Statistics Applied to Bioinformatics

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出版者:Oxford University Press, USA
作者:Jacques Van Helden
出品人:
页数:400
译者:
出版时间:2019-6-15
价格:GBP 99.80
装帧:Hardcover
isbn号码:9780199226757
丛书系列:
图书标签:
  • 统计学
  • 生物信息学
  • 生物统计学
  • 数据分析
  • 基因组学
  • 蛋白质组学
  • 计算生物学
  • 统计建模
  • 生物医学
  • 机器学习
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具体描述

A text based on his Masters level course on statistics applied to bioinformatics aimed at graduate students from statistics, bioinformatics and biology. Filling a gap in the current literature, the text includes a rigorous and extensive background in biostatistics, along with detailed explanation of the key biological questions before focusing on the statistical analysis. Including exercises, numerous illustrations, extensive end of chapter summaries and examples of programming in R (a freely available statistical package), this is an ideal study text.

好的,这是一份关于一本名为《数据分析基础与高级应用》的图书简介,该书内容与您提到的《Statistics Applied to Bioinformatics》无直接关联。 --- 图书名称:《数据分析基础与高级应用:从原理到实践的系统指南》 图书简介 在信息爆炸的时代,数据已成为驱动科学研究、商业决策和社会进步的核心要素。本书《数据分析基础与高级应用:从原理到实践的系统指南》旨在为广大读者——无论是初涉数据科学领域的学生、希望提升技能的专业人士,还是需要深入理解数据驱动决策的管理者——提供一个全面、深入且实用的学习路径。本书系统地梳理了数据分析的理论基石,并结合当前主流的工具与技术,带领读者完成从基础概念到复杂模型应用的完整蜕变。 第一部分:数据分析的基石与准备 本书首先从宏观视角审视数据分析的本质、流程与核心价值。我们详细阐述了数据生命周期的各个阶段,强调了数据在不同领域中的角色转变。 数据伦理与治理: 在深入技术之前,我们探讨了数据隐私、偏见识别与负责任的分析实践。理解数据的来源、潜在的偏差,以及如何确保分析的公平性和可解释性,是现代数据分析师必备的素养。 统计学基础回顾: 虽然本书侧重应用,但对统计学原理的扎实掌握至关重要。本章深入讲解了描述性统计(集中趋势、离散度)、概率论基础、抽样分布、假设检验(t检验、卡方检验、ANOVA)的底层逻辑与适用场景,确保读者能够清晰地理解后续高级模型的统计意义。 数据采集、清洗与预处理: 现实世界的数据往往是“脏”的。本部分详细介绍了数据导入的各种格式(CSV, JSON, SQL数据库),缺失值处理(插补技术、删除策略),异常值检测与平滑处理,以及数据转换(标准化、归一化、特征编码)的实用技巧。我们将演示如何使用Python的Pandas库高效地管理和重塑数据集。 第二部分:探索性数据分析(EDA)与可视化 数据分析的成功,往往取决于对数据的“初见”印象。本部分聚焦于如何通过视觉化和探索性方法,揭示数据背后的故事。 核心可视化技术: 我们详细介绍了直方图、箱线图、散点图、热力图等基础图表的构建方法及其在发现数据分布、关系和异常值方面的作用。重点在于选择“正确的”图表来回答“特定的”问题。 多变量分析与关联性探究: 探讨如何使用相关性矩阵、对比例子图(Pair Plots)和降维可视化技术(如PCA/t-SNE的降维结果可视化),来洞察数据集中变量间的复杂交互作用。 交互式仪表盘构建: 介绍如何利用如Plotly或Dash等工具,创建动态、交互式的报告和仪表盘,使用户能够自主探索数据,而不是被动地接收静态图表。 第三部分:经典与现代机器学习模型 本书的核心部分在于对主流预测和分类模型的深入剖析与实战演练。我们不仅关注模型的“如何运行”,更关注其“为何如此运作”。 监督学习:回归模型: 从最基础的线性回归、多元回归开始,逐步过渡到正则化回归(Ridge, Lasso, Elastic Net),解释如何通过正则化控制过拟合,并讲解模型诊断(残差分析、R平方的局限性)。 监督学习:分类模型: 涵盖逻辑回归、支持向量机(SVM)的基础概念与核技巧,并详尽介绍决策树的构建过程,包括信息熵、基尼系数的计算。 集成学习的威力: 本章着重介绍如何通过集成方法提升模型性能。我们将详细拆解随机森林(Bagging的代表)、梯度提升机(GBM)以及现代高效的XGBoost、LightGBM框架,讨论它们在处理非线性关系和高维数据时的优势。 模型评估与选择: 详细讲解了分类问题的评估指标(准确率、精确率、召回率、F1分数、ROC曲线、AUC值)的权衡艺术。同时,深入探讨交叉验证策略(K折、分层抽样)和超参数调优的最佳实践(网格搜索、随机搜索、贝叶斯优化)。 第四部分:无监督学习与高阶分析 数据分析并非总是为了预测。本部分侧重于数据结构的发现和深层次的模式挖掘。 聚类分析: 介绍K-Means、DBSCAN等主流聚类算法的原理、优缺点及“最佳簇数”的确定方法(如肘部法则、轮廓系数)。 降维技术: 除了PCA在线性降维中的应用,我们还引入了非线性降维技术如t-SNE和UMAP,用于高维数据的可视化和特征提取。 关联规则挖掘: 讲解如何使用Apriori算法发现数据项之间的潜在关联,这在市场购物篮分析等场景中极为重要。 第五部分:时间序列分析与应用案例 时间序列数据因其内在的序列依赖性,需要特定的分析框架。 时间序列分解与平稳性: 介绍时间序列的趋势、季节性和残差组成,以及如何通过差分等方法处理非平稳序列。 经典模型:ARIMA家族: 深入讲解自回归(AR)、滑动平均(MA)、差分(I)的组合模型,并提供如何通过ACF/PACF图识别模型参数的方法。 实战案例: 结合实际的金融或环境数据,演示如何构建、检验和预测一个完整的时间序列模型。 结语:通往数据驱动的下一步 本书的最终目标是培养读者的数据素养和解决问题的能力。我们提供了一个从理论理解到代码实现的完整闭环,鼓励读者不仅要会运行代码,更要理解其背后的数学逻辑和统计假设,从而在面对真实世界的复杂挑战时,能够做出最稳健、最有洞察力的分析决策。本书的配书代码和数据集可在配套资源库中获取,以便读者进行同步练习和深入探索。

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