Generation and Interpretation of Morphogen Gradients (Cold Spring Harbor Laboratory)

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出版者:Cold Spring Harbor Laboratory Press
作者:James Briscoe
出品人:
页数:900
译者:
出版时间:2010-03-22
价格:USD 135.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9780879698812
丛书系列:
图书标签:
  • Morphogen gradients
  • Developmental biology
  • Pattern formation
  • Cell signaling
  • Molecular biology
  • Embryogenesis
  • Computational modeling
  • Biochemistry
  • Genetics
  • Cold Spring Harbor Laboratory
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具体描述

Signalling by morphogens such as the Hedgehog family, Notch, Wingless/Wnt and various growth factors is essential during embryogenesis. The establishment of concentration gradients of these morphogens plays a key role during developmental patterning in all multicellular organisms, assuring that distinct cell/tissue types and organs appear at the right place in the right time during embryogenesis. Regulation of morphogen synthesis, trafficking and diffusion are all known to play a part in setting up these gradients, and a complex web of signaling mechanisms ensures that specific responses occur at the correct threshold concentration in the recipient cells whose fate depends on these morphogens.

《生命蓝图的雕刻者:形态发生素梯度的生成与解析》 在生命的宏伟画卷中,胚胎发育无疑是最令人着迷也最复杂的篇章之一。一个单细胞如何逐步演变成一个拥有精密结构、功能各异的复杂多细胞生物?这个过程中,信息的传递与解读扮演着至关重要的角色。而在这信息的传递网络中,形态发生素梯度(Morphogen Gradients) 则是最核心、最基础的信号系统之一,如同生命蓝图的雕刻者,精确地指导着细胞命运的决定和身体结构的形成。 本书《生命蓝图的雕刻者:形态发生素梯度的生成与解析》并非详述某本具体的著作,而是致力于深入探索形态发生素梯度这一生命科学领域的核心概念,从其生成机制到信号解读的生物学逻辑,为读者勾勒出一幅全面而细致的生命发育图景。我们将深入剖析形态发生素梯度在不同发育阶段、不同生物体中扮演的角色,揭示其背后的分子机制和进化意义,并探讨该领域前沿的研究方法与未来的发展方向。 第一章:形态发生素——生命的信使 在生命的起点,细胞的命运并非注定。它们需要感知环境、接收信号,并据此做出分化和迁移的决策。形态发生素,正是这场信息传递盛宴中的关键信使。它们是一类能够扩散的分子,在其浓度梯度中携带空间信息。不同浓度的形态发生素能够激活或抑制细胞内的特定信号通路,从而诱导细胞产生不同的形态、分化为不同的细胞类型,最终构建出精密的身体结构。 本章将首先界定形态发生素的概念,区分它们与其他细胞信号分子的差异。我们将深入探讨形态发生素的分类,包括其化学性质(如蛋白质、小分子等)以及它们在发育过程中的主要功能。从早期胚胎发育的极性建立,到肢体、器官的形成,形态发生素的身影无处不在。我们还将审视形态发生素的发现历程,回顾那些奠定这一概念基石的经典实验,例如著名的“模式形成”理论,以及揭示特定形态发生素(如Hedgehog、Wnt、BMPs、Retinoic Acid等)功能的早期研究。理解形态发生素的基本属性是深入探讨其生成与解析机制的前提。 第二章:梯度之源——形态发生素的生成机制 形态发生素梯度的形成并非偶然,而是由一系列精密调控的生物学过程所驱动。形态发生素的产生、分泌、扩散以及降解,共同塑造了其在空间上的浓度分布。本章将聚焦形态发生素梯度的“生成”过程,深入解析其背后的分子机制。 我们将详细阐述形态发生素的合成与分泌过程。形态发生素的表达受到严格的转录和翻译调控,确保其在特定的细胞群中、在特定的发育时间窗口内产生。分泌机制,例如通过囊泡运输或直接分泌到细胞外空间,对于形态发生素的扩散至关重要。 随后,我们将重点解析形态发生素的扩散机制。形态发生素在细胞外基质中扩散,其速度受到多种因素的影响,包括分子的理化性质、细胞外环境的黏度、以及是否存在专门的转运蛋白。我们将探讨“自由扩散”模型,以及在某些情况下,形态发生素可能通过与细胞表面受体或细胞外基质成分的结合,实现“受限扩散”或“定向运输”,从而形成更精确的梯度。 此外,形态发生素的降解同样是梯度形成的关键环节。特定的蛋白酶或降解信号通路能够有效地清除细胞外形态发生素,从而限制其扩散范围,并维持梯度的动态平衡。本章将介绍主要的形态发生素降解途径,以及它们如何协同作用,共同精确地绘制出形态发生素梯度的空间轮廓。我们还将探讨一些特殊的形态发生素生成模式,例如“分布式生成”和“聚焦式生成”,以及它们在不同发育情境下的优势。 第三章:梯度之义——细胞如何解读形态发生素信号 形态发生素梯度的存在是为了传递信息,而信息的载体便是构成生物体的细胞。细胞如何感知并响应形态发生素的浓度差异,从而执行精确的细胞行为,是形态发生素梯度研究的核心议题。本章将深入解析形态发生素信号的“解析”过程,即细胞如何解读形态发生素梯度。 我们首先将详细介绍形态发生素的细胞表面受体。每一种形态发生素通常对应着一种或多种特异性的受体蛋白,它们能够结合形态发生素,并将信号传递到细胞内部。我们将讨论不同类型的形态发生素受体,例如G蛋白偶联受体、酪氨酸激酶受体、以及离子通道型受体,并分析它们如何将外部信号转化为细胞内的生化事件。 接下来,我们将聚焦于下游信号转导通路。一旦形态发生素与其受体结合,便会激活一系列复杂的细胞内信号网络。这些信号通路往往是级联放大式的,能够将微弱的初始信号转化为显著的细胞响应。我们将深入探讨几种经典的形态发生素信号通路,例如SMAD通路(介导BMPs信号)、β-catenin/TCF通路(介导Wnt信号)、以及Hedgehog信号通路等。我们将分析这些通路中的关键分子、它们之间的相互作用,以及它们如何调控基因表达。 本章的一个重要环节是解释“细胞如何区分不同的浓度”。形态发生素梯度之所以能产生多样的细胞响应,在于细胞能够根据形态发生素的浓度高低,激活不同的下游基因集合。我们将探讨几种主要的模型: 阈值模型(Threshold Model): 不同的细胞响应对应于形态发生素浓度的不同阈值。当形态发生素浓度达到某个阈值时,特定的基因被激活;当达到更高的阈值时,另一组基因被激活。 比例模型(Proportional Model): 细胞响应与形态发生素浓度呈比例关系。随着形态发生素浓度的增加,某个下游信号的激活程度也随之增加,进而影响基因表达。 整合模型(Integration Model): 细胞可能整合来自多种形态发生素的信号,或者整合同一形态发生素在不同时间、不同空间的信息,从而做出复杂的决策。 我们将通过具体的发育实例,如神经管的发育、肢体芽的形成等,来阐释这些模型如何指导细胞分化、迁移和形态发生。 第四章:梯度在发育中的多重角色 形态发生素梯度并非孤立存在,它们在胚胎发育的各个阶段,以各种复杂的方式协同作用,共同塑造生命的形态。本章将从宏观视角审视形态发生素梯度在不同发育过程中的多重角色。 我们将首先探讨形态发生素梯度在“模式形成”(Pattern Formation)中的核心作用。模式形成是指在胚胎中建立起前-后、背-腹、左右等空间轴的差异,并据此确定身体各个部分的身份。形态发生素梯度是实现这一目标的最直接机制,它们通过精确控制各个区域细胞的命运,来构建出完整的身体蓝图。 随后,我们将关注形态发生素梯度在“形态发生”(Morphogenesis)中的作用。形态发生是指细胞的分化、迁移、增殖以及细胞间的相互作用,最终形成器官和组织的复杂三维结构。形态发生素梯度不仅指导细胞分化,还能影响细胞的迁移方向、黏附能力以及彼此之间的通信,从而驱动着结构的形成和重塑。 本章还将探讨形态发生素梯度在“细胞命运决定”中的关键作用。在发育早期,细胞往往具有很大的可塑性。形态发生素的存在,通过激活不同的基因程序,能够将未分化的细胞引导至特定的细胞谱系,例如神经元、肌肉细胞、上皮细胞等。 此外,我们还将讨论形态发生素梯度在“再生的生物学”中的潜在作用。尽管再生能力在不同生物体和不同组织中差异很大,但许多再生过程仍然依赖于形态发生素梯度的建立和解读,以指导损伤组织的修复和结构的重建。 第五章:研究形态发生素梯度的前沿方法与挑战 理解形态发生素梯度需要强大的研究工具和创新的实验设计。本章将介绍当前研究形态发生素梯度的主要方法学,并探讨该领域面临的挑战和未来的研究方向。 我们将详细介绍用于检测形态发生素及其梯度的技术,包括: 免疫组织化学(Immunohistochemistry)和免疫荧光(Immunofluorescence): 利用特异性抗体标记形态发生素,可视化其在组织中的空间分布。 原位杂交(In Situ Hybridization): 检测形态发生素 mRNA 的表达模式,推断其产生的位置。 报告基因系统(Reporter Gene Systems): 引入能够响应特定形态发生素信号的报告基因,间接反映梯度的强度。 荧光寿命成像(Fluorescence Lifetime Imaging)和单分子成像(Single-molecule Imaging): 实现对形态发生素分子在活细胞或组织中的实时追踪,研究其动力学过程。 除了可视化技术,我们还将讨论用于操纵形态发生素生成和解读的研究方法: 基因工程技术(Genetic Engineering): 通过基因敲除、敲低或过表达,研究特定形态发生素或其信号通路的关键基因功能。 化学遗传学(Chemogenetics)和光遗传学(Optogenetics): 利用小分子或光照,精确调控形态发生素的活性或信号通路的开启。 体外模型系统(In Vitro Model Systems): 例如细胞培养、类器官(Organoids)和微流控芯片(Microfluidic Chips),提供可控的环境来研究形态发生素梯度。 本章还将讨论当前研究形态发生素梯度所面临的挑战: 动态性与复杂性: 形态发生素梯度是高度动态的,并且在不同的发育阶段和不同的生物体中表现出极大的多样性,如何捕捉和解析这种复杂性是巨大的挑战。 多形态发生素的协同作用: 在真实的生物发育过程中,多种形态发生素常常协同作用,如何理解和解析这种复杂的信号网络是关键。 从基因到表型的转化: 如何将形态发生素梯度信息最终转化为细胞行为和组织形态,仍然是未解之谜。 最后,我们将展望形态发生素梯度研究的未来方向,包括利用人工智能和计算生物学来模拟和预测梯度行为,以及探索形态发生素梯度在疾病发生发展中的作用,为疾病的诊断和治疗提供新的思路。 《生命蓝图的雕刻者:形态发生素梯度的生成与解析》将通过深入浅出的讲解,结合最新的研究进展和经典的生物学案例,带领读者一步步揭开形态发生素梯度这一生命奥秘的神秘面纱,领略生命发育的精巧与神奇。本书旨在为生命科学研究者、学生以及对生命现象充满好奇的读者,提供一个全面、深入且富有启发性的学习平台。

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