《結腸炎癥性疾病手冊》共分7部分。第1部分為結腸解剖學。第2部分為病理知識。第3部分重點介紹國內外最新內鏡技術。第4部分介紹瞭炎癥性腸病的定義、分類、亞太地區診療共識意見與疾病活動性評估等內容；同時，分章介紹瞭特發性炎癥性腸病的臨慶特點及活動性、嚴重性評估等。第5部分為治療篇。第6部分介紹瞭診斷睏難且易與潰瘍性結腸炎、剋羅恩病發生混淆的各種常見的非感染性結腸炎癥性疾病。第7部分分為特殊感染瞭一般感染性結腸炎。此外，《結腸炎癥性疾病手冊》還專列章節介紹瞭炎癥性腸病與結腸、直腸惡性腫瘤的關係等內容。
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