生物统计学

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页数:289
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出版时间:1997-5
价格:32.00元
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isbn号码:9787030215734
丛书系列:
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  • 生物学
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具体描述

《普通高等教育"十一五"国家级规划教材:生物统计学(第4版)》系统地介绍了生物统计学的基本原理和方法,在简要叙述了生物统计学的概念、产生、发展和作用、生物学研究中试验资料的整理、特征数的计算、概率和概率分布、抽样分布基础上,着重介绍了平均数和频率的假设检验、X2检验、方差分析、直线回归与相关分析、可直线化的非线性回归分析、协方差分析、多元回归与多元相关分析、逐步回归、通径分析、多项式回归分析等,同时对抽样原理和方法、试验设计原理及对比设计、随机区组设计、裂区设计、正交设计等常用试验设计及其统计分析也进行详细叙述。

基因组学导论:从序列到功能 书籍简介 《基因组学导论:从序列到功能》是一部全面而深入的教材,旨在为生命科学、生物信息学、医学及相关领域的学生和研究人员提供一个坚实的基础,以理解现代基因组学的核心概念、技术和应用。本书不仅仅关注于DNA和RNA的物理结构,更侧重于如何利用先进的测序技术、计算分析方法,从海量的基因组数据中提取有意义的生物学信息,并最终将其转化为对生命过程的深刻理解。 本书的叙事逻辑清晰,从分子生物学的基石出发,逐步过渡到高通量的测序革命,再到复杂的生物信息学解读,最终聚焦于基因组学在疾病研究、进化生物学和精准医疗中的前沿应用。 --- 第一部分:基因组学的基石与测序的革命 本部分奠定了理解现代基因组学的理论基础,并详细介绍了驱动该领域飞速发展的核心技术——高通量测序(HTS)。 第一章:生命的蓝图:核酸结构与功能回顾 本章首先回顾了DNA和RNA的基本分子结构,包括碱基配对、双螺旋模型,以及染色质的组织方式(原核与真核)。重点阐述了基因的概念——不仅仅是编码蛋白的序列,还包括调控元件(启动子、增强子、沉默子)和非编码RNA的复杂调控网络。此外,探讨了基因组的组织复杂性,如重复序列、转座子对基因组动态变化的影响。 第二章:宏大叙事:从Sanger测序到下一代测序(NGS) 本章详细解析了测序技术的历史演变。首先,回顾了经典的Sanger测序法及其局限性。随后,重点深入探讨了新一代测序(NGS)技术的原理。这包括Illumina边合成边终止(Sequencing by Synthesis, SBS)技术的核心机制、离子半导体测序(如Ion Torrent)的化学原理,以及PacBio和Oxford Nanopore等长读长测序技术的优势与挑战。本章强调了不同测序平台在读长、准确性和通量上的权衡,为后续的数据分析打下基础。 第三章:文库构建与数据质量控制 成功的基因组学研究始于高质量的文库。本章详细讲解了用于不同实验目的的文库构建流程,包括全基因组测序(WGS)、全外显子组测序(WES)、RNA测序(RNA-Seq)以及表观遗传学测序(如ChIP-Seq和ATAC-Seq)所需的DNA/cDNA片段化、接头连接和富集策略。同时,本章设置了严格的数据质量控制(QC)标准,介绍使用FastQC等工具评估原始测序数据(FASTQ文件)的质量指标,如Phred分数、GC含量分布和污染检测。 --- 第二部分:计算生物学的核心流程 本部分是本书的计算核心,详细阐述了如何将海量的原始测序数据转化为可解释的生物学信息。 第四章:序列比对与组装:从碎片到完整图谱 本章是生物信息学分析的起点。首先,详细介绍了短读长数据(如Illumina数据)如何使用BWA、Bowtie2等工具高效地比对到参考基因组。随后,深入探讨了无参考基因组的De Novo组装策略,比较了基于重叠群(Overlap-Layout-Consensus, OLC)和基于图谱(De Bruijn Graph)组装方法的优劣,并介绍了SPAdes、Velvet等主流组装软件的应用。对于长读长数据,则侧重于其在跨越重复区域和解决结构变异方面的独特优势。 第五章:变异检测与注释:个体间的差异 基因组差异是理解物种多样性和疾病异质性的关键。本章系统讲解了体细胞和种系变异的检测流程。这包括单核苷酸多态性(SNP)和小的插入/缺失(Indel)的调用(使用GATK的最佳实践流程),以及结构变异(SV,如拷贝数变异CNV和倒位、易位)的识别方法。变异检测完成后,本章会详细介绍如何使用ANNOVAR、VEP等工具对变异进行功能性注释,包括预测其对蛋白序列的影响、基因组位置(外显子、内含子)以及预测其致病性评分。 第六章:转录组学:量化基因表达的动态世界 RNA测序(RNA-Seq)已成为研究基因表达的标准工具。本章专注于转录组数据的处理流程,包括从质量控制到计数和差异表达分析的完整管道。重点介绍了如何将RNA-Seq reads比对到基因组或转录本(使用STAR或HISAT2),以及如何使用DESeq2或edgeR进行统计学意义上的差异表达基因(DEG)筛选。此外,本章还涵盖了更高级的主题,如可变剪接(Splicing)分析、融合基因的检测以及lncRNA的鉴定。 --- 第三部分:基因组学的应用前沿 本部分将理论和计算方法应用于实际的生物学问题,展示基因组学在各个领域的核心价值。 第七章:功能基因组学:探究非编码区的调控奥秘 现代基因组学研究已不再局限于蛋白质编码区。本章深入探讨了表观遗传学技术(如ChIP-Seq用于定位蛋白质结合位点,ATAC-Seq用于开放染色质区域分析)。通过分析转录因子结合位点和染色质可及性数据,读者将学会如何整合多组学数据,构建基因调控网络,理解基因表达的细胞特异性和时序动态性。 第八章:群体基因组学与进化 群体基因组学利用大规模基因组数据来重建物种的历史、种群结构和选择压力。本章讲解了如何计算群体遗传学参数,如遗传多样性、核酸多样性(π)和选择系数($F_{ST}$)。重点讨论了群体分化、有效群体大小的估计,以及如何使用基因组扫描方法(如iHS, nSL)来识别过去物种适应环境所经历的选择性清除区域。 第九章:癌症基因组学与精准医疗 癌症基因组学是基因组学应用最活跃的领域之一。本章侧重于对体细胞突变数据的分析,包括如何区分驱动突变与乘客突变。详细介绍了癌症基因组学数据(如TCGA项目)的标准分析流程,包括突变负荷的评估、通路富集分析,以及如何将患者的基因组信息转化为临床决策,例如靶向药物的选择和预后评估。 第十章:宏基因组学:揭示微生物世界的全貌 宏基因组学(Metagenomics)旨在无需分离和培养微生物,直接对环境样本中的所有遗传物质进行研究。本章介绍了两种主要方法:靶向基因(如16S rRNA或ITS区域)分析和全基因组(Shotgun)测序。分析流程包括物种组成(Taxonomy Assignment)和功能潜力(Metabolic Pathway Reconstruction)的预测,展示了该技术在肠道菌群、土壤微生物生态学等领域的重要作用。 --- 结语:展望未来——单细胞与多组学整合 本书最后部分对基因组学领域的未来趋势进行了展望,特别强调了单细胞测序技术(scRNA-Seq, scATAC-Seq)如何克服传统Bulk测序的平均化效应,提供细胞异质性的分辨率。同时,探讨了基因组学与其他组学(蛋白质组学、代谢组学)数据整合的复杂性与巨大潜力,引导读者思考如何构建更全面的生物系统模型。 本书配有大量的图表、案例分析和实际数据练习(附带R/Python代码示例),确保读者不仅掌握理论知识,更能独立操作和解读真实世界的基因组学数据。

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读后感

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用户评价

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我带着一丝忐忑的心情打开了这本书,因为我对于统计学这个领域一直以来都有着一种近乎畏惧的距离感。那些纷繁复杂的公式、冗长的推导过程,常常让我望而却步。然而,当我的眼睛扫过书中的第一章,我被一种出乎意料的清晰所震撼。作者并非简单地堆砌概念,而是巧妙地将生物学的实际应用场景与统计学原理相结合,让抽象的理论变得生动而具体。我看到了一些关于样本选择的讨论,这让我联想到我曾经参与过的野外调查,当时对于样本量的考量,我只能凭经验估算,而这本书则提供了严谨的统计学方法来指导我如何做出更科学的决策。接着,书中对描述性统计的讲解,不仅仅是罗列均值、中位数、方差这些基本概念,而是深入分析了它们在不同生物学研究中的意义和局限性。例如,在分析物种多样性时,如何选择合适的指标来反映群落的丰富度和均匀度,这比简单的数数要深刻得多。我尤其欣赏作者在解释概率分布时所使用的图示,它们直观地展示了各种分布的形态,并进一步联系到生物学现象,比如基因频率的分布,这让我对偶然性和必然性之间的关系有了更深的理解。我曾经在阅读科学文献时,对其中涉及的统计术语感到困惑,但这本书的出现,仿佛为我点亮了一盏明灯,让我能够逐一破译那些隐藏在数字背后的科学真相,从而更自信地解读和评价生物学研究成果。

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这本书的排版设计,也为我的阅读体验加分不少。整体风格简洁大方,重点突出,不会让读者在大量的文字信息中感到疲惫。我注意到,书中在讲解公式时,会用不同的字体或者加粗来突出关键项,这使得我在抄写或者复习时,能够迅速找到需要关注的重点。而且,插图和图表的质量非常高,清晰美观,能够有效地辅助理解文字内容。例如,在讲解回归分析时,书中出现的散点图和回归线,不仅视觉上清晰,而且能够直观地展示变量之间的关系。我尤其欣赏作者在书中引入的一些“思考题”或者“课后练习”,它们能够帮助我巩固所学的知识,并引导我去思考更深层次的问题。这些练习题的难度适中,既不会让初学者感到 overwhelming,也不会过于简单而缺乏挑战性。我认为,一本好的教科书,应该在内容、语言和形式上都做到尽善尽美,而这本书在这几个方面都表现得相当出色,它让我觉得,学习生物统计学可以是一种享受。

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这本书的章节安排,给我留下了深刻的印象。它不是简单地按照统计学理论的顺序排列,而是紧密围绕着生物学研究的实际需求来展开。我注意到,书中有一个专门的章节讲解了生存分析。这让我眼前一亮,因为在医学研究中,生存分析的应用非常广泛,无论是药物疗效评估,还是疾病预后预测,都离不开它。作者通过对Kaplan-Meier曲线的讲解,以及对log-rank检验的介绍,让我明白了如何评估不同治疗组患者的生存时间和生存率。他甚至还提到了Cox比例风险模型,这让我看到了这本书的深度和前沿性。我曾经在阅读一些医学研究论文时,对其中的生存曲线图和相关统计结果感到困惑,这本书的出现,无疑为我解开了心中的谜团。此外,书中还穿插了一些关于实验设计的内容,比如随机对照试验(RCT)的设计原则,如何进行样本量估算以保证研究的统计效力。这些内容对于任何想要进行严谨生物学实验的人来说,都具有极高的参考价值。这本书的价值,在于它能够指导我们如何从问题的提出,到实验的设计,再到数据的分析和结果的解读,形成一个完整的科学研究闭环。

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这本书的封面设计着实吸引了我。深邃的蓝色背景,点缀着抽象的 DNA 螺旋和一些看似是统计图表的数据点,营造出一种既神秘又严谨的科学氛围。当我第一次在书店的架子上看到它时,我的目光就被牢牢吸引住了。它不像市面上那些动辄华丽插图、色彩斑斓的书籍,而是透着一股沉静的力量,仿佛里面蕴藏着宇宙的奥秘。我轻轻拿起它,书页的纸质触感温润而厚实,散发着淡淡的墨香,这是一种久违的、让人安心的气息。翻开扉页,一句简洁有力的引言,似乎在向我诉说着统计学在理解生命进程中的核心地位。我对生物学有着浓厚的兴趣,但常常在复杂的实验数据和概率模型面前感到力不从心。这本书的名字“生物统计学”,就如同在我心中播下了一颗希望的种子,让我期待着它能为我揭开生命科学的神秘面纱,让我能够更深入地理解那些隐藏在数字背后的生命规律。我想象着,通过这本书,我或许能学会如何解析基因组数据,理解流行病学的传播模式,甚至参与到疾病预测的研究中。这种对未知知识的渴求,让我毫不犹豫地将它带回了家。在未来的日子里,我相信这本书将成为我探索生命奥秘的得力助手,陪伴我走过一段充实而富有成效的学习旅程,让我能够以一种全新的、更具科学性的视角去审视和理解这个精彩纷呈的生物世界。

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这本书的案例研究部分,是我最为看重的。作者并非仅仅罗列公式和理论,而是通过一系列真实或模拟的生物学研究案例,将抽象的统计学原理融入到具体的问题解决过程中。我记得其中有一个案例,是关于如何利用统计学方法分析不同基因型对某种植物抗旱性的影响。作者首先引导读者思考,应该收集哪些数据,如何对这些数据进行预处理,然后逐步介绍如何使用方差分析和回归模型来检验基因型与抗旱性之间的关系。整个过程详尽而具体,让我能够跟随作者的思路,一步步地完成数据分析的全过程。我尤其欣赏作者在解释统计软件的使用时,虽然篇幅不多,但却能点到关键之处,让我能够理解这些工具是如何辅助我们进行更高效、更准确的数据分析的。这种“理论与实践相结合”的教学方式,是我在其他统计学书籍中很少看到的。它让我明白,学习生物统计学,最终是为了解决生物学问题,而不仅仅是为了掌握数学公式。这本书的案例研究,就像是一座座灯塔,照亮了我学习的道路,让我能够看到统计学在实际生物学研究中的强大力量。

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我带着一种学习新技能的期待,翻开了这本书。它像一扇窗户,让我窥见了生命世界背后隐藏的数学语言。我尤其关注书中关于贝叶斯统计的部分。在许多生物学研究中,我们往往需要从有限的数据中推断出未知的参数,而贝叶斯方法能够有效地整合先验信息和观测数据,从而得到更稳健的估计。作者以一种非常浅显易懂的方式,解释了先验分布、似然函数和后验分布的概念,并举例说明了它们在基因组学和流行病学研究中的实际应用。这让我意识到,统计学不仅仅是描述和推断,更是一种对不确定性进行建模和处理的强大工具。我曾经在阅读一些关于疾病传播模型的研究时,对其中涉及的贝叶斯方法感到非常好奇,这本书为我提供了一个宝贵的学习起点,让我能够逐步理解和掌握这些先进的统计技术。此外,书中还涉及了关于时间序列分析的内容,这对于分析生物信号,比如心电图、脑电图,或者生态系统中随时间变化的变量,都具有重要的意义。它让我看到了,生物统计学能够帮助我们揭示生命过程中的动态规律,而不仅仅是静态的特征。

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这本书的语言风格,给我留下了深刻的印象。它不像一些学术著作那样,充斥着晦涩难懂的专业术语和冗长的句子,而是以一种更加亲切、更加清晰的方式与读者进行交流。作者在解释一些复杂的统计概念时,善于使用生动的比喻和形象的类比,让抽象的理论变得触手可及。我记得在讲解中心极限定理时,作者用“大家一起抛硬币”的例子,形象地说明了为什么样本均值的分布会趋近于正态分布,这让我一下子就理解了其核心思想。这种“润物细无声”的教学方式,让我感到学习的过程是轻松而愉快的。而且,书中在关键的地方,会适当地插入一些“提示”或者“注意”的文字,提醒读者容易出错的地方,或者强调一些重要的概念,这使得我在阅读过程中能够更加集中注意力,避免遗漏重要的信息。我认为,一本好的教科书,不仅要传授知识,更要能够激发读者的学习兴趣,而这本书在这方面做得非常出色。它让我觉得,学习生物统计学并非一项枯燥的任务,而是一次充满探索和发现的智力冒险。

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这本书的深度和广度,远超我的预期。我原以为它会是一本侧重于基础统计方法的教材,但当我深入阅读后,我发现它触及了许多更高级、更前沿的统计学概念,并且将它们与生物学研究紧密结合。例如,在关于贝叶斯统计的章节中,作者用一种非常易于理解的方式解释了贝叶斯定理,以及它在生物学中的应用,比如在疾病诊断和基因组变异检测中的作用。这让我看到了生物统计学在处理不确定性和更新知识方面的独特优势。此外,书中还涉及了一些关于时间序列分析的内容,这对于理解生物体内的周期性变化,比如激素水平的波动,或者生态系统中的季节性变化,都具有重要的意义。作者在讲解这些复杂概念时,总是能够用生物学领域的具体例子来辅助说明,这极大地降低了理解的门槛。我曾经在阅读一些前沿的生物学研究论文时,对其中涉及的一些高级统计方法感到一头雾水,这本书的出现,为我提供了一个宝贵的学习平台,让我能够逐步掌握这些工具,从而更深入地理解和参与到最前沿的生物学研究中。

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当我翻到书中关于方差分析(ANOVA)的部分时,我感受到了作者在教学上的良苦用心。他并没有一开始就给出复杂的F检验公式,而是通过一个生动的例子,比如比较三种不同肥料对植物生长速度的影响,来引入方差分析的核心思想。通过图示,我清晰地看到了组间差异和组内差异的概念,以及如何通过比较这两个差异来判断肥料是否对植物生长有显著影响。这种“由表及里”的讲解方式,让我能够先建立起整体的认知,然后再深入到具体的计算和原理。我特别欣赏作者在解释多重比较问题时所做的细致说明。当我们在比较多个组别时,为什么直接进行多次t检验会增加犯第一类错误的概率,以及如何通过Bonferroni校正、Tukey’s HSD等方法来控制这个风险,这些内容对于避免得出错误的结论至关重要。这本书的语言风格也十分朴实易懂,没有过多的专业术语堆砌,即使是初学者,也能在作者的引导下,逐步理解这些复杂的统计概念。我认为,对于任何希望在生物学研究中提升数据分析能力的人来说,这本书都将是一笔宝贵的财富,它能帮助我们更严谨、更科学地解读和解释实验结果。

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这本书的价值,在于它不仅仅是一本枯燥的教科书,更像是一位循循善诱的导师,引领我一步步深入理解生物统计学的精髓。它让我明白,统计学并非仅仅是关于数字的计算,而是关于如何从数据中提取有价值的信息,如何做出合理的推断,以及如何量化不确定性。在阅读关于假设检验的部分时,我被作者的逻辑清晰所折服。他没有直接抛出那些令人费解的p值和显著性水平,而是先从一个实际的生物学问题出发,比如“某种药物是否能有效降低血压?”,然后层层剥茧,解释为什么我们需要设定零假设和备择假设,为什么我们需要控制第一类错误和第二类错误。这种以问题为导向的讲解方式,极大地激发了我学习的兴趣。更让我惊喜的是,书中对不同统计方法的应用场景做了详细的区分。例如,在讨论回归分析时,作者不仅介绍了线性回归,还提及了逻辑回归,并清晰地阐述了它们分别适用于预测连续变量和分类变量的生物学研究。这让我意识到,选择合适的统计模型是多么的关键,错误的建模方式可能会导致完全错误的结论。这本书的实用性体现在,它不仅教授理论,更教我如何“思考”,如何用统计学的语言去构建和验证生物学模型。

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很实在

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很实在

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《生物统计学》(科学出版社 李春喜)

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我好想是靠了这本河南师大的生统外加复印店里的试卷,过了生统考试。。。。。 天生不适合干这个,我不从测度论推起就不爽。

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比那本医学统计学好百倍

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