The Aptamer Handbook

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出版者:John Wiley & Sons Inc
作者:Klussmann, Sven (EDT)
出品人:
页数:518
译者:
出版时间:
价格:$ 235.00
装帧:HRD
isbn号码:9783527310593
丛书系列:
图书标签:
  • 生物
  • Aptamer
  • Nucleic acid
  • Biotechnology
  • Molecular biology
  • Biosensors
  • Drug discovery
  • Diagnostics
  • Targeted therapy
  • SELEX
  • Bioanalysis
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具体描述

In The Aptamer Handbook, leading scientists from academia as well as biotech and pharma companies introduce the revolutionary concept of designing RNA and DNA oligonucleotides with novel functions by in vitro selection. These functions comprise high affinity binding (aptamers), catalytic activity (ribozymes and deoxyribozymes) or combinations of binding and catalytic properties (aptazymes). Basic concepts and technologies describing in detail how these functional oligonucleotides can be identified are presented. Numerous examples demonstrate the versatility of in vitro selected oligonucleotides. Special emphasis has been put on a section that shows the broad applicability of aptamers, e. g. in target validation, for analytics, or as new therapeutics. This first overview in the field is of prime interest for a broad audience of scientists both in academia and in industry who wish to expand their knowledge on the potential of new oligonucleotide functions and their applications.

科学前沿探索:蛋白质相互作用的调控与应用 书籍名称: 《蛋白质相互作用的调控与应用》 作者: [此处可填写真实的作者姓名或学术团队] 出版社: [此处可填写真实的出版社名称] 出版日期: [此处可填写真实的出版日期] --- 内容简介 《蛋白质相互作用的调控与应用》一书深入剖析了生命体内核中最为核心的分子事件——蛋白质间的相互作用(Protein-Protein Interactions, PPIs)。理解这些动态、精确且可逆的分子对话,是现代生物学、生物化学乃至药物研发领域最迫切的任务之一。本书并非简单罗列已知的相互作用数据,而是聚焦于调控机制、调控工具的应用以及由此衍生出的前沿疗法与诊断技术。 本书结构严谨,内容涵盖了从基础理论到尖端实践的多个层面,旨在为生命科学研究人员、临床生物学家以及药物化学家提供一本全面且具有高度实践指导意义的参考书。 第一部分:蛋白质相互作用的基础与复杂性 本部分着重于建立对PPIs的深刻理解,超越简单的“结合”概念,探讨其在细胞信号传导、分子机器组装以及生命周期调控中的核心地位。 第一章:分子识别的物理化学基础 详细阐述了驱动蛋白质相互作用的分子力量,包括范德华力、氢键、疏水效应和静电作用。重点分析了这些非共价键如何在特定构象和微环境中形成高亲和力和高特异性的结合界面。引入了界面几何学和拓扑学的概念,解释了蛋白质表面残基的排列如何决定结合的“钥匙与锁”模式,以及动态构象变化(如诱导契合)在稳定相互作用中的作用。 第二章:信号通路中的级联与网络 本章将PPIs置于细胞信号网络的宏观背景下进行考察。探讨了关键信号通路(如MAPK、PI3K/AKT、NF-$kappa$B)如何通过一系列有序的蛋白质-蛋白质结合和解离事件,将外部刺激转化为精确的细胞应答。深入分析了“支架蛋白”(Scaffolds)的功能,它们如何通过空间组织来提高信号传导的效率和保真度,以及如何通过“分子开关”(如磷酸化、泛素化)来精确控制相互作用的开启与关闭。 第三章:相互作用的结构生物学解析 介绍了解析PPIs结构所需的关键技术,包括X射线晶体学、冷冻电镜(Cryo-EM)和核磁共振(NMR)。重点讨论如何利用这些技术解析复合物结构,识别出关键的“热点残基”(Hotspots),这些残基对结合自由能的贡献最大,是未来药物设计的主要靶点。同时,探讨了结构生物学在解析多蛋白复合物(如核糖体、蛋白酶体)组装过程中的挑战与机遇。 第二部分:调控蛋白质相互作用的策略与工具 理解了基础机制后,本书进入核心环节——如何精确地介入和调控这些相互作用,以达到研究或治疗的目的。 第四章:基于小分子的相互作用抑制剂设计 详细介绍了设计口服生物利用度高、能有效靶向蛋白质-蛋白质界面的小分子抑制剂的策略。内容包括:基于结构的药物设计(SBDD)、片段式药物设计(FBDD)在PPI靶点上的应用。重点讨论了如何克服PPIs界面通常较大、表面积光滑的挑战,例如通过“三明治”模式或利用动态口袋进行抑制。案例研究包括对MDM2-p53或BCL-2家族蛋白相互作用的抑制剂开发历程。 第五章:多肽与肽模拟物在调控中的应用 多肽类分子作为天然配体的模拟物,在靶向PPIs方面具有独特的优势。本章探讨了如何优化多肽的稳定性和细胞通透性,使其能更有效地干扰细胞内的相互作用。内容涵盖了肽的环化、非天然氨基酸取代以及PEG化等修饰技术,用以提高其体内半衰期和膜渗透性。此外,还讨论了如何利用肽段文库筛选来发现新型的相互作用调节剂。 第六章:核酸类分子干预技术 着重探讨了使用寡核苷酸(Oligonucleotides)技术,如反义寡核苷酸(ASOs)和siRNA,来下调关键相互作用蛋白的表达,从而间接调控特定PPIs网络。更进一步,探讨了核酸适配体(Aptamers)作为非抗体类配体,通过高亲和力结合特定蛋白,阻断或诱导相互作用的潜力,及其在体外诊断和体内靶向递送中的应用前景。 第三部分:先进的相互作用研究方法与技术 本部分聚焦于当前实验室中用于实时、动态监测蛋白质相互作用的尖端技术平台。 第七章:高通量筛选与亲和力测量技术 全面介绍了用于大规模筛选PPIs调控剂的方法,包括表面等离子共振(SPR)、生物层干涉仪(BLI)和生物分子互作分析(BIAcore)等技术在精确测量结合动力学($k_{on}$和$k_{off}$)和解离常数($K_D$)中的应用。讨论了荧光共振能量转移(FRET)和时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)如何在生理相关条件下监测活细胞内的分子事件。 第八章:细胞内相互作用的可视化与成像 本章关注如何在活细胞环境中可视化蛋白质复合物的形成与解离。详细介绍了邻近诱导的荧光互补技术(BiFC)、酵母双杂交系统(Y2H)的改进(如“凸轮式”Y2H),以及先进的免疫共沉淀/质谱(Co-IP/MS)技术在鉴定蛋白质组范围内相互作用伙伴的流程与数据解读。探讨了利用基因编码探针(如基于GFP的系统)来实时追踪内源性相互作用的变化。 第四章:调控蛋白质相互作用的临床转化与应用 最后一部分将理论和工具应用于解决重大的疾病问题,展示了靶向PPIs在生物医学中的巨大潜力。 第九章:癌症治疗中的关键靶点 详细分析了几个关键的致癌性PPIs,如P53-MDM2、RAS-RAF和MYC-MAX网络。阐述了如何通过特异性抑制这些相互作用来恢复肿瘤抑制功能、阻断异常增殖信号或诱导细胞凋亡。重点讨论了如何应对癌症信号通路中常见的“可成药性”挑战。 第十章:自身免疫性疾病与感染性疾病的调控 探讨了免疫系统功能失调中涉及的蛋白质相互作用,例如T细胞活化过程中的共刺激分子(如CD28/CTLA-4与B7家族蛋白)的调控。在感染性疾病方面,分析了病毒或细菌蛋白如何劫持宿主蛋白的相互作用以促进其复制和传播,并介绍了设计分子干扰剂阻断这些关键入侵步骤的策略。 第十一章:未来展望:组装体与功能性调控 展望了利用多价相互作用(Multivalency)和自组装肽类(Self-assembling Peptides)来构建新型分子支架或纳米系统,以期实现对复杂生物过程的精确“编程”。讨论了人工智能和机器学习在预测PPIs热点和加速调控分子筛选中的日益重要的角色。 --- 目标读者: 结构生物学家、生物化学家、药物化学家、分子生物学家、生物技术工程师以及对分子机制感兴趣的高年级本科生和研究生。 本书价值: 《蛋白质相互作用的调控与应用》汇集了当前调控分子机器的核心知识和最前沿的技术平台,是理解和干预复杂生命活动必不可少的科学参考工具书。

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