Protein Design

Protein Design pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Humana Pr Inc
作者:Guerois, Raphael (EDT)/ Lopez De La Paz, Manuela (EDT)
出品人:
页数:316
译者:
出版时间:2006-6
价格:$ 168.37
装帧:HRD
isbn号码:9781588295859
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质设计
  • 计算蛋白质设计
  • 蛋白质工程
  • 生物信息学
  • 结构生物学
  • 分子生物学
  • 蛋白质结构预测
  • 理性设计
  • 进化计算
  • 生物技术
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具体描述

Protein Design: Methods and Applications presents the most up-to-date protein design and engineering strategies so that readers can undertake their own projects with a maximum chance of success. The authors present integrated computational approaches that require various degrees of computational complexity, and the major accomplishments that have been achieved in the design and structural characterization of helical peptides and proteins.

《蛋白质的奥秘:从结构到功能的演变》 内容梗概: 本书是一部深入探索蛋白质复杂世界、揭示其结构如何决定功能、以及它们如何在生命进程中扮演至关重要角色的著作。我们将从蛋白质的基本组成单位——氨基酸——出发,循序渐进地剖析蛋白质的三维结构是如何精巧地折叠形成,以及这些结构如何决定了蛋白质在细胞内外的各种特异性相互作用。本书将不仅仅停留于理论的阐述,更会通过大量的案例研究,展示蛋白质在酶促反应、信号转导、分子识别、细胞骨架构建乃至基因调控等生命活动中的关键作用。我们将深入了解蛋白质如何识别其底物,如何催化化学反应,如何在复杂的细胞环境中进行定位和运输,以及它们如何作为动态的分子机器,响应外界信号并参与细胞的生命周期。 第一部分:蛋白质的基石——氨基酸与一级结构 氨基酸的多样性: 蛋白质是由二十种天然氨基酸构成的。我们将详细介绍每种氨基酸的化学结构,特别是其侧链基团的特性,包括它们的电荷、疏水性、亲水性、极性以及芳香性。理解这些特性是预测蛋白质折叠和相互作用的基础。我们将探讨它们如何根据侧链的性质被分类,以及这些分类如何影响蛋白质的整体性质。 肽键的形成与多肽链: 氨基酸之间通过肽键连接,形成线性多肽链。本书将阐述肽键的形成过程,以及多肽链的书写方向(N端到C端)。我们将讨论肽键的平面性及其对蛋白质构象的影响。 一级结构的决定性: 氨基酸序列,即蛋白质的一级结构,是决定其三维结构和功能的根本。我们将深入探讨“序列决定构象”这一核心概念,并介绍确定蛋白质一级结构的技术,如Edman降解法和现代质谱技术。 第二部分:蛋白质的形体之美——二级、三级与四级结构 二级结构的优雅: 蛋白质在局部区域会形成规律性的二级结构,最常见的是α-螺旋和β-折叠。我们将详细解析α-螺旋的形成机制,包括氢键在其中的作用,以及其螺旋半径、节距和每圈氨基酸数。同样,我们将深入分析β-折叠的结构特点,包括平行和反平行β-折叠,以及它们在形成β-片层时的稳定性。此外,我们还会介绍β-转角和环,它们在连接二级结构单元中的作用。 三级结构的壮丽: 蛋白质的三级结构是指整条多肽链在三维空间中的整体折叠方式。我们将详细探讨稳定三级结构的各种非共价相互作用,包括氢键、离子键、范德华力以及疏水作用。特别是疏水作用,我们将深入解释为什么疏水性侧链倾向于聚集在蛋白质内部,而亲水性侧链则暴露在水环境中,这是蛋白质折叠的核心驱动力之一。我们将介绍蛋白质折叠的能量景观模型,以及分子伴侣在辅助蛋白质正确折叠中的重要作用。 四级结构的协同: 许多功能性蛋白质是由多个多肽链(亚基)组成的。我们将探讨四级结构,即多亚基复合物的组装方式,以及亚基之间的相互作用。我们将通过红细胞中血红蛋白的例子,来展示四级结构在协同结合和变构效应中的重要性,以及这种协同如何提高蛋白质的功能效率。 第三部分:蛋白质的功能宇宙——酶、受体与分子机器 酶:生命的催化者: 酶是蛋白质中最活跃、最重要的功能类别之一。我们将深入探讨酶的作用机制,包括活性中心的结构特点,底物结合的特异性,以及酶如何降低反应活化能。我们将介绍不同类型的酶催化机制,如氧化还原反应、水解反应、水合反应等,并分析影响酶活性的因素,如pH、温度、抑制剂和激活剂。我们将重点讲解酶动力学,如Michaelis-Menten方程,并介绍其在理解酶功能和设计药物时的应用。 受体:信号的接收者与传递者: 细胞膜上的受体是细胞与外界进行信息交流的门户。本书将详细介绍不同类型的受体,包括G蛋白偶联受体(GPCRs)、酶联受体、离子通道型受体等。我们将阐述配体如何结合受体,并触发下游的信号转导通路,以及这些信号如何影响细胞的功能和行为。我们将探讨信号放大机制,如第二信使的作用,以及信号的整合与调控。 结构蛋白:细胞的骨架与支撑: 蛋白质也扮演着维持细胞形态、提供机械支持的角色。我们将介绍细胞骨架的关键组成部分,如微丝、微管和中间纤维,并阐述它们如何由肌动蛋白、微管蛋白和角蛋白等蛋白质构成。我们将讨论这些结构蛋白如何参与细胞运动、分裂以及细胞内物质运输。 运输蛋白:分子的摆渡者: 细胞内外的物质运输离不开蛋白质。我们将介绍膜转运蛋白,如离子通道和载体蛋白,它们如何介导物质跨膜运输。我们将讨论血红蛋白和肌红蛋白在氧气运输中的作用,以及它们与氧结合的机制。 运动蛋白:驱动生命的机器: 肌肉收缩、细胞内囊泡运动等都离不开运动蛋白。本书将深入分析肌球蛋白和驱动蛋白等运动蛋白的工作原理,包括它们如何利用ATP水解产生能量,以及如何实现定向运动。 第四部分:蛋白质的动态调控与相互作用 蛋白质折叠与错误折叠: 尽管蛋白质折叠过程看似精妙,但有时也会发生错误。我们将探讨导致蛋白质错误折叠的因素,以及错误折叠蛋白的后果,包括它们在神经退行性疾病(如阿尔茨海默病和帕金森病)中的作用。我们将介绍细胞识别和降解错误折叠蛋白的机制,如泛素-蛋白酶体系统。 翻译后修饰:功能的多样化: 蛋白质在翻译后会经历各种化学修饰,极大地扩展了其功能多样性。我们将详细介绍主要的翻译后修饰,如磷酸化、糖基化、乙酰化、甲基化、泛素化等。我们将深入探讨这些修饰如何影响蛋白质的活性、稳定性、亚细胞定位以及与其他分子的相互作用,并以磷酸化在信号转导中的中心作用为例进行阐述。 蛋白质-蛋白质相互作用:细胞的通讯网络: 蛋白质很少孤立地发挥作用,它们通过相互作用形成复杂的网络,执行精细的细胞功能。我们将介绍研究蛋白质相互作用的技术,如酵母双杂交、免疫共沉淀等。我们将探讨蛋白质相互作用在信号转导、代谢途径、基因调控以及细胞周期调控中的重要性。 蛋白质的降解与稳态: 蛋白质的合成与降解处于动态平衡之中,以维持细胞的正常功能。我们将深入探讨蛋白质降解途径,特别是泛素-蛋白酶体系统,以及其在清除损伤或不需要的蛋白质中的作用。我们将讨论蛋白质稳态的维持对于细胞健康的重要性。 第五部分:蛋白质的演化与疾病 蛋白质的演化: 蛋白质序列和结构的演化是理解生命多样性的关键。我们将探讨蛋白质家族的形成,基因重复与分化如何产生新的蛋白质功能,以及同源蛋白在不同物种中的比较。 蛋白质功能障碍与疾病: 许多疾病的根源在于蛋白质功能障碍,包括基因突变导致的蛋白质结构异常、功能丧失或获得性毒性。我们将列举一些与蛋白质相关的疾病,如镰状细胞性贫血、囊性纤维化、癌症等,并阐述其发病机制。 本书力求以严谨的科学态度,结合生动的语言和丰富的案例,为读者呈现一个全面而深刻的蛋白质世界。通过本书,读者将能够建立起对蛋白质结构与功能之间深刻联系的认知,理解它们在生命活动中的至关重要作用,并为进一步探索生命科学的奥秘打下坚实的基础。

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