第一部分　R語言編程入門　1
第1章　R語言簡介：全景圖　3
認識到使用R語言的優勢　5
免費、開源代碼　5
可以在任何環境下運行　5
R語言支持擴展　5
擁有活躍的社區　5
和其他語言的連接　6
R語言的獨特之處　7
嚮量的多項計算　7
不僅僅是統計分析　8
無需編輯直接運行　8
第2章　探索R　9
使用代碼編輯器　10
探索RGui　11
用RStudio優化　13
開始第一個R會話　15
嚮世界說你好　15
使用嚮量　15
存儲和計算值　16
迴饋用戶　18
啓動一個腳本　18
響應你的工作　20
導航環境　21
操縱環境中的內容　21
保存你的工作　21
檢索你的工作　22
第3章　R基礎知識　23
充分利用函數的強大功能　23
嚮量函數　24
函數參數調用　25
創建曆史記錄　27
保持代碼的可讀性　27
遵循命名規則　28
組織代碼　30
添加注釋　32
R基礎功能的擴展　32
查找擴展包　32
安裝擴展包　33
加載和卸載擴展包　33
第二部分　開始使用R　35
第4章　算術入門　37
數值、無窮值與缺失值　37
基礎運算的操作　38
使用數學函數　40
計算整個嚮量　43
無窮及其以後　43
使用嚮量組織數據　45
探索嚮量屬性　45
創建嚮量　48
嚮量連接　48
重復嚮量　49
嚮量值的存取　49
理解R的索引　50
從嚮量中提取數值　50
修改嚮量的值　51
使用邏輯嚮量　52
值的比較　53
將邏輯嚮量作為索引　54
邏輯錶達式的組閤　55
邏輯嚮量小結　56
增強數學運算　56
使用嚮量的數學運算　57
參數循環　59
第5章　開始讀和寫　61
對文本數據使用字符嚮量　61
為字符嚮量賦值　62
創建包含多個元素的字符嚮量　62
獲取嚮量的子集　63
為嚮量中的值命名　64
文本操作　66
字符串理論：組閤和分割字符串　66
文本排序　69
查找文本中包含的內容　70
文本替換　72
使用正則錶達式　73
使用因子進行分類　76
創建因子　76
轉換因子　77
關注水平　79
區分數據類型　80
使用有序因子　81
第6章　使用R處理時間數據　83
處理日期　83
用不同的格式錶示日期　85
添加時間　86
日期和時間的格式　88
操作日期與時間　88
加法和減法　89
日期的比較　89
提取　90
第7章　高維數據的處理　93
添加第二個維度　93
探索新維度　94
將嚮量組閤成矩陣　97
使用索引　98
提取矩陣元素的值　98
降低維度　100
修改矩陣中的值　100
為矩陣行列命名　101
修改行和列的名稱　102
將名稱作為索引　103
矩陣的計算　103
矩陣的基本運算　103
行列求和　105
矩陣運算　105
添加更多維度　107
創建數組　107
使用維度來提取數據　108
在數據框組閤不同類型的值　109
由矩陣創建數據框　109
從零開始創建數據框　111
命名變量和規則　112
操縱數據框中的值　113
提取變量、觀察值和元素值　114
嚮數據框添加觀測值　115
嚮數據框添加變量　117
將不同類型的對象組閤到列錶中　118
創建列錶　119
提取列錶中的元素　120
修改列錶中的元素　122
理解列錶的str()輸齣結果　124
透過樹木看到森林　125
第三部分　編寫R代碼　127
第8章　探索函數的樂趣　129
從腳本到函數　129
編寫腳本　130
轉換腳本　130
使用函數　131
簡化代碼　133
巧妙地使用參數　134
添加更多的參數　135
點參數的魔力　136
將函數作為參數　137
處理作用域　140
穿越邊界　140
方法分配　142
隱藏函數背後的方法　142
實現自己的通用函數　144
第9章　控製邏輯流　146
使用“if”語句做齣判斷選擇　147
用“if．．．else”語句實現另一種選擇　149
判斷選擇的嚮量化　150
查看問題　150
基於邏輯嚮量進行判斷　151
多種選擇　152
嵌套“if ．．． else ”語句　153
用switch處理多種選擇　154
循環遍曆　155
構造一個“for”循環　155
通過“for”循環來進行計算　156
無循環的循環：認識“Apply”傢族函數　158
“apply”函數的傢族特徵　159
認識“apply”傢族中的三個成員　159
針對行和列使用apply函數　160
將函數應用於與列錶類似的對象上　162
第10章　調試代碼　165
知道要查找什麼　165
閱讀錯誤信息和警告信息　166
閱讀錯誤信息　166
注意警告信息（或者不）　167
查找漏洞　169
logit計算　169
瞭解錯誤的來源　169
查找函數內部　170
自定義消息　174
創建錯誤　174
創建警告　175
一些常見的錯誤　175
從錯誤的數據開始　176
格式錯誤的數據　176
第11章　取得幫助　180
在R幫助文檔中查找信息　180
當我們明確地知道到底查找什麼時　180
當我們不知道到底要查找什麼時　181
在互聯網上查找R幫助文檔　182
加入R社區　184
在Stack Overflow和Stack Exchange討論R　184
使用R郵件列錶　184
在Twitter討論R　185
實現最小可復現示例　185
用隨機數創建樣本數據　186
精簡代碼　187
提供必要的信息　187
第四部分　讓數據說話　189
第12章　導入和導齣數據　191
導入數據到R中　191
在R文本編輯器中錄入數據　192
使用剪貼闆復製和粘貼　193
從CSV文件中讀取數據　195
從Excel中讀取數據　198
處理其他數據類型　200
R中導齣數據　201
使用文件和文件夾　202
瞭解工作目錄　202
文件操作　204
第13章　操作和處理數據　207
確定最閤適的數據結構　207
創建數據子集　208
理解三種子集運算符　209
理解取子集的五種方式　209
提取數據框子集　210
在數據中添加計算域　214
數據框的列運算　214
使用with和within提高代碼的可讀性　215
對數據進行分組　216
組閤與閤並數據集　217
創建示例數據　218
使用“merge()”函數　220
使用查詢錶　221
數據排序　223
對嚮量進行排序　224
對數據框進行排序　224
使用“apply”函數遍曆數據　227
使用“apply()”函數匯總數組　228
使用“lapply()”和“sapply()”來遍曆列錶或數據框　229
使用“tapply()”創建錶格匯總數據　230
瞭解公式接口　232
規範數據的格式　234
理解數據的長格式和寬格式　234
初識reshape2包　235
將數據轉換為長格式　236
將數據重塑寬格式　237
第14章　數據匯總　240
從正確的數據開始　241
使用因子或數值　241
唯一值計數　242
準備數據　242
描述連續變量　243
討論數據的中心　243
描述變異性　244
計算分位數　244
描述分類　245
計數　246
計算比例　246
查找中心　247
描述分布　248
繪製直方圖　248
使用頻率和密度　249
描述多元變量　251
完整數據集的匯總　251
繪製子集的分位數　252
記錄相關性　254
使用錶格　257
創建雙嚮錶　257
將錶格轉換為數據框　258
邊際與比例　259
第15章　差異與關聯檢驗　261
仔細研究分布　262
觀察海狸　262
正態分布的圖形檢驗　262
使用分位圖　263
使用公式法檢驗正態性　265
比較兩個樣本　267
差異檢驗　267
比較成對數據　269
檢驗頻數和比例　270
檢驗比例　270
錶格分析　271
提取檢驗結果　273
使用模型　273
方差分析　274
計算差異　276
綫性關係建模　278
綫性模型評估　280
預測新值　282
第五部分　繪製圖形　285
第16章　使用基本圖型　287
創建不同類型的數據圖　287
數據圖概覽　287
嚮數據圖添加點和綫　288
各種類型的數據圖　292
控製數據圖選項和參數　294
添加標題和坐標軸標簽　294
修改數據圖選項　295
在單頁中繪製多個數據圖　298
將數據圖保存成圖片文件　299
第17章　使用lattice繪製切片圖　301
創建lattice數據圖　302
加載lattice包　303
製作lattice散點圖　303
添加趨勢綫　304
修改數據圖的選項　306
添加標題和標簽　306
修改標題和標簽的字號　307
使用主題修改數據圖選項　308
繪製不同類型的數據圖　309
繪製柱狀圖　309
繪製箱型圖　310
繪製分組數據　311
使用高格式數據　311
繪製分組數據　313
添加圖例　313
輸齣和保存lattice數據圖　314
將lattice圖賦予一個對象　315
在腳本中輸齣lattice數據圖　315
將lattice數據圖保存成文件　315
第18章　學習ggplot2製圖　317
安裝並加載ggplot2　317
認識層　318
使用geom和stat　319
定義數據　319
從數據映射到可視元素　320
獲得geom　321
瞭解stat　324
添加切片、標尺和選項　326
添加切片　326
修改選項　327
獲取更多信息　329
第六部分　20條有用建議　331
第19章　10種用R不用Excel的情況　333
添加行和列的總和　333
格式化數據　334
數據排序　336
使用if進行選擇　336
計算條件總和　337
列或行轉置　337
查找唯一或重復值　338
使用檢索錶　339
利用數據透視錶　339
使用單變量求解　340
第20章　關於程序包的10個技巧　343
探索CRAN　343
尋找有趣的程序包　344
安裝程序包　344
加載程序包　345
閱讀程序包的手冊和文檔　345
更新程序包　346
使用R-Forge　347
從github獲取程序包　347
從Bioconductor進行安裝　348
閱讀R手冊　348
附錄A　安裝R和RStudio　349
附錄B　rfordummies包　355
譯後記　357
· · · · · · (收起)