Environmental Genomics

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出版者:
作者:Martin, C. Cristofre 编
出品人:
页数:376
译者:
出版时间:2008-2
价格:$ 123.17
装帧:
isbn号码:9781588297778
丛书系列:
图书标签:
  • 环境基因组学
  • 宏基因组学
  • 微生物生态学
  • 生物信息学
  • 环境DNA
  • 基因组学
  • 生态基因组学
  • 新一代测序
  • 生物多样性
  • 环境科学
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具体描述

Environmental genomics seeks to predict how an organism or organisms will respond, at the genetic level, to changes in their external environment. These genome responses are diverse and, as a result, environmental genomics must integrate molecular biology, physiology, toxicology, ecology, systems biology, epidemiology and population genetics into an interdisciplinary research program. "Environmental Genomics" serves as a manual for an environmental scientist who wishes to embrace genomics in an effort to answer environmental questions. The volume is divided into the sections: gene expression profiling, whole genome and chromosome mutation detection, and methods to assay genome diversity and polymorphisms within a particular environment. The studies presented will reduce the uncertainties associated with environmental risk assessment and provide a systematic framework for determining environmental impact and ensuring human health and the sustainability of natural populations. "Environmental Genomics" should aid researchers looking to reduce the uncertainties associated with environmental risk assessment and provide a systematic framework for determining environmental impact and ensuring human health and the sustainability of natural populations.

巨石下的回响:深海沉积物中的生命奥秘 作者:[虚构作者姓名] 出版社:[虚构出版社名称] 出版日期:[虚构出版日期] --- 内容提要: 《巨石下的回响:深海沉积物中的生命奥秘》是一部聚焦于地球上最广袤、最隐秘的生物栖息地——深海沉积物生态系统的专著。本书以严谨的科学视角和引人入胜的叙述,深入探讨了这些位于海床之下数百米甚至数公里处的微生物群落的结构、功能及其在全球生物地球化学循环中所扮演的关键角色。 本书摒弃了对表层海洋生态的传统关注,将读者的目光引向了那些在极端高压、极低营养和黑暗环境中顽强生存的生命体。我们不再仅仅研究漂浮在水柱中的浮游生物,而是要探究被古老沉积物包裹、与矿物表面紧密结合的“地下海洋”生态。 章节概览: 第一部分:幽暗世界的地理与地质背景 本书首先为读者构建了一个关于深海沉积物环境的宏大图景。我们将详细阐述全球海洋沉积盆地的形成历史、沉积物的类型学(从硅藻土到深海粘土、浊积岩),以及这些物质如何记录了地球气候和地质变迁的漫长档案。 1.1 沉积物在地球系统中的定位: 解释了为什么深海沉积物不仅仅是死物的堆积,而是活跃的生物圈的组成部分。 1.2 压力与温度梯度下的物理化学: 深入分析了沉积物孔隙水(Porewater)的化学梯度,如溶解氧的耗尽深度、甲烷水合物的存在区域,以及氧化还原界面(Oxidation-Reduction Interfaces)的形成机制。这些物理化学参数直接决定了生命的分布。 1.3 沉积速率与生物扰动: 探讨了沉积物沉积速率对微生物群落结构的影响,以及底栖生物(如海星、蠕虫)的活动如何在沉积层中制造“生物泵”,影响物质交换。 第二部分:沉积物生物圈的微生物多样性与适应机制 本部分是全书的核心,致力于揭示深海沉积物中微生物生命力的复杂性。通过整合宏基因组学、培养组学和稳定同位素探针技术,本书描绘了这些“深层生物圈”(Deep Biosphere)的真实面貌。 2.1 极端耐受性与生命策略: 详细讨论了适应性压力,包括如何应对数千个大气压力的细胞膜重塑、如何利用极低浓度的能量源(如氢气、一氧化碳或岩石本身)进行代谢。 2.2 主要代谢群落的鉴定: 重点分析了厌氧氧化甲烷菌(AOM)在海洋甲烷循环中的主导作用,以及铁还原菌、硫酸盐还原菌在沉积物深处的相互作用网络。我们追溯了这些菌群的“生存策略”,它们如何维持近乎静止的代谢速率,以应对长达数百万年的“慢生活”。 2.3 病毒学视角下的深层生态: 探讨了噬菌体在控制深海沉积物微生物群落大小和演化中的作用。病毒如何通过“杀戮-释放”机制,促进营养物质的循环,并可能驱动微生物的水平基因转移。 第三部分:能量流与生物地球化学循环 沉积物是全球碳、氮、硫、磷等关键元素的巨大储库和转化器。《巨石下的回响》将重点阐述这些元素的循环如何被深层微生物调控,并如何影响海洋表层和全球气候。 3.1 碳循环的深层截留与释放: 考察了有机碳在沉降和埋藏过程中被微生物降解的效率。特别关注了“深层碳泵”的效能,以及沉积物微生物活动对海洋释放到大气中的二氧化碳量的贡献。 3.2 氮的“失踪”与“重现”: 分析了海洋沉积物中硝化作用(Nitrification)和反硝化作用(Denitrification)的耦合模式,以及深海特有的“缺氧厌氧氧化氨过程”(Anammox)在氮移除中的贡献。 3.3 岩石圈与生物圈的交互: 首次系统性地展示了微生物如何通过生物矿化作用(Biomineralization)影响地质过程,例如形成或溶解硫化物、铁氧化物,从而改变沉积物的物理结构和电子传递能力。 第四部分:研究方法学的革新与展望 本书的最后部分将聚焦于当前深海沉积物研究的前沿技术和面临的挑战。 4.1 现场原位(In Situ)监测技术的突破: 介绍了高压生物反应器、微电极技术以及深海钻探取样(IODP/ICDP)中对微生物活性保持的研究方案。 4.2 宏组学数据的解读: 讨论了如何从海量的基因和转录组数据中,重建出那些无法在实验室中培养的微生物的代谢网络。 4.3 演化时间尺度的挑战: 探讨了利用放射性同位素衰变(如14C、230Th)结合分子钟技术,对深海微生物演化历史进行定年的尝试与局限性。 本书特色: 《巨石下的回响》超越了传统的微生物生态学范畴,它是一次对地球生命极限的探索。作者不仅提供了详尽的实验数据和模型,更穿插了对早期地球生命起源(如对深海热液喷口生命起源的类比)的哲学思考。本书旨在激发地质学家、海洋生物学家、化学家以及对地球生命复杂性感兴趣的读者,重新审视我们脚下这片广阔而沉默的生物疆域。它揭示了,支撑地球宜居性的许多关键过程,正悄无声息地在数公里厚的岩石和泥沙之下运转着。 --- (字数统计:约1550字)

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