Modeling Methodology for Physiology and Medicine (Academic Press Biomedical Engineering Series)

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出版者:Academic Press
作者:Ewart Carson
出品人:
页数:512
译者:
出版时间:2000-10
价格:USD 122.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9780121602451
丛书系列:
图书标签:
  • 生理建模
  • 医学建模
  • 生物医学工程
  • 系统生物学
  • 数学建模
  • 计算生物学
  • 生物力学
  • 医学工程
  • 模型方法学
  • 生物医学
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具体描述

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Modelling Methodology for Physiology and Medicine offers a unique approach and an unprecedented range of coverage of the state-of-the-art, advanced modelling methodology that is widely applicable to physiology and medicine. The book opens with a clear and integrated treatment of advanced methodology for developing mathematical models of physiology and medical systems. Readers are then shown how to apply this methodology beneficially to real-world problems in physiology and medicine, such as circulation and respiration.

* Builds upon and enhances the readers existing knowledge of modelling methodology and practice * Editors are internationally renowned leaders in their respective fields

《生物医学建模方法学》 引言: 在科学探索的疆域中,理解生命系统的复杂性一直是人类智慧的不懈追求。从微观的细胞信号传导到宏观的生理器官功能,生命过程本身就是一部精密而动态的“机器”。随着科技的进步,我们不再仅仅依赖观察和实验来揭示这些奥秘,而是开始构建能够模拟、预测和分析这些生命过程的数学和计算模型。《生物医学建模方法学》正是这样一本旨在系统介绍和深入探讨构建生物医学模型核心原理、技术和应用的著作。本书并非针对某一特定疾病或生理系统的详尽解析,而是聚焦于“如何”构建和验证这些模型,为研究者提供一套通用的、强大的工具和思维框架,以应对生物医学领域日益增长的复杂数据和问题。 核心内容概述: 本书的核心在于其对“建模方法学”的全面梳理。它深入浅出地讲解了从模型构建的初步构思到最终验证和应用的全过程,涵盖了从基础理论到实践操作的方方面面。 模型分类与选择: 作者首先会引导读者认识到生物医学模型的多样性。例如,根据模型描述的尺度,可以有分子动力学模型、细胞模型、组织模型、器官模型乃至全身生理模型;根据模型的性质,又可以分为确定性模型(如微分方程模型)和随机性模型(如马尔可夫链模型);根据模型的目的,则有描述性模型、预测性模型和解释性模型。本书会详细阐述不同模型类型的优缺点,以及在特定研究问题下如何进行恰当的模型选择。例如,在研究药物在体内的代谢过程时,一个描述浓度随时间变化的药代动力学模型可能比一个详细描述细胞内信号通路的模型更为合适。 数学与计算基础: 建模离不开数学语言和计算工具。本书将深入讲解构建模型所需的数学工具,例如微积分、线性代数、概率论和统计学在描述动态系统、分析数据以及进行不确定性量化中的作用。对于常微分方程(ODE)和偏微分方程(PDE)在描述连续性过程中的应用,以及离散事件模拟和Agent-based modeling(ABM)在模拟离散单元交互中的原理,都会进行详尽的阐释。此外,本书还将介绍常用的数值计算方法(如欧拉法、龙格-库塔法)以及它们在求解模型方程中的意义和局限性。 数据驱动建模: 在现代生物医学研究中,海量的高通量数据(如基因组学、蛋白质组学、影像学数据)为模型构建提供了前所未有的机遇。本书将专门探讨如何利用这些数据来参数化、校准和验证模型。这包括各种参数估计技术,如最小二乘法、最大似然估计,以及更复杂的贝叶斯推断方法。模型辨识(model identification)和模型选择(model selection)等关键概念也会被深入讨论,以确保模型不仅能描述已知数据,还能具有良好的泛化能力。 模型验证与不确定性分析: 构建模型只是第一步,验证其有效性并理解模型的局限性至关重要。本书会详细介绍各种模型验证策略,包括与实验数据的比较、敏感性分析(sensitivity analysis)以识别关键参数,以及交叉验证(cross-validation)等技术。更重要的是,本书将强调不确定性量化(uncertainty quantification)的重要性。生命系统本身存在内在的随机性和测量误差,模型参数和结构的不确定性都会影响模型的预测精度。本书将介绍如何量化这些不确定性,并将其传播到模型的输出中,从而为模型的应用提供更可靠的置信度。 建模软件与计算平台: 理论知识需要与实际操作相结合。本书会介绍当前生物医学建模领域常用的软件工具和计算平台,例如MATLAB/Simulink、Python(及其科学计算库如NumPy, SciPy, Pandas, Scikit-learn)、R、COMSOL Multiphysics等。对于不同类型模型的实现,书中会提供相应的编程示例和算法思路,帮助读者将抽象的模型转化为可执行的代码。 模型在生物医学中的应用案例: 虽然本书不侧重于某一具体领域,但为了说明建模方法的普适性和强大威力,会穿插介绍不同生物医学领域建模的经典案例。这些案例将涵盖但不限于: 生理学建模: 如心血管系统的血流动力学模型、呼吸系统的气体交换模型、神经系统的信号传导模型等。 药理学与药代动力学/药效学(PK/PD)建模: 如何利用模型预测药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄过程,以及药物浓度与疗效之间的关系。 疾病模型: 例如,流行病学模型如何模拟传染病的传播,癌症发生发展的模型,以及代谢性疾病的生理模型。 免疫学模型: 模拟免疫细胞的相互作用和免疫应答过程。 成像与诊断模型: 利用模型来增强医学影像的解读能力或辅助疾病诊断。 适用读者: 本书的目标读者群体广泛,包括但不限于: 生物医学领域的博士后研究员和独立研究员: 希望掌握先进的建模工具来推进自己的研究项目。 研究生: 学习生物医学工程、计算生物学、生物物理学、药理学、生理学等专业的学生,需要为研究打下坚实的建模基础。 从事交叉学科研究的科学家: 需要跨越生物学、医学、数学、计算机科学等领域的研究者。 对生命系统建模感兴趣的工程师和数据科学家: 希望将他们的技能应用于生物医学领域。 本书价值: 《生物医学建模方法学》提供了一个系统而深入的视角,帮助读者掌握构建、验证和应用生物医学模型的核心能力。它不仅仅是一本技术手册,更是一本思维训练指南,培养读者用定量、系统化的方法来理解和解决复杂生物医学问题的能力。通过学习本书,读者将能够: 更有效地设计实验: 基于模型预测,优化实验方案,减少不必要的资源浪费。 深入理解生命过程: 通过模型模拟,揭示看不见的机制和相互作用。 开发新的诊断和治疗策略: 基于模型分析,探索个性化医疗和药物开发的可能。 加速生物医学研究的进展: 掌握强大的建模工具,为解决重大的健康挑战贡献力量。 总而言之,《生物医学建模方法学》是一本面向未来的著作,它将帮助读者驾驭生物医学数据和复杂性的浪潮,引领研究者走向更深层次的科学发现和更有效的临床应用。

作者简介

目录信息

读后感

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用户评价

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我得说,这本书在**跨学科融合**方面的努力是相当值得称赞的。在当今的生物医学研究中,越来越需要不同领域知识的交叉验证,而这本书恰恰抓住了这一点。它没有固守单一的学科壁垒,而是巧妙地将经典的物理学、化学反应动力学与现代的计算科学、统计学方法融为一体。印象最深的是其中关于**细胞信号通路建模**的那部分内容,它不仅展示了如何运用微分方程来描述生化反应的速率,还引入了诸如贝叶斯方法来处理不确定性,这在处理那些数据稀疏、机制复杂的生物系统中尤其关键。我过去常常为如何将实验室观测到的瞬时数据,平滑地嵌入到一个长期的、宏观的生理模型中而感到困扰,这本书提供了一种非常优雅的解决思路。更令人惊喜的是,它并未将这些复杂的数学工具束之高阁,而是通过大量贴近实际的案例来阐释如何应用这些工具。读这本书,就像是收到了一份来自资深专家的“项目实施指南”,告诉你每一步的逻辑基础是什么,每一步的计算陷阱在哪里。对于希望将理论模型应用于实际临床前研究的人来说,这本书的实用价值远远超出了其作为一本“教科书”的范畴。

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坦白讲,作为一名有着多年经验的生物工程师,我通常对市面上的新书持保留态度,总觉得它们大多是旧知识的重新包装。然而,这本著作却成功地刷新了我的看法。它的**方法论深度**让人叹服。书中对**计算效率和模型简化**的讨论,体现了作者对真实世界计算资源限制的深刻理解。例如,当面对一个包含数千个参数的高维模型时,如何进行敏感性分析,如何有效地进行参数空间探索,书中给出的启发性见解,远比我在以往期刊文献中看到的要系统和全面。作者强调的“模型可解释性”原则,也极其重要——一个准确但黑箱的模型,在临床决策支持方面往往作用有限。这本书详细阐述了如何通过模型结构的选择和参数的物理意义赋予,来确保模型的透明度和可信度。我特别欣赏它在**数值稳定性和算法选择**方面的对比分析,这直接关系到建模工作的成败。它不只是罗列公式,而是深入分析了为什么在某一特定生理情境下,显式欧拉法会失效,而隐式方法又是如何保证收敛的。这种对技术细节的精益求精,使得这本书成为了一本真正的“工程手册”,而非泛泛而谈的综述。

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这本新出的书简直是为那些在生物医学工程领域摸索前行的人准备的宝藏。我刚翻了几页,就被它那种系统而严谨的论述方式深深吸引住了。它并不是那种只停留在理论层面,空泛地谈论概念的教材。相反,作者似乎非常注重“如何做”——如何将复杂的生理系统转化为可操作、可量化的数学模型。特别是关于**动态系统建模**的那几章,讲解得极为透彻,它没有回避不同时间尺度下建模所面临的挑战,反而提供了多种应对策略,比如多尺度分析和降阶处理。对于初学者来说,它可能显得有些厚重,但对于有一定基础、希望提升建模技能的研究人员而言,这无疑是一本提升内功的绝佳参考。书中对**参数辨识与模型验证**的深入探讨,更是直击当前许多应用研究的痛点。许多模型建立起来后,如何证明它的可靠性与预测能力,往往是最大的难题。这本书给出了清晰的框架和步骤,读起来让人感觉手中突然多了一把精确测量和验证的标尺。总而言之,如果你想从“会画图”的初级建模者,蜕变为能构建并合理运用复杂生理模型的工程师,这本书的价值不言而喻。它的结构安排,从基础到进阶,环环相扣,读完后你对整个建模流程的认知将会有一个质的飞跃。

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我花了大量时间研究了书中关于**器官系统间相互作用的整合建模**那一章。这部分内容是当前生理建模领域的前沿和难点,因为它要求将不同尺度、不同机制的模型有效地耦合起来。这本书在这方面的贡献是突破性的。它不仅讨论了传统的松耦合或紧耦合策略,还引入了**基于信息流的集成框架**,这对于模拟全身药代动力学/药效学(PK/PD)或多器官衰竭模型尤其具有指导意义。作者在描述如何处理数据源异构性——例如,将高通量基因表达数据与低频的临床指标数据进行整合——时,展现了惊人的洞察力。他们提出的加权平均和贝叶斯层次模型,为解决实际项目中的“数据不匹配”问题提供了切实可行的路径。这本书的真正价值在于,它没有将这些高级技术视为孤立的数学工具,而是将它们**嵌入到解决具体的、具有生理意义的医学问题中**。阅读完这部分,我立刻能够反思自己当前项目中的集成策略,并看到了优化和改进的空间。对于致力于开发下一代精准医疗模拟平台的科研人员来说,这本书提供的理论深度和实践指导是无可替代的。

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从阅读体验的角度来看,这本书的编排逻辑非常清晰,它仿佛为读者设计了一条循序渐进的学习路径。如果说很多教材是知识点的堆砌,那么这本书更像是一部**精妙的“工具箱构建指南”**。开头部分对建模哲学和适用范围的界定非常到位,避免了读者在面对复杂系统时无从下手。随后,章节内容层层递进,从描述性的统计模型,逐步过渡到基于机制的因果模型。我特别喜欢它在介绍**生物物理学基础**时所采用的视角——它不是把这些作为独立的知识点来教,而是作为构建后续数学模型的“砖块”。这一点对于那些受过偏重计算训练、对生物学机制理解相对薄弱的读者来说,是极其宝贵的补充。书中对**非线性动力学在生理系统中的体现**的分析,也相当到位,它没有回避混沌和振荡等复杂现象,而是提供了一套成熟的工具来识别和分析这些现象的生理意义。这本书真正体现了“建模”的精髓:不是为了模型而模型,而是为了理解和预测生命现象背后的驱动力。

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