《中國中醫藥學術年鑒》由紙質（文字版）和光盤（版）兩大載體部分組成。
文字版部分設有特載、專論、中醫藥管理、校院長論壇、學術進展、索引等闆塊。根據21世紀中醫藥學術發展的方嚮和實際情況，本書對原學術進展部分作瞭較大的調整：譬如。
新增的“院校長論壇”，既可以反映過去一年裏中醫藥教育事業和院校發展的實踐與體會，又能體現齣院校長們對中醫藥教學、科研和醫療改革的新思路、新舉措。
在“臨床各科”闆塊裏，於報道各科臨床證治進展之前，特地新設“名醫經驗”欄目，以便將各地報道的中醫名學術經驗、臨證特色及其用藥經驗等得以充分反映，更有利於中醫藥學術經驗的繼承和發揚。
在“中藥”闆塊中，將原中藥理論方麵的內容，與“中醫基礎理論研究”欄目等一起歸並在“理論研究”闆塊中；將“開發利有”欄目分化為“中藥資源”、“中藥藥劑”、“中藥營銷”欄目，保留原先的“藥材鑒定”、“中藥化學”、“中藥炮製”、“中藥藥理”、“方劑研究”等欄目，使之能全麵準確地反映該學科在新世紀研究和發展的情況。
光盤版設有2002年中醫藥學術期刊論文目錄索引、統計資料、重要會議和文件、中醫藥科研獲奬項目、齣版新書目、機構、廣告視聽等欄目。
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