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出版者:

作者:Garrity, George

出品人:

页数:1750

译者:

出版时间:2012-5

价格:0.00 元

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isbn号码:9780387950433

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• 细菌分类学
• 细菌鉴定
• 系统细菌学
• 微生物学
• 细菌学
• Bergey's Manual
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• 微生物分类学
• 细菌生理学
• 细菌生态学

细菌系统分类学手册 《细菌系统分类学手册》（Bergey's Manual of Systematic Bacteriology）是一部详尽阐述细菌生命科学的权威性著作。本书致力于为微生物学家、分类学家、生态学家、医学研究人员以及所有关注细菌世界的专业人士提供一个全面、准确且系统化的细菌分类框架。 本书的结构和内容设计旨在反映当前微生物学研究的前沿进展，尤其是在分子生物学和基因组学飞速发展的背景下。它不仅仅是一本分类工具书，更是一部深入探讨细菌多样性、进化关系和生理特性的百科全书。 核心内容与结构 《细菌系统分类学手册》的撰写遵循严格的科学标准，其核心目标是根据系统发生学原理对已知细菌进行分类和描述。全书内容覆盖了从原核生物的宏观划分到特定物种的微观特征的方方面面。 第一卷：基础理论与方法学 本卷通常聚焦于系统分类学的理论基础和实际操作方法。它详细阐述了用于鉴定和分类细菌的关键技术和标准。 分类学原理： 深入探讨了系统发生学在细菌分类中的应用，解释了如何构建和解释基于核糖体RNA（rRNA）序列分析的系统发生树。阐明了界（Domain）、门（Phylum）、纲（Class）、目（Order）、科（Family）、属（Genus）和种（Species）等分类学层级的定义和应用标准。 表型分析技术： 详细介绍了传统的微生物学鉴定方法，包括形态学观察（如革兰氏染色、菌落形态、运动性）、生理生化反应测试（如氧化酶、过氧化氢酶、发酵产酸谱等）。这些传统方法虽然在现代分类中地位有所下降，但仍是快速鉴定的重要补充。 分子生物学方法： 这是现代细菌分类的核心。本卷会详细描述基因组测序、16S rRNA基因分析（包括测序、比对和系统发育分析）、全基因组比较分析（如ANI, dDDH等指标的计算和解释）。同时，也会涵盖对特定基因簇（如MLST）的分析方法，用于更精细的种内和种间区分。 培养与分离技术： 涵盖了从环境样本中分离和纯化细菌的各种技术，包括选择性培养基的配制、厌氧培养技术以及如何维持和保存微生物菌株的规范操作。 后续各卷：细菌门的系统描述 手册的主体部分按照当前公认的细菌系统发生树进行划分，逐一介绍各个主要的细菌门及其下属的目、科、属和种。每一分类单元的描述都力求全面和详尽。 分类单元描述要素： 对于每一个被正式描述的属或种，手册通常会提供以下关键信息： 1. 命名法与历史： 描述该分类单元的命名历史、模式种（Type Species）的确定，以及引用最初发表该分类单元的文献。 2. 革兰氏染色特性： 明确指出其细胞壁结构分类（革兰氏阳性或阴性）。 3. 形态学特征： 描述细胞的形状（球菌、杆菌、螺旋菌等）、大小、排列方式、有无鞭毛、孢子形成能力等。 4. 培养特性： 描述其生长温度范围、氧气需求（好氧、厌氧、兼性厌氧）、营养要求以及在特定培养基上的生长表现。 5. 生理生化特性： 详述其代谢途径的关键酶反应结果，这对于实验室鉴定至关重要。 6. 分子特征： 提供关键的分子生物学数据，如16S rRNA序列的特征性片段或与已知物种的相似度百分比，以及主要的基因组特征（如GC含量）。 7. 生态学与生物学意义： 阐述该细菌的自然栖息地（如土壤、水体、宿主肠道、极端环境等）、其在生态系统中的作用（如固氮、分解、致病性），以及其潜在的生物技术应用价值。 涵盖的细菌多样性： 手册的内容覆盖了微生物世界中绝大多数已被分离和鉴定的细菌类群，包括但不限于： 光合细菌： 如蓝细菌（Cyanobacteria），它们对地球早期大气和现今的氧气循环至关重要。 变形菌门（Proteobacteria）： 这是细菌界中最大、多样性最丰富的门，涵盖了从著名的病原体（如沙门氏菌、大肠杆菌）到重要的模式生物和环境微生物。手册会细致区分α、β、γ、δ、ε等各个纲。 厚壁菌门（Firmicutes）： 包括重要的乳酸菌（如乳球菌、链球菌）和芽孢杆菌（如枯草芽孢杆菌），以及许多产孢的生物。 放线菌门（Actinobacteria）： 以其形成分枝状菌丝体的特性著称，是许多重要抗生素的来源（如链霉菌属）。 拟杆菌门（Bacteroidetes）： 在厌氧消化道环境中具有核心作用。 其他重要细菌群落： 如绿色硫细菌、非硫细菌、互营细菌等，确保了对非模式培养菌株的全面覆盖。 目标读者与应用价值 《细菌系统分类学手册》是微生物学领域中不可替代的参考工具，其应用价值贯穿科研、教学和实际应用： 1. 科研工作者： 无论是在基础研究中探索新的细菌功能，还是在新兴的宏基因组学项目中对序列进行注释和分类，手册提供了权威的“黄金标准”。当发现新的细菌或对现有分类提出质疑时，这是进行正式描述和命名的基本参考。 2. 教学领域： 它是大学和研究生层面微生物学、系统分类学和生物多样性课程的标准教材和参考书，帮助学生建立对细菌界清晰、准确的认知结构。 3. 环境与医学微生物学： 对于需要从复杂样本（如土壤、水、临床标本）中鉴定特定细菌的专业人员，手册提供了详细的鉴别特征，是准确识别病原体和环境指示菌的关键。 4. 生物技术产业： 在开发新型酶制剂、益生菌产品或生物修复剂时，准确的菌株鉴定和分类是保证产品质量和知识产权的基础。 通过其对每一个已知细菌类群的细致入微的描述，以及对最新的分子分类学进展的整合，《细菌系统分类学手册》持续塑造着我们理解和组织细菌生命多样性的方式。它代表了微生物学界对全球细菌多样性进行科学梳理的集体努力与最高成就。

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这本书最让我感到惊喜的一点，是它对于那些“边缘”和“新兴”微生物类群的关注程度，丝毫没有逊色于对传统模式菌的描述。在当前基因测序技术飞速发展的背景下，新的细菌界限和关系不断被挑战，而这本手册显然紧跟步伐，不断进行修订和更新。我记得有一次为了确认一个新分离菌株的归属，我反复比对了手册中不同版本提供的特征描述和分子数据，最终确定了它最合理的定位。这种持续的更新和对前沿研究成果的吸纳，是它能够长期保持权威性的关键。阅读体验上，虽然条目繁多，但其清晰的结构设计——往往是按照关键鉴定特征（如革兰氏染色、氧化酶反应等）进行排序——极大地提高了查找效率。对于需要撰写大量物种描述的学者来说，它提供了一个统一、权威的标准模板，避免了不同实验室间术语和描述口径不一致的问题，这种标准化工作本身就是一项巨大的贡献。

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说实话，初次接触这本巨著时，我最大的感受是它的“重量感”——不仅是物理上的，更是知识体系上的厚重。它不像那些流行的科普读物那样轻快易读，它要求你带着严谨的学术态度去啃食。我曾尝试用它来查找一些特定的、非模式菌株的鉴定信息，发现它的覆盖面广得惊人，甚至包括了一些在偏远地区或极端环境中发现的微生物。这种全景式的展示，让人深刻体会到地球上生命形式的复杂与奇妙。我特别欣赏它在描述每个细菌类群时，所采用的从宏观形态到微观结构，再到生化代谢特征的层层递进的叙述方式。这使得即便是复杂的分类群，也能被有条理地组织起来。对于研究生阶段的学习者来说，这本书提供的不仅仅是知识点，更是一种系统的、结构化的思维方式，教会你如何科学地看待和组织微生物世界的复杂性。它的参考价值，远超出了普通教科书的范畴，更像是一份活态的微生物“族谱”。

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坦白讲，这本书的阅读体验对读者的基础知识有一定要求。它不是用来“入门”的，而是用来“精进”和“对标”的。我曾向一位刚开始接触微生物学的本科生推荐，他很快就被那些密密麻麻的拉丁学名和复杂的生物化学路径描述给劝退了。然而，对于有志于从事分类学、环境微生物组研究或工业微生物筛选的专业人士而言，它的价值无可替代。其中关于特定功能基因簇或生物合成通路与分类地位之间关联的讨论，尤其发人深省，它揭示了功能适应如何驱动物种的进化分化。书中对于特定生境（比如深海热泉、土壤深层）微生物群落的专门章节，也为生态学家提供了坚实的分类学基础，使得生态学研究不再仅仅停留在“什么在哪里”的层面，而是深入到“它们是谁”的本质问题。我个人认为，它所体现的科学严谨性，是很多现代快速出版物难以比拟的。

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我很少见到有一本工具书能够将如此庞大的、动态变化的科学信息，组织得如此井井有条，并且保持其长久的参考价值。每一次我需要重新审视某个细菌门类的系统发育关系时，我都会回到这本书中。它不仅仅是一份清单，更像是一部不断被完善的微生物学“宪法”。我尤其欣赏它对分类学史的尊重，书中对早期分类学家工作的回顾和继承，使我们不至于忘记科学知识积累的艰辛历程。在查阅具体菌种描述时，不同于网络数据库的碎片化信息，这本书提供的是一个完整的、经过同行高度认可的叙事链条。如果你想知道某个细菌是如何被发现、被命名、被重新分类的完整历史脉络，这本书提供了最可靠的路径。它体现了一种对科学细节近乎偏执的追求，正是这种精神，确保了其在微生物学领域中无可撼动的核心地位，是所有严肃微生物研究者必须面对和尊重的基石。

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这本书简直是细菌分类学领域的百科全书，内容之详尽，让人叹为观止。我记得我第一次翻开它的时候，光是目录就让我感到震撼，几乎涵盖了已知所有细菌的主要类群。它不仅仅是简单地罗列细菌的名称和特征，而是深入到分子生物学、生态学和进化史的层面，提供了一个极其精细的“生命之树”的微生物部分。对于任何想要深入了解细菌多样性和系统发育的科研工作者来说，这本书是案头必备的工具书。特别是关于一些新发现的、在传统分类体系中难以归类的菌种的描述，处理得非常到位，体现了编者们在整合最新基因组学数据方面的巨大努力。阅读过程中，我发现它对不同细菌门、纲、目之间的界限划分和命名法的演变历史有着非常清晰的梳理，这对于理解当前微生物学研究的前沿进展至关重要。书中大量的图表和详细的特征描述，极大地帮助了我进行实际的菌种鉴定工作，让原本模糊的分类界限变得清晰起来。

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