Protein NMR Techniques

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出版者:Humana Pr Inc
作者:Downing, A. Kristina (EDT)
出品人:
页数:487
译者:
出版时间:
价格:1228.00 元
装帧:HRD
isbn号码:9781588292469
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质NMR
  • 核磁共振
  • 生物物理
  • 结构生物学
  • 蛋白质结构
  • NMR技术
  • 生物化学
  • 分子生物学
  • 光谱学
  • 蛋白质分析
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具体描述

Protein NMR Techniques 是一本旨在全面介绍核磁共振(NMR)技术在蛋白质研究中应用的专业书籍。本书的内容涵盖了从基础原理到高级应用的广泛领域,旨在为读者提供一个扎实而深入的理解,帮助他们有效地利用NMR来解析蛋白质的结构、动力学、相互作用和功能。 本书结构与内容概述: 本书按照逻辑顺序,逐步引导读者进入蛋白质NMR的世界。 第一部分:基础原理与技术准备 第一章:蛋白质NMR的起源与发展:本章将追溯NMR技术在蛋白质科学中的发展历程,介绍其里程碑式的突破以及在揭示生命奥秘中所扮演的关键角色。从早期的简单分子谱图解析,到如今的大型蛋白质复合物和膜蛋白研究,NMR技术展现了惊人的适应性和强大的能力。 第二章:核磁共振基础:本章深入阐述NMR现象的物理基础,包括原子核的自旋、磁矩、外加磁场下的能级分裂、核磁共振频率(拉莫尔频率)等。我们将详细介绍核磁共振谱仪的基本组成部分,如磁体、射频脉冲、探测器等,以及这些部件如何协同工作以产生和检测NMR信号。对于NMR的定量分析,本章还将涉及化学位移、自旋-自旋偶合、弛豫等核心概念,并解释它们如何反映分子的结构和环境。 第三章:蛋白质的NMR制备:高质量的蛋白质样品是成功进行NMR实验的前提。本章将详细介绍蛋白质的表达和纯化策略,重点关注如何获得高浓度、高纯度且同位素标记(如¹⁵N和¹³C)的蛋白质样品。我们将讨论各种表达系统(如大肠杆菌、酵母、昆虫细胞、哺乳动物细胞)的优缺点,以及针对不同类型蛋白质(如胞内蛋白、膜蛋白、分泌蛋白)的表达和纯化技巧。此外,本章还将探讨蛋白质的复性、寡聚化状态的控制以及使用辅助试剂(如SDS、DPC)来提高膜蛋白的可溶性和NMR可检测性。 第四章:NMR仪器与实验设置:本章将详细介绍不同类型的NMR波谱仪,包括超导磁体、探头(如CryoProbe)的类型和选择,以及它们对NMR信号灵敏度和分辨率的影响。我们将讨论NMR实验的通用设置,包括氘代溶剂的选择、pH值、离子强度、温度等对蛋白质NMR谱图的影响。同时,本章还将介绍NMR样品管的选择和装样技巧,以及如何进行NMR谱仪的日常维护和校准,确保实验的稳定性和可重复性。 第二部分:基本NMR实验与数据解析 第五章:一维NMR谱图解析:本章将聚焦于一维¹H NMR谱图的解析。我们将介绍谱图中的关键信息,如信号的位置(化学位移)、信号的强度(与质子数量相关)、信号的裂分(自旋-偶合)以及信号的宽度(弛豫)。通过实例,我们将展示如何识别蛋白质中的不同质子信号,并初步推断其局部结构特征。同时,本章还将介绍如何通过二维NMR实验来区分和指认一维谱图中的信号。 第六章:二维NMR实验:二维NMR实验极大地扩展了NMR在蛋白质研究中的应用范围。本章将详细介绍最常用的二维NMR实验,包括COSY (Correlation Spectroscopy)、TOCSY (Total Correlation Spectroscopy)、NOESY (Nuclear Overhauser Effect Spectroscopy) 和 HSQC (Heteronuclear Single Quantum Coherence) / HMQC (Heteronuclear Multiple Quantum Coherence)。我们将深入解析这些实验的原理、脉冲序列、谱图特征以及它们所能提供的信息。例如,COSY用于识别通过化学键相连的质子;TOCSY可以识别同一氨基酸残基中的质子;NOESY可以提供原子间的空间距离信息,是结构解析的关键;HSQC/HMQC则用于在¹H和¹⁵N或¹³C之间建立关联,是识别和追踪蛋白质中不同残基的关键。 第七章:蛋白质结构解析策略:本章将系统地介绍如何利用NMR数据来解析蛋白质的三维结构。我们将详细阐述从二维NMR谱图的 assignment(信号指认)开始,到利用三维NMR实验(如HNCA, HNCACB, CBCA(CO)NH, HN(CO)CA等)来建立氨基酸残基间的联系。然后,我们将介绍如何从NOESY实验中提取距离约束,以及如何利用这些距离约束和二面角约束(如果可用)通过分子动力学模拟或距离几何方法来构建三维结构模型。最后,我们将讨论结构模型的评估和验证方法。 第三部分:高级NMR技术与应用 第八章:蛋白质动力学研究:蛋白质并非静止不变的分子,其动力学特性对其功能至关重要。本章将介绍利用NMR来研究蛋白质动力学的方法。我们将讨论弛豫测量(如T1, T2, NOE)以及如何从中提取关于蛋白质构象变化、运动模式和时间尺度的信息。此外,本章还将介绍残基特定弛豫测量、^{15}N线型分析以及^{13}C CP-MAS弛豫测量等高级技术,用于探测蛋白质在不同时间尺度(皮秒到秒)的运动。 第九章:蛋白质-配体相互作用研究:NMR是研究蛋白质-配体相互作用的有力工具。本章将介绍如何利用NMR技术来检测和量化蛋白质与小分子、多肽或核酸的结合。我们将讨论位移相关实验(如^{1}H, ¹⁵N HSQC titrations)、二面角变化、NOE信号变化以及弛豫时间的变化等,如何指示结合位点和结合强度。此外,本章还将介绍核 오버하우저 (Nuclear Overhauser) 效应相关的实验,用于确定结合配体的空间取向。 第十章:蛋白质复合物的NMR研究:研究大型蛋白质复合物的结构和功能一直是NMR领域的挑战。本章将介绍如何利用NMR来解析蛋白质复合物的结构,包括如何进行跨分子NOE的检测,以及如何利用化学位移扰动(Chemical Shift Perturbation, CSP)来识别复合物界面。此外,本章还将讨论如何利用低场NMR、氘代技术以及相干拉曼散射显微镜等技术来辅助研究大型蛋白质复合物。 第十一章:膜蛋白的NMR研究:膜蛋白由于其疏水性和较低的可溶性,给NMR研究带来了独特的挑战。本章将深入探讨膜蛋白的NMR研究策略。我们将讨论如何选择合适的去污剂、脂质体或纳米盘来稳定膜蛋白,以及如何利用宏观样品的NMR技术(如MAS-NMR)来研究膜蛋白的结构和动力学。此外,本章还将介绍如何进行膜蛋白的同位素标记和谱图解析。 第十二章:NMR在其他蛋白质相关领域的应用:本章将拓展NMR技术的应用范围,介绍其在蛋白质折叠、错误折叠疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病)、酶催化机制、核糖体和信号转导复合物等领域的应用实例。通过这些案例,读者可以更深入地理解NMR在解决复杂生物学问题中的价值。 本书特色: 理论与实践并重:本书在深入阐述NMR理论原理的同时,也提供了大量的实验操作细节和数据解析实例,帮助读者将理论知识转化为实际操作能力。 循序渐进的教学法:内容设计遵循从基础到高级的逻辑顺序,适合不同背景的读者,无论是初学者还是有一定经验的研究者,都能从中受益。 丰富的图示和表格:本书包含大量的谱图、脉冲序列图、结构模型图以及实验参数表格,有助于读者直观理解复杂的NMR概念和数据。 涵盖最新技术:本书及时更新了NMR领域的前沿技术和发展趋势,如高场NMR、CryoProbe技术、新型脉冲序列设计等。 面向广泛读者群:本书不仅是结构生物学家、生物物理学家、生物化学家的重要参考书,也对计算生物学家、药学研究人员以及从事相关领域的学生具有极高的参考价值。 Protein NMR Techniques 旨在成为蛋白质NMR研究领域的权威指南,为读者提供解决生物分子问题所需的全面知识和实用技能。通过本书的学习,读者将能够熟练运用NMR技术,揭示蛋白质在生命过程中的奥秘。

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