係統生物學導論 pdf epub mobi txt 電子書下載 2024

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U.阿隆(Uri Alon)

化學工業齣版社

王翼飛

2010年04月

257 页

79.00元

平裝

9787122070258

圖書標籤: 生物學係統生物學復雜係統生物科學認知科學湧現經濟學

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发表于2024-11-22

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圖書描述

《係統生物學導論:生物迴路的設計原理》首次對係統生物學研究工作的核心和細節進行深入闡述，為直觀理解生物學中一般原理建立瞭基礎。全書內容編排體現瞭下列特色：對網絡模體等新的理論研究成果做瞭細緻深入的闡述，指齣瞭係統生物學的核心內容和實踐方法；闡明瞭轉錄調控、信號轉導、發育網絡中的基本迴路；

檢測瞭魯棒性原理；

清晰地說明瞭如何用進化優化來理解最優迴路設計；

仔細考慮瞭動力學校正和其他機製是如何使生物信息處理中的誤差減到最少的；

包括瞭習題、問題的解答以及關於背景材料的附錄。

《係統生物學導論:生物迴路的設計原理》對於初涉係統生物學研究的讀者理解和領會這門學科的內涵會有很大幫助，可以作為係統生物學研究的熱門參考書，更可作為相關學科的高年級本科和研究生教材

序言

很高興《係統生物學導論——生物迴路的設計原理》中譯本跟大傢見麵瞭。

係統生物學(Systems Biologyr)是一門誕生不久又急速成長的交叉學科，它涵蓋瞭生物學、物理學、數學、計算機科學和係統科學等學科的核心知識，是一門知識高度集成、在理論和應用兩方麵都具有重要意義的新興學科。雖然距2000年11月在日本東京召開的第一次係統生物學國際會議還不到10年，但係統生物學的研究卻以難以想象的速度在我國得到重視和開展。中國科學院和許多高校均相繼成立瞭係統生物學研究機構。係統生物學幾乎成瞭最熱門的科技詞匯之一。但是，係統生物學研究到底如何開展，如何實踐，國內外都還是處於探索階段。2001年，Hiroaki Kitano(北野宏明)齣版瞭“FoLmdations of Systems Biology”(係統生物學基礎)一書(此書中譯本已於2007年齣版)，這是係統生物學領域的第一本專著。此書雖對係統生物學做瞭較全麵的基礎性介紹，但大部分內容僅停留於宏觀的描述，對研究工作的細節和核心部分都沒有作深入的展開。這也正反映齣當時係統生物學還處於萌芽狀態，其全貌一時還無法精細地刻畫。但這是一個急速發展的領域，近年來相關的書籍紛紛麵世，這些著作都以特定的視角介紹係統生物學。

2007年以色列魏茨曼研究所的Uri Alon(尤拉·阿隆)依據他的團隊的科研實踐撰寫瞭“An Introduction To systeros Biology”(係統生物學導論)，則為係統生物學研究的實踐提供瞭一本非常有用的指南書。作者依據自己的科研實踐對相關的知識做瞭精心的梳理和選擇，特彆是對新的理論研究成果，如網絡模體等，更是做瞭細緻深入的闡述，指齣瞭係統生物學研究的核心內容和實踐方法。全書層次清晰，重點突齣，內容自成一體，讀者通過本書的學習，即可進入係統生物學的研究前沿。加之作者又為全書添加瞭相應的習題，這對初涉係統生物學研究的讀者理解和領會係統生物學的內涵將會有極大的幫助。因此，本書不僅可作為係統生物學研究的入門參考書，更可作為相關學科大學高年級學生和研究生的教材。

上海大學數學係生物信息學實驗室的研究生彭新俊、周文、劉祥、瀋稱意、李馮、馮鐵男、閻正樓、張玉濱、孟煒、張亮生、劉煥、王飛飛、趙潔苑、呂玉龍、瀋青鬆、江浩、王晶、高鬆、龔雲路、茅嘉、秦殿剛、薛曉怡、林閤同、金鼎立、李建華、王群群等參加瞭本書的研討和翻譯，全書最後由王翼飛統稿並校訂。

中國科學院上海生命科學院的丁達夫、李亦學、趙慕鈞研究員，李載平院士，上海大學數學係史定華教授，上海師範大學郭本瑜教授，以及化學工業齣版社的編輯等對本書的翻譯齣版都給予瞭熱情的支持和鼓勵，並提供瞭寶貴的意見，在此一並緻謝。

文摘

插圖：

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當我第一次閱讀生物學教科書時，好似在看一本驚險讀物，它的每一頁都會帶來新的震驚。作為一名物理學傢，我習慣於研究那些遵循精確數學法則的事物，然而細胞是一類不斷變化著的物體，其結構自發地組裝，以執行精細的生物化學功能，並且在功能實現後能夠容易地分解。生物分子在編碼及執行信息時幾乎不會齣現差錯，盡管它們事實上是處於很強的熱噪聲下，而且被包埋在濃厚的分子湯中。這是如何做到的?是否在這些生物係統中存在一些能夠幫助我們理解生命物質與非生命物質之問區彆的特殊的自然法則?

我們渴望知道自然法則以及簡化的原理，然而生物學是如此的復雜以緻難以實現。每個生物化學相互作用都是異常地精確，而且細胞中存在著包含成韆上萬個這種相互作用的網絡。此類網絡是進化的結果，而進化則是通過産生隨機變化、並選擇能夠生存下來的有機體來實現的。因此從某種意義上講，進化得到的結構依賴於曆史上的偶然性，同時也滿載著在每種情形中都需要特彆說明的生物化學細節。

盡管存在這樣的復雜性，科學傢們也已經在試圖辨明那些貫穿於整個生物學史的一般化原理。對於這類原理的探索正在進行之中，而且還遠遠沒有完成。然而，隨著生物學實驗技術的進步，通過實驗手段已可以獲得關於生物學意義上相互作用網絡的詳細的、可以理解的信息，從而使得這樣的研究成為可能。

事實上，隨著此類研究的開展，我們將會發現一些可應用於生物網絡的一般規律。生物網絡在進化中齣現是為瞭實現各種功能，所以生物迴路並非是隨機或偶然形成的。它具有確定的形態，係統的這種形態必須實現功能。盡管進化是通過隨機調整來起作用的，但是通過一次次的進化它將收斂到一個確定的迴路元件的集閤，這種集閤遵循一般的設計原理。

本書的目的是突齣生物係統的一些設計原理，同時提供一個數學框架，使得在這個數學框架中，這些原理可用來理解生物網絡。重要的信息是，生物係統包含著固有的簡單性(simpIicity)。雖然細胞的進化是為瞭實現功能，而不是為瞭便於理解，但是簡化的原理卻使得生物學設計更易於為人們所理解。

本書的讀者需要有一定的數學基礎。為瞭闡述一些重要的原理，書中雖然給齣瞭幾個已經有較好研究的生物係統的詳細描述，但我們還是避免使用專業術語和基因名。本書展現瞭一條以數學原理為基礎的學習係統生物學的途徑，其中很少強調實驗技術。書中的一些示例都是作者非常熟悉的。在每章結尾處列齣的資源以及本書最後給齣的擴展讀物中可以找到其他的指導說明。

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用戶評價

評分☆☆☆☆☆

個人感覺全書體現著較濃的數學建模思想對生物體內的轉錄網絡進行模塊化分析以探究整體的調控過程整個調控過程的重要參數包括各個調控因子（強化或阻抑）的調控速率，活性，響應時間像電路一樣對輸入輸齣的完整時間序列作函數圖定量分析全書主乾內容分為以下三個部分前饋環（FFL）時間控製序列（Sim）多輸入邏輯決策器（Dor）係統魯棒性主要來源於係統負反饋，包括：目標差異積分反饋（如趨化性受體甲基化）自增強降解動力學校正（如免疫係統）設計最優化迴路：即通過定義適應度函數衡量進化，並利用經濟學中成本-收益模型進行分析

評分☆☆☆☆☆

一本刷新瞭我對於生命的認知的一本書，雖然書中隻談toy model, 但是看到生命現象能用如此簡潔的數學模型來描述的時候帶來的那種對世界觀的衝擊感是很美妙的。

評分☆☆☆☆☆

淘到此書不容易，感謝萬能的某寶。這本書視角獨特，內容豐富，值得深入閱讀。

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