Plant Genomics and Proteomics pdf epub mobi txt 电子书下载 2026

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出版者:Wiley-Liss

作者:Christopher A. Cullis

出品人:

页数:296

译者:

出版时间:2009-05-04

价格:USD 99.95

装帧:Hardcover

isbn号码:9780470191798

丛书系列:

图书标签:

植物基因组学
植物蛋白质组学
基因组学
蛋白质组学
植物生物技术
分子生物学
生物信息学
植物科学
基因表达
功能基因组学

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具体描述

The greatly expanded second edition of Plant Genomics and Proteomics offers a concise, highly readable, and integrative account of the complex relationships between the genome, proteome, and transcriptome of plants. Chapters focus on concrete, readily applicable topics, and include functional and structural genomics addressed within the context of current techniques in plant biology, and how to use DNA and protein sequence data. Numerous examples from the latest research and applications highlight the vast amount of data that have amassed for plant genetic sequence, array, and proteomics, and these are enhanced by a review of applications for biotechnology, including genetic modification and defense against pathogens. The book's powerful focus on plant biology allows particular attention to issues such as polyploidy, not relevant to the study of other organisms, as well as an emphasis on problems specific to plants such as symbiosis, stress, and disease responses.* Greatly expanded new edition, now a third longer with significant new coverage* Coverage of the latest research topics, including the maize genome project* Frequent and prominent plant genetics and genomics examples throughout the text, completely updated for the new edition* Concise presentation with specific examples to illustrate topics for greatest accessibility* Includes discussions of the very latest research and understanding Plant Genomics and Proteomics, Second Edition is an invaluable reference work for students in plant molecular biology, agricultural and food sciences, plant, food, and crop bioengineering. It is also of interest for plant molecular biology laboratories, especially in the developing countries, and international institutes that include training programs. Praise for the first edition: "...this valuable book with its introductory descriptions of new developments in plant genomics can be recommended to scientists, lecturers, and person who are not very familiar with plant genomics..." JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY "...the author does an admirable job of summarizing a large and growing field." YALE JOURNAL OF BIOLOGY AND MEDICINE

深入探索植物生物学的前沿领域：从基因组到蛋白质组的系统性解析本书名称：《植物基因组学与蛋白质组学：跨越物种的分子图谱构建》目标读者：本科高年级及研究生、植物生物学研究人员、分子生物学家、生物信息学专家、农业科学工作者。核心内容概述：本书旨在为读者提供一个全面且深入的视角，用以理解当前植物科学中最具活力和变革性的两个核心领域——基因组学（Genomics）和蛋白质组学（Proteomics）——如何协同作用，共同揭示植物生命活动的复杂机制。本书内容聚焦于作物进化遗传学、极端环境适应性分子机制、次生代谢产物调控网络以及先进的组学数据整合与可视化方法，完全规避了对“Plant Genomics and Proteomics”这一特定书名的直接提及和内容涵盖。 --- 第一部分：植物基因组学进阶：结构、变异与功能注释本部分侧重于植物基因组研究的最新进展，特别是复杂基因组的解析策略和海量数据的解读。第一章：大型与重复序列基因组的组装挑战与策略本章深入探讨了许多重要作物（如小麦、玉米）所面临的庞大、高度重复和多倍体化的基因组组装难题。我们将详细介绍新一代测序技术（如PacBio HiFi和ONT长读长技术）如何克服传统短读长组装的局限性，实现从Scaffold到Chr-level乃至完整染色体级别的基因组构建。重点解析了基于Hi-C和光学图谱技术的染色体级别组装流程，以及如何有效地从巨大的重复序列中锚定和区分同源基因组片段。第二章：结构变异与适应性进化的分子基础基因组变异是植物适应环境、驱动驯化和育种改良的根本动力。本章超越了传统的SNP（单核苷酸多态性）分析，聚焦于大型结构变异（SVs），包括插入/缺失、拷贝数变异（CNVs）和倒位。我们将探讨如何利用深度测序数据和比较基因组学方法来鉴定影响关键农艺性状（如抗旱性、光合效率）的SVs。此外，还涵盖了转座子（Transposable Elements, TEs）在重塑基因组结构和调节基因表达中的动态作用，以及它们对物种间差异的贡献。第三章：转录组动态学与非编码RNA的调控网络虽然基因组提供了“蓝图”，但转录组揭示了细胞在特定时间点的活性状态。本章探讨了高质量的RNA测序（包括单细胞转录组scRNA-seq）在绘制不同组织、发育阶段及应激条件下的基因表达图谱中的应用。重点讨论了长非编码RNA（lncRNAs）和环状RNA（circRNAs）如何作为重要的表观遗传调控因子，精细地调控基因的转录和翻译过程，尤其是在逆境信号传导通路中的作用。 --- 第二部分：蛋白质组学前沿：结构、相互作用与定量分析本部分将重点放在蛋白质这一生命活动的核心执行者上，介绍用于深度解析蛋白质群体及其功能状态的先进技术和分析方法。第四章：从代谢物到蛋白质：靶向与非靶向蛋白质组学本章详细阐述了蛋白质组学的两大主流技术路线：非靶向全局分析和靶向定量分析。我们将详细介绍基于高分辨率质谱（如Orbitrap平台）的肽段鉴定和相对/绝对定量策略，包括iTRAQ、TMT标记技术在复杂生物样品比较中的应用。同时，探讨了针对特定功能蛋白家族或信号通路的靶向方法（如PRM/SRM），如何实现高精度、高灵敏度的目标蛋白监测。第五章：蛋白质翻译后修饰（PTMs）的深度解析蛋白质的功能实现高度依赖于其翻译后修饰（PTMs），如磷酸化、泛素化、乙酰化和糖基化。本章专注于这些“分子开关”的研究方法。我们将介绍如何通过亲和富集技术（如使用特定抗体或金属离子配体）来分离和鉴定低丰度的修饰肽段。特别是，对磷酸化位点进行高通量筛查，如何帮助我们重建关键信号转导通路（如激素响应、免疫激活）的动态网络。第六章：蛋白质相互作用组学与结构生物学的整合理解蛋白质如何协同工作是揭示生命过程的关键。本章介绍了构建蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPIs）的技术，包括酵母双杂交（Y2H）、亲和纯化-质谱（AP-MS）以及基于交联剂的新型成像技术。此外，我们探讨了如何将蛋白质组学数据与冷冻电镜（Cryo-EM）等结构解析技术相结合，不仅知道哪些蛋白质相互作用，更要了解它们在三维空间中如何结合，以精确预测复合体的功能状态。 --- 第三部分：系统整合：从分子图谱到生物学意义本部分强调基因组学与蛋白质组学数据如何集成，以提供对植物生命系统更全面的认识。第七章：多组学数据集成与生物信息学建模现代植物研究的核心挑战在于处理和整合来自基因组、转录组、蛋白质组和代谢组的海量异构数据。本章详细介绍了用于数据整合的统计模型和机器学习方法（如网络分析、贝叶斯模型）。我们将关注如何构建跨尺度的调控网络，例如从DNA甲基化到特定蛋白表达的链路分析，以识别在环境胁迫下最关键的“控制节点”。第八章：极端环境适应的分子系统解析本章以具体的生物学案例为导向，展示组学技术如何剖析植物应对非生物胁迫（如盐碱胁迫、高温、干旱）的复杂机制。通过比较耐逆品种与敏感品种的基因组差异、胁迫下转录本和蛋白质组的动态变化，我们将识别出核心的耐逆通路，并探索这些通路如何通过基因表达的重新编程和蛋白质活性的精确调控来实现生存。第九章：次生代谢产物的调控与生物合成途径的重构植物次生代谢产物（如生物碱、萜类、黄酮类）对植物防御、授粉和人类健康至关重要。本章将阐述如何利用基因组信息（定位合成酶基因）与蛋白质组学（鉴定活性酶）相结合，来全面解析和重构特定的次生代谢途径。重点讨论利用代谢流分析和系统生物学模型，指导基因编辑和代谢工程，以期提高目标化合物的产量或改变其结构。 --- 结语：本书强调的系统生物学方法论，提供了一套强大的工具箱，使研究人员能够从宏观到微观的层次上解析植物复杂的生命现象。通过对组学数据的深入挖掘和跨学科方法的应用，我们正加速理解植物如何构建其分子图谱，并为面向未来的可持续农业和生物技术创新奠定坚实的科学基础。