Statistical Methods for Environmental Epidemiology with R

Statistical Methods for Environmental Epidemiology with R pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Springer
作者:Roger D. Peng
出品人:
页数:156
译者:
出版时间:2008-7-25
价格:GBP 55.99
装帧:Paperback
isbn号码:9780387781662
丛书系列:
图书标签:
  • R
  • 英文原版
  • 流行病
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具体描述

The number of studies of air pollution and various health outcomes has increased dramatically in recent years. Basic aspects of analyzing and understanding air pollution and health data are covered as well as an overview of the different approaches to statistical modeling.

环境流行病学统计方法与 R 语言实践 书籍概述 本书旨在为读者提供一套全面、严谨且实用的统计方法框架,以应对环境中致病因素对人类健康影响的研究。本书将深入探讨环境流行病学研究中常用的统计模型、分析技术以及数据处理方法,并重点强调如何运用强大的 R 语言工具来高效地实现这些分析。我们力求在理论深度与实践操作之间取得平衡,帮助读者不仅理解统计方法的原理,更能熟练地将其应用于真实世界的数据分析,从而在环境保护、公共卫生以及风险评估等领域做出有价值的贡献。 内容亮点与特色 本书的内容设计兼顾了统计学理论的严谨性和流行病学研究的实际需求。我们将从基础的统计概念出发,逐步深入到环境流行病学特有的复杂问题。 1. 环境流行病学基础与研究设计: 引言:我们将首先介绍环境流行病学的核心概念,包括环境暴露、健康结局、以及暴露-反应关系。我们会探讨环境因素的多样性(如空气污染、水污染、土壤污染物、电磁辐射、噪声等)以及它们对不同健康问题(如呼吸系统疾病、心血管疾病、癌症、神经系统疾病、生殖健康等)的影响。 流行病学研究设计:本书将详细阐述适用于环境流行病学研究的各种设计,包括横断面研究、病例对照研究、队列研究、生态学研究以及时间序列研究。对于每种设计,我们将深入分析其优缺点、适用场景、以及在研究设计中需要考虑的关键因素,如样本量估算、偏倚控制、混杂因素的处理等。我们将强调如何根据研究问题和可用数据选择最恰当的研究设计。 2. 数据管理与预处理: 数据来源与获取:我们将介绍环境流行病学研究中常见的数据来源,例如环境监测站数据、地理信息系统(GIS)数据、居民健康调查数据、电子病历数据、甚至是通过传感器收集的个人暴露数据。 数据清洗与转换:在 R 语言环境下,我们将详细讲解如何进行数据清洗,包括处理缺失值(如均值/中位数填充、回归插补、多重插补)、异常值检测与处理、数据格式转换、以及变量编码等。 空间数据处理:环境流行病学研究常常涉及空间信息。本书将介绍如何使用 R 语言中的 `sf`、`sp` 等包处理地理空间数据,包括数据读取、投影转换、空间连接、缓冲区分析、以及栅格数据处理等。我们将展示如何将环境暴露数据与个体或区域健康数据进行空间匹配。 时间序列数据处理:对于时间序列研究,我们将讲解如何处理时间戳数据、日期/时间函数的使用、时间序列数据的重采样、以及识别和处理时间序列数据中的趋势和季节性。 3. 核心统计模型与分析技术: 描述性统计与可视化:在 R 语言中,我们将展示如何利用 `dplyr`、`ggplot2` 等包进行描述性统计量的计算和可视化,包括均值、中位数、方差、百分位数、以及绘制直方图、箱线图、散点图、时间序列图、地图等,以初步探索数据特征和暴露-健康关系。 线性回归模型:作为基础模型,我们将详细讲解线性回归在环境流行病学中的应用,例如评估单一环境暴露变量对连续性健康指标(如肺功能指标)的影响。我们将讨论模型假设的检验、系数的解释、以及模型诊断。 逻辑回归模型:对于二分类的健康结局(如患病/未患病),我们将深入讲解逻辑回归模型。本书将重点关注如何解释回归系数(如优势比,OR),以及如何处理分类暴露变量和连续暴露变量。 泊松回归与负二项回归:当健康结局是计数数据(如疾病发生次数、死亡人数)时,泊松回归和负二项回归是更合适的选择。我们将讲解这两种模型的原理、应用场景,以及如何处理数据中的过度离散现象。 广义线性模型(GLMs):我们将统一介绍广义线性模型框架,包括其组成部分(均值函数、连接函数、概率分布),并展示如何利用 R 语言的 `glm()` 函数实现上述各种回归模型,以及如何理解模型输出。 混合效应模型(Generalized Linear Mixed Models, GLMMs):在环境流行病学研究中,数据常常具有层级结构(如个体嵌套在家庭中,家庭嵌套在社区中)或重复测量(如同一地区不同时间点的数据)。我们将深入探讨混合效应模型(包括线性混合模型和广义线性混合模型),以正确处理这些相关性,避免低估标准误。我们将介绍如何使用 R 语言的 `lme4`、`nlme` 等包构建和解释混合效应模型。 地理加权回归(Geographically Weighted Regression, GWR):环境暴露与健康效应的关系可能在空间上是不均匀的。本书将介绍地理加权回归,一种能够捕捉局部空间异质性的模型,并演示如何使用 R 语言中的相关包进行 GWR 分析。 时间序列分析:对于时间序列研究,我们将介绍 ARIMA 模型、滞后相关分析、以及用于评估环境因素对疾病时间序列影响的特定模型(如动态回归模型)。我们将讲解如何识别时间序列数据中的自相关性,并将其纳入模型。 暴露-反应函数(Dose-Response Functions):我们将探讨如何从数据中估计暴露-反应关系,包括线性、非线性以及阈值模型。我们将展示如何在 R 语言中拟合和可视化这些函数。 4. 高级主题与扩展应用: 混杂因素控制与中介分析:我们将详细讨论在环境流行病学研究中如何识别、度量和控制混杂因素(如年龄、性别、吸烟史、社会经济地位等),包括分层分析、多变量回归、倾向性评分匹配等方法。此外,我们还将初步介绍中介分析,以探索环境暴露如何通过某些生物标志物或行为方式影响健康。 效应修饰分析:本书将探讨如何检验环境暴露的效果是否因其他因素(如遗传背景、个体敏感性、合并疾病)而异,即效应修饰。 多污染物的协同与拮抗作用:现实世界中,人群常常同时暴露于多种污染物。我们将介绍如何利用多变量模型(如多元回归、结构方程模型)来评估不同污染物之间的相互作用(协同或拮抗)对健康的影响。 环境暴露评估模型的构建与应用:我们将介绍如何利用 GIS、遥感、模型模拟等技术构建更精确的环境暴露评估模型,并将其整合到流行病学分析中。 健康影响评估(Health Impact Assessment, HIA):我们将介绍 HIA 的基本框架和方法,展示如何利用已建立的暴露-反应关系和人群暴露数据来预测环境变化或政策干预可能带来的健康效益或风险。 机器学习在环境流行病学中的应用:我们将初步介绍一些适用于环境流行病学研究的机器学习算法,如随机森林、支持向量机、以及它们在预测健康风险、识别重要暴露因素等方面的潜力。 5. R 语言实践与代码示例: tidyverse 生态系统:我们将充分利用 `tidyverse`(包括 `dplyr`、`tidyr`、`ggplot2` 等)强大的数据处理和可视化能力,提供简洁、高效的代码。 模型拟合与诊断:我们将演示如何使用 R 语言内置函数(如 `lm()`, `glm()`)以及专门的统计包(如 `lme4`, `nlme`, `mgcv`)来拟合各种模型。本书将重点讲解如何对模型进行充分诊断,包括残差分析、拟合优度检验、以及诊断是否存在多重共线性等问题。 可视化输出:我们将指导读者如何利用 `ggplot2` 等工具创建高质量的图表,以清晰地展示数据特征、模型结果以及暴露-反应关系,使研究结论更具说服力。 可复现性研究:我们将强调使用 R Markdown 等工具创建可复现的研究报告,使分析过程透明且易于验证。 目标读者 本书的目标读者群体广泛,包括但不限于: 环境流行病学研究者:希望系统学习和掌握环境流行病学研究中关键统计方法的学者。 公共卫生专业人士:从事环境健康监测、风险评估、政策制定等工作的专业人员。 统计学与生物统计学学生:对环境流行病学应用统计学感兴趣的研究生。 环境科学与工程领域的研究者:需要了解环境因素如何影响人类健康,并希望运用统计学工具进行分析的科学家。 数据科学家:希望将统计分析技能应用于环境健康领域的数据分析师。 学习路径建议 建议读者在阅读本书时,能够同步进行 R 语言的实践操作。本书提供了丰富的代码示例,读者可以通过复制代码、修改参数、处理自己的数据集来加深理解。对于统计学基础相对薄弱的读者,建议先回顾基本的统计推断概念。对于 R 语言不熟悉的读者,建议先学习 R 语言的基础语法和常用数据结构。 总结 本书力求成为一本兼具理论深度和实践指导意义的参考书,通过 R 语言这一强大的工具,帮助读者克服环境流行病学研究中遇到的统计挑战,从而更好地理解环境与健康之间的复杂关系,为制定有效的公共卫生政策和环境保护策略提供坚实的科学依据。我们相信,掌握本书介绍的统计方法和 R 语言技能,将极大地提升您在环境流行病学研究领域的分析能力和学术产出。

作者简介

目录信息

Contents
1. Studies of Air Pollution and Health
2. Introduction to R and Air Pollution and Health Data
3. Reproducible Research Tools
4. Statistical Issues in Estimating the Health Effects of Spatial–Temporal Environmental Exposures
5. Exploratory Data Analyses
6. Statistical Models
7. Pooling Risks Across Locations and Quantifying Spatial Heterogeneity
8. A Reproducible Seasonal Analysis of Particulate Matter and Mortality in the United States
· · · · · · (收起)

读后感

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用户评价

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这本书的叙事风格非常独特,它不像传统教科书那样平铺直叙,反而更像是一系列精心策划的案例研究的集合。通过阅读这些案例,我仿佛置身于一个真实的研究团队中,共同面对数据清洗、变量转换和结果解释的挑战。我尤其欣赏它在讨论因果推断方法时的审慎态度。环境流行病学经常面临混杂和选择偏倚的巨大挑战,这本书似乎没有简单地提供“万能公式”,而是强调了研究设计和方法选择背后的哲学思考。它引导读者去思考:这个统计模型背后的生物学假设是什么?我们能从这个关联中推断出因果关系吗?这种对方法论根基的追问,使我对统计结果的解读多了一层批判性的审视。这种深层次的反思,远比单纯学习一个公式更有价值,它塑造了研究者严谨的思维习惯。

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阅读这本书的过程,更像是一次严谨的学术训练。它似乎没有打算取悦初学者,而是直击高级研究人员的痛点——如何从看似杂乱的环境暴露数据中提取出稳健、可信的因果推断。我注意到书中对模型选择和诊断的探讨非常细致。这不仅仅是关于拟合一个模型,而是关于如何证明这个模型是“对的”或者“足够好”的。我特别关注了它如何处理多重共线性和模型稳健性测试的部分。在环境流行病学中,污染物之间常常存在高度相关性,选择正确的模型结构来区分不同污染源的独立效应是一个核心难题。我希望看到书中对敏感性分析的详尽阐述,比如使用Bootstrap或Jackknife方法来评估估计值的稳定性。如果这本书能清晰地阐述不同统计假设下的模型局限性,并提供应对策略,那么它无疑就超越了一般的教材水平,达到了方法论专著的深度。

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我对这本书中关于高级空间统计和时间尺度分析的章节抱有极高的期待。环境暴露的本质是时空依赖的,任何忽视这种依赖性的统计方法都可能导致错误的推断。我希望看到它如何优雅地整合地理信息系统(GIS)数据和流行病学数据,例如使用地理加权回归(GWR)或更复杂的区域建模技术来捕捉暴露效应的空间异质性。此外,对于短期效应和长期效应的区分,书中的处理方式也至关重要。是使用两阶段模型,还是采用更精细的滞后分析?我期望书中能够提供一个清晰的框架,指导读者根据研究问题选择最合适的时间尺度处理方法,并辅以实际的数据实例来展示这些高级模型的输出和解释,尤其是如何将这些复杂的统计输出转化为清晰、有说服力的公共卫生建议。

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拿到这本书后,我立刻翻阅了目录,被其对R语言应用的强调所吸引。在现代环境流行病学研究中,R已经成为不可或缺的计算平台。我希望这本书能做到的是,不仅仅是告诉我们“用什么方法”,更重要的是“如何在R中实现它”。我期待看到大量、贴近实际的R代码示例,这些示例最好是可直接复制、运行并修改的,能够真实反映处理真实环境流行病学数据集时的挑战。例如,如何使用特定的R包(如`mgcv`或`INLA`)来拟合非线性效应或进行贝叶斯空间建模,这对于提高研究的精确度和可重复性至关重要。如果这本书只是泛泛而谈R的优势,而没有提供具体的、经过充分验证的代码片段,那么它的实用价值就会大打折扣。我更看重的是那种“手把手”的教学方式,让读者能够直接将学到的技术应用到自己的项目中去,而不是仅仅停留在理论理解层面。

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初次接触这本关于统计方法在环境流行病学中应用的著作时,我脑海中浮现的是一系列关于数据处理和复杂模型构建的画面。这本书的厚度本身就暗示了内容的深度和广度,它显然不是一本入门级的读物,更像是一本为那些已经对流行病学基本概念有所了解,但迫切需要掌握高级统计工具的实践者准备的工具箱。我特别期待它能详尽地介绍如何将现实世界中复杂的环境暴露数据(比如长期空气污染暴露、水质变化等)与健康结局关联起来。市面上很多书籍往往停留在理论层面,或者仅仅展示一些标准的回归分析。我希望看到的是,这本书能真正深入到如何处理时间序列数据、空间自相关性,以及如何构建能够有效应对混杂因素和测量误差的复杂统计模型。特别是针对纵向研究设计(如队列研究)中处理重复测量数据的统计策略,我希望能从中找到清晰、可操作的指南,而不仅仅是晦涩的公式堆砌。

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As good as it gets.

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模型讲的比较多,具体的分析都放在Reproducibility Package里面了

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As good as it gets.

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As good as it gets.

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As good as it gets.

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