具体描述
《生物信息学基础》紧紧围绕基因组与后基因组研究，阐述生物信息学的方法、技术、资源及其核心算法，介绍各种信息学方法和技术在生物信息学中的应用。《生物信息学基础》首先简要说明生物信息学的研究对象及主要研究内容；然后介绍基本的序列比较算法，介绍各种生物信息学数据资源及主要数据库；接下来以专题形式介绍基因组信息分析、分子系统发生分析及蛋白质结构预测；最后，介绍基因表达数据分析。为了便于计算机和数学研究人员进入生物信息学研究领域，《生物信息学基础》还特别介绍了与生物信息学有关的基本分子生物学知识。生物信息学是一门新兴的交叉学科。在该领域中，由生物学家和计算机科学家共同研究生物分子信息的获取、管理、分析和利用。生物信息学以计算机、网络为工具，用数学和信息科学的理论、方法和技术去研究生物大分子，研究生物分子信息组织的规律。
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读后感
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用户评价
从一个完全没有接触过相关背景的非专业人士的角度来看，这本书的**逻辑连贯性**是其最大的优点之一。它成功地构建了一座从生命现象到数据科学的桥梁。开篇并没有急于抛出复杂的算法，而是耐心地从“生物学问题是什么”开始讲起，详细描述了DNA、RNA、蛋白质这些基本单元是如何产生需要被计算和分析的数据的。比如，当它介绍到序列比对时，它首先会用一个非常简单的例子——两个短字符串的匹配——来解释“错配惩罚”和“空位罚分”的概念，这种从最朴素的直觉出发的解释方式，让那些复杂的动态规划算法（如Needleman-Wunsch）变得不再那么高不可攀。每一次概念的引入，都紧密地联系着一个具体的生物学需求。这种紧密的“问题-方法-解决方案”的闭环结构，极大地增强了学习的内在驱动力，让人感觉每翻过一页，都在解决一个真实的科学难题。
评分这本书的深度和广度确实令人印象深刻，它横跨了分子生物学、统计学、计算机科学等多个领域，展现了一种跨学科的宏大视野。我尤其欣赏它对前沿研究的关注，例如在讨论下一代测序（NGS）数据分析时，书中不仅涵盖了经典的比对和组装算法，还专门辟出了一章来探讨单细胞测序数据处理中的批次效应校正问题。我感觉作者似乎一直走在行业的前沿，总能在理论阐述的适当位置，植入最新的技术动态和正在学术界热议的挑战。这使得这本书不仅仅是一本“基础”教材，更像是一张指向未来研究方向的导航图。不过，也正因为这种广博，有些高级主题的论述，比如贝叶斯方法在基因表达定量中的应用，篇幅相对较短，更像是点到为止的介绍。我猜想，这可能是为了保持全书的平衡性，但对于希望深入研究特定领域的读者来说，可能还需要查阅更专门的文献。
评分我花了一个多星期的时间来阅读这本书的“数据处理与可视化”部分，坦白说，起初我对这类偏重计算的章节有些畏惧，总担心会遇到晦涩难懂的算法描述。然而，作者的处理方式简直是教科书级别的典范。他们并没有直接堆砌复杂的数学公式，而是采用了一种“先应用，后原理”的叙事结构。比如，在介绍主成分分析（PCA）时，书中首先展示了一个用R语言实现的可视化案例，数据结果直接以彩色的散点图形式呈现出来，直观地展示了降维的效果。紧接着，作者才用相对精炼的语言去解释背后的特征值分解过程。这种先建立感性认识，再深入理性分析的路径，让我这个非计算机专业的读者也能游刃有余地跟上思路。尤其是书中穿插的那些“最佳实践”小贴士，比如如何优化大型数据集的内存使用，或者在Python中如何利用某个特定的库来加速矩阵运算，这些实操层面的建议，比纯理论的阐述更有价值，直接解决了我在实际项目操作中遇到的痛点。
评分这本书的装帧设计实在是一流，硬壳封面配上淡雅的米白色纸张，拿在手里沉甸甸的，让人立刻感受到它蕴含的知识分量。我特别喜欢扉页上那句引言，虽然我不是专业的生物学背景，但它那种对未知探索的激情一下子就抓住了我。内页的排版也做得非常考究，字号适中，行间距合理，即便是长时间阅读也不会感到眼睛疲劳。更值得称赞的是，书中那些复杂的流程图和结构示意图，绘制得极其清晰精准，那些复杂的分子路径，通过图示的引导，仿佛在我脑海中被逐一拆解和重构。我记得有一次为了理解一个基因调控网络，我反复对比了书中不同章节的图表，发现作者在不同层级上对同一概念进行了递进式的阐释，这种设计极大地降低了初学者的理解门槛。而且，书签的设计也很贴心，附带了一个磁吸式的书签条，每次翻开都能准确定位到上次阅读的地方，这种细节之处的人性化关怀，在学术专著中实属难得。整体而言，这本书在视觉和触觉上的体验，已经超越了一本教科书的范畴，更像是一件值得珍藏的艺术品。
评分我发现这本书在引用和参考文献的管理上做得相当严谨和专业，这一点对于严肃的学习者来说至关重要。书的末尾列出了一个非常详尽的参考书目和近期重要文献列表，这些引用不仅限于经典的生物信息学教科书，还包含了大量高引用的方法学论文。更贴心的是，在某些关键理论的介绍部分，作者会用脚注的形式，简要说明该方法首次被提出或被改进的关键文献出处。这对于我这种有“追根溯源”强迫症的读者来说，简直是太友好了，我可以直接根据脚注去查阅原始论文，从而获得更精确、更第一手的理论阐释。这种对知识来源的尊重和清晰的溯源机制，极大地提升了这本书的学术可信度和参考价值，确保了我们学习到的知识是基于最扎实的研究基础之上的，而不是空中楼阁般的理论构建。
评分是个好人。。。。反正矬人一个不追求绩点╮(╯_╰)╭
评分是个好人。。。。反正矬人一个不追求绩点╮(╯_╰)╭
评分同在读...希望孙啸真的是好人~
评分| Q811.4 /S98
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