质组学)的系统生物学方法,以期构建全面的水生生物调控网络模型,为精准育种和疾病诊断提供决策支持。 结语:迈向可持续与智能化的水产未来 本书最后总结了基因组学和生物技术在推动水产养殖业向更高效、更环保、更具韧性的方向发展中所扮演的不可替代的角色。展望未来,强调了大数据分析、人工智能模型在加速遗传改良过程中的集成应用,并呼吁跨学科合作以充分释放水产基因组学技术的巨大潜力。

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