Protein Arrays, Biochips, and Proteomics

Protein Arrays, Biochips, and Proteomics pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Marcel Dekker Ltd
作者:Joanna S. Albala
出品人:
页数:422
译者:
出版时间:2003-08-20
价格:GBP 100.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9780824743123
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质芯片
  • 蛋白质组学
  • 生物芯片
  • 蛋白质分析
  • 生物技术
  • 分子生物学
  • 生物医学工程
  • 高通量筛选
  • 生物传感器
  • 蛋白质相互作用
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具体描述

From disease marker identification to accelerated drug development, "Protein Arrays, Biochips, and Proteomics" offers a detailed overview of current and emerging trends in the field of array-based proteomics. This reference focuses on innovations in protein microarrays and biochips, mass spectrometry, high-throughput protein expression, protein-protein interactions, structural proteomics, and the proteomic marketplace for comprehensive understanding of past, present, and future proteomic research. Offering an abundance of figures and charts, the book compiles a wide variety of technologies and applications ranging from functionalized chip surfaces to strategies for protein expression.

好的,这是一份关于一本名为《蛋白质组学:基础与前沿技术》的图书的详细简介,内容完全不涉及您提到的《Protein Arrays, Biochips, and Proteomics》一书的具体内容。 图书简介:《蛋白质组学:基础与前沿技术》 一部全面、深入的蛋白质组学研究工具书与方法指南 《蛋白质组学:基础与前沿技术》是一本为生命科学领域的研究人员、高级学生以及生物技术行业专业人士量身打造的权威著作。本书旨在提供一个完整、系统且与时俱进的知识框架,深入剖析蛋白质组学(Proteomics)从理论基础到尖端实验技术的全貌。本书的编写严格遵循科学严谨性,力求在保持学术深度的同时,兼顾其实际操作指导价值。 第一部分:蛋白质组学的基础理论与核心概念 本书的开篇部分奠定了坚实的理论基础,详细阐述了蛋白质组学的核心概念、历史发展轨迹及其在现代生物学研究中的战略地位。 第一章:蛋白质组学的定义与范式演进 本章首先清晰界定了“蛋白质组学”的概念,区别于基因组学和转录组学。它深入探讨了从单一蛋白质分析到大规模、系统性蛋白质组分析的范式转变。重点讨论了蛋白质在生命活动中的核心功能,以及对蛋白质组进行全面研究的必要性。内容涵盖了蛋白质组研究的动态性和复杂性,包括翻译后修饰(PTMs)对蛋白质功能和活性的巨大影响。 第二章:蛋白质的结构、功能与生物学背景 为理解蛋白质组学数据,对蛋白质本身的理解至关重要。本章回顾了蛋白质一级、二级、三级和四级结构的决定性因素,并重点讨论了蛋白质相互作用网络(PPIs)的构建及其在细胞信号传导、代谢调控中的作用。此外,还详细介绍了蛋白质在不同组织、器官及病理状态下的表达差异,为后续的定量分析奠定生物学基础。 第三章:样本制备的艺术与挑战 蛋白质组学研究的成功在很大程度上取决于起始样本的质量。本章系统梳理了从细胞、组织、体液(如血浆、尿液)中提取和分离蛋白质的关键步骤。深入分析了裂解缓冲液的选择、蛋白酶抑制剂的使用策略、以及如何有效去除高丰度蛋白(如血清白蛋白)以提高低丰度生物标志物的检测灵敏度。本章强调了标准化操作流程(SOPs)在确保实验可重复性中的核心地位。 第二部分:经典分离与鉴定技术 本部分聚焦于蛋白质组学研究中最为经典和不可或缺的分离与鉴定技术,为后续的高通量分析打下坚实的技术基础。 第四章:二维凝胶电泳(2D-PAGE)的深度解析 尽管高通量技术日益普及,2D-PAGE 仍是蛋白质差异表达研究中具有独特优势的工具。本章详尽介绍了等电聚焦(IEF)和紧随其后的高分辨率分离胶电泳技术。重点分析了影响分离效果的参数,如缓冲液系统、pH 梯度条的选择,以及如何优化电泳条件以获得清晰的蛋白质点。同时,也讨论了凝胶图像的捕获、数字化和斑点比较分析的软件流程。 第五章:高效液相色谱(HPLC)在蛋白质组学中的应用 本章详细介绍了液相色谱技术在蛋白质组分析中的关键作用,尤其是在高通量质谱分析之前作为首要分离步骤。内容包括反相色谱(RP-HPLC)、离子交换色谱(IEC)和尺寸排阻色谱(SEC)的原理及其在蛋白质和肽段分离中的具体应用。对于多维色谱系统(如LC-LC)的耦合策略,本书也进行了深入的阐述。 第三部分:高通量质谱技术与定量策略 本部分是全书的核心,系统介绍了驱动现代蛋白质组学发展的质谱(MS)技术及其多样化的定量方法。 第六章:基础质谱原理与蛋白质组学应用 本章从基础物理化学角度阐述了质谱仪的基本构造,包括离子源(如ESI, MALDI)、质量分析器(如四极杆、离子阱、飞行时间)和检测器的工作原理。重点讲解了“自上而下”(Top-Down)和“自下而上”(Bottom-Up)蛋白质组学分析的技术路线选择及其优缺点。 第七章:肽段谱库构建与蛋白质鉴定 详细介绍了肽段碎片离子生成(如碰撞诱导解离 CID, 电子转移解离 ETD)的机制。重点解析了如何利用高分辨率质谱数据对肽段进行精确质量测定,并基于经典数据库(如UniProt)进行蛋白质鉴定。本章详述了数据依赖采集(DDA)和数据非依赖采集(DIA)两种主要的数据采集模式。 第八章:绝对与相对定量蛋白质组学策略 定量是蛋白质组学的核心挑战。本章系统比较了各种定量方法: 标记策略: 深入讨论了 SILAC(稳定同位素标记的氨基酸追踪)、ICAT(同位素编码亲和标签)的原理、标记效率及在相对定量中的应用。 非标记策略: 详细分析了 Label-Free 定量技术,包括基于峰面积/强度积分和基于肽段计数的方法。 靶向定量: 重点介绍了 SRM/MRM(选择性反应监测/多反应监测)和 PRM(平行反应监测)在验证生物标志物和高精度绝对定量中的优越性。 第四部分:蛋白质组学的数据分析与生物信息学整合 本部分关注如何将海量的质谱原始数据转化为具有生物学意义的知识。 第九章:蛋白质组学数据的质量控制与处理流程 本章强调了数据预处理的重要性,包括原始谱图文件的转换、噪声过滤、基线校正和峰值检测。详细介绍了如何对鉴定结果进行统计学验证,如错误发现率(FDR)的控制,确保结果的可靠性。 第十章:生物信息学工具与网络分析 本章深入探讨了常用的蛋白质鉴定软件(如MaxQuant, Proteome Discoverer)的参数设置与结果解读。更进一步,本书侧重于生物学解释:如何对差异表达的蛋白质进行功能富集分析(GO, KEGG)、通路分析,并利用网络拓扑学工具来识别关键调控节点,构建和可视化蛋白质相互作用网络。 第五部分:应用领域与未来展望 本书的最后一部分将视角投向了蛋白质组学在实际研究中的广泛应用及其未来的发展方向。 第十一章:临床蛋白质组学与生物标志物发现 本章集中探讨了蛋白质组学在疾病诊断、预后判断和治疗监测中的实际应用案例。详细介绍了液体活检中血浆蛋白质组的分析挑战,以及如何应用多组学整合方法来提高生物标志物的灵敏度和特异性。 第十二章:蛋白质组学技术的前沿发展 展望未来,本章讨论了正在兴起和有望成熟的关键技术,包括单细胞蛋白质组学(Single-Cell Proteomics)以解析细胞异质性、空间蛋白质组学(Spatial Proteomics)对组织微环境的解析,以及人工智能(AI)在蛋白质结构预测和数据分析中的融合应用。 目标读者: 本书是结构化学习蛋白质组学原理和掌握前沿实验技术的理想教材和参考手册。无论是希望建立全新蛋白质组学平台的研究室主任,还是需要掌握特定定量方法的博士后研究员,都能从中获益匪浅。本书的结构清晰,图表丰富,为读者提供了一个坚实且全面的知识体系。

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