《植物蛋白質組學》全書共十四章，其中第一至第七章主要介紹蛋白質組概念、産生背景、重要性和蛋白質組學關鍵技術（包括雙嚮電泳、高效液相色譜、蛋白芯片、生物質譜、定量蛋白質組學技術、蛋白質與蛋白質相互作用和蛋白質組學相關數據庫）；第八至第十三章主要介紹蛋白質組學技術在植物生物學研究中的應用及研究進展，研究內容涉及植物遺傳多樣性、植物發育（包括種子發育）、植物逆境（包括生物逆境和非生物逆境）和蛋白標記與PQL；第十四章主要介紹雙嚮電泳和質譜技術操作指南及相關說明，便於初學者瞭解雙嚮電泳技術和質譜技術的一般操作程序。另外，《植物蛋白質組學》增加瞭附錄，包括雙嚮電泳完整的操作步驟、聚丙烯酰胺凝膠電泳凝膠的配置、細胞樣品的一般處理步驟、組織樣品的一般處理步驟及蛋白質和蛋白質組相關數據庫，主要供負責具體操作的實驗人員參考。《植物蛋白質組學》適用於大專院校農林及生物學專業的師生和相關科研院所的科技人員。
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