Multiple Comparison Procedures

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出版者:Wiley
作者:Yosef Hochberg
出品人:
页数:480
译者:
出版时间:2009-12-2
价格:USD 97.00
装帧:Paperback
isbn号码:9780470568330
丛书系列:
图书标签:
  • 统计学
  • 多重比较
  • 假设检验
  • 实验设计
  • 数据分析
  • 生物统计
  • 医学统计
  • R语言
  • SAS
  • Python
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具体描述

Offering a balanced, up-to-date view of multiple comparison procedures, this book refutes the belief held by some statisticians that such procedures have no place in data analysis. With equal emphasis on theory and applications, it establishes the advantages of multiple comparison techniques in reducing error rates and in ensuring the validity of statistical inferences. Provides detailed descriptions of the derivation and implementation of a variety of procedures, paying particular attention to classical approaches and confidence estimation procedures. Also discusses the benefits and drawbacks of other methods. Numerous examples and tables for implementing procedures are included, making this work both practical and informative.

探寻统计推断的细微之处:多重检验的艺术与实践 在现代科学研究的浩瀚星辰中,统计推断扮演着至关重要的角色,它为我们理解数据、得出结论提供了严谨的框架。然而,当研究者同时检验多个假设时,一个棘手的挑战便悄然浮现:多重比较问题。即便在零假设(null hypothesis)为真的情况下,随着检验数量的增加,至少出现一个假阳性(false positive,即错误地拒绝了真实为零的零假设)的概率也会急剧上升。这就像是在一片茫茫大海中寻找一个特定的宝藏,你搜寻的区域越大,偶然发现并非宝藏的“假宝藏”的几率也就越高。 《多重比较程序》(Multiple Comparison Procedures)一书,并非简单罗列各种统计方法,而是深入剖析了多重比较问题的本质,揭示了其在科研实践中的普遍性和潜在的陷阱。它为读者提供了一套系统性的工具箱,用以识别、理解和规避由多重检验带来的误差。本书的写作目标清晰而明确:赋能研究者以更严谨、更可靠的方式进行统计推断,确保研究结论的科学性和可信度。 核心概念的深度解析 本书开篇即直击多重比较问题的核心——第一类错误(Type I error),即假阳性。它将这个概念与整体错误率(overall error rate)紧密联系起来,强调了在进行多项检验时,我们真正关注的是所有检验中出现至少一个第一类错误的概率,而非单个检验的显著性水平(alpha)。这与传统单次检验的思路截然不同,本书通过详实的数据模拟和案例分析,让读者深刻体会到在多重检验情境下,如果依旧沿用单次检验的alpha值,其累积效应将导致一个非常高的假阳性率,可能使得绝大多数“显著”的结果都只是巧合。 接着,本书系统性地介绍了不同的整体错误率度量标准。读者将接触到: 族错误率 (Family-Wise Error Rate, FWER):这是最直观也最严格的度量标准,它关注的是在所有进行的检验中,至少出现一个第一类错误的概率。本书详细讲解了如何控制FWER,例如经典的Bonferroni校正,并深入分析了其保守性,即在控制FWER的同时,可能会显著降低检验的统计功效(power),增加第二类错误(Type II error,即未能拒绝错误的零假设)的风险。 错误发现率 (False Discovery Rate, FDR):相较于FWER,FDR提供了一种更为灵活和务实的控制方式,它关注的是在所有被判定为“显著”的检验中,有多少是真正的假阳性。本书将FDR置于重要的位置,认为在探索性研究或需要同时检验大量假设的情况下,FDR控制往往是更恰当的选择。读者将学习到Benjamini-Hochberg (BH) 方法以及其变种,理解FDR控制的原理,以及它如何在保持一定统计功效的同时,有效降低假阳性。 本书不仅仅是介绍概念,更侧重于各种多重比较程序的具体算法和适用场景。读者将系统地学习以下重要的多重比较方法: 基于FWER的方法: Bonferroni校正:作为最古老也是最简单的FWER控制方法,它通过将单个检验的显著性水平除以总检验次数来达到目的。本书会详细阐述其计算方法,并通过实例展示其严格性,同时也会指出其缺点,例如过于保守,尤其是在检验数量庞大时。 Holm-Bonferroni方法(Holm's method):作为Bonferroni方法的改进,Holm方法通过排序p值并进行逐步调整,在保证FWER控制的同时,相较于Bonferroni校正提高了统计功效。本书会清晰地解析其多步决策过程。 Sidak校正:与Bonferroni类似,但基于独立检验的假设,有时会比Bonferroni更不保守。本书会比较Sidak与Bonferroni的异同。 Dunnett's test:特别适用于只有一个对照组,而有多个实验组的情况,用于比较每个实验组与对照组的差异,同时控制FWER。 Tukey's Honestly Significant Difference (HSD):用于事后多重比较(post-hoc multiple comparisons),特别适用于单因素方差分析(ANOVA)后,当发现整体存在显著差异时,用于比较所有组间对。本书会深入解释其原理,以及如何在ANOVA框架下应用。 Scheffé's method:一种非常保守的方法,适用于更广泛的线性对比,同样用于事后多重比较,但其功效较低,通常不被优先推荐。 基于FDR的方法: Benjamini-Hochberg (BH) 方法:这是FDR控制的经典方法,本书会详细介绍其算法步骤,并通过清晰的图示和例子说明如何根据排序的p值来确定拒绝域。 Benjamini-Yekutieli (BY) 方法:这是BH方法的扩展,适用于检验之间存在任意相关性的情况,虽然更稳健,但相对更保守。本书会分析BY方法在何种情境下是必需的。 Storey's q-value:本书还会介绍q-value的概念,它提供了对每个p值而言,如果将其视为“发现”,其期望的FDR水平。这是一种更细致的FDR度量方式,允许研究者在不设定固定阈值的情况下,理解每个“发现”的可靠性。 理论与实践的完美结合 本书的另一大亮点在于,它并非停留在理论层面,而是将抽象的统计概念与实际的科研应用紧密结合。本书通过大量来自不同领域的真实案例,例如基因组学、神经科学、临床试验、社会科学等,展示了多重比较问题在不同学科中的具体体现。这些案例不仅仅是简单的应用演示,更包含了对研究设计、数据分析流程以及多重比较方法选择的深入讨论。 例如,在分析高通量基因表达数据时,研究者可能同时检测数万个基因的表达差异。此时,不加控制的多重检验将导致绝大多数“显著”的基因都可能是假阳性。本书将引导读者如何选择合适的FDR控制方法,从而识别出真正具有生物学意义的差异基因。在医学领域,临床试验中可能需要比较多种治疗方案的效果,本书会解析如何选择恰当的多重比较方法来控制试验的整体风险。 本书还特别强调了选择合适多重比较方法的原则。它不会简单地给出一个“万能公式”,而是引导读者根据以下关键因素进行决策: 研究的目的:是探索性研究,意图发现潜在的信号,还是验证性研究,旨在确认先前的发现? 研究的类型:是成组设计,还是单个个体多次测量? 假设之间的关系:是相互独立的,还是存在依赖性? 可接受的风险水平:愿意承担多大的假阳性(第一类错误)或假阴性(第二类错误)的风险? 统计功效的需求:在控制误差的同时,需要多大的能力去发现真实存在的效应? 此外,本书还会探讨多重比较中其他重要的相关主题: 事后分析(Post-hoc analysis):在ANOVA等分析中,当整体检验显著时,进行事后多重比较以确定具体哪些组别之间存在差异。 重复测量数据(Repeated measures data):在同一被试接受多次测量的情况下,如何处理由于测量之间存在相关性而导致的多重比较问题。 贝叶斯统计方法(Bayesian statistical methods):在贝叶斯框架下,多重比较问题是如何被处理的,以及其与传统频率派方法的区别。 图形化展示(Graphical displays):如何通过可视化手段来帮助理解多重比较结果,例如使用p值直方图或矩阵图来展示检验结果。 统计软件的应用:本书将指导读者如何使用主流的统计软件(如R、SAS、SPSS等)来实现各种多重比较程序,提供实际操作的便利。 超越程序,理解原理 《多重比较程序》一书的价值远不止于提供一套操作手册。它致力于让读者深刻理解各种多重比较程序的统计学原理。通过清晰的数学推导和逻辑解释,读者将能够理解为何这些方法能够控制特定的错误率,以及它们之间的内在联系和权衡。这种深入的理解,使得研究者在面对新的、未曾接触过的问题时,能够灵活地选择和调整方法,而不是机械地套用模板。 本书也关注多重比较方法选择的局限性和潜在的误解。例如,它会讨论在某些情况下,过于严格地控制FWER可能会导致研究者错过重要的发现。反之,过于宽松地控制FDR也可能增加研究结果的可信度风险。通过对这些权衡的细致分析,本书鼓励读者形成一种批判性的思维,认识到统计推断的本质是一种权衡和决策过程。 总而言之,《多重比较程序》是一部全面、深入且极具实践指导意义的著作。它不仅为统计学研究者提供了丰富的工具,更为其他学科的研究者提供了一套严谨的统计思维框架。通过阅读本书,读者将能够更自信、更准确地在海量数据中挖掘出真正有价值的科学发现,避免被偶然性所误导,从而提升研究的科学性和可信度。这本书将成为任何希望在现代复杂数据分析领域做出严谨贡献的研究者的必备参考。

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