Environmental Microbiology

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出版者:
作者:Leadbetter, Jared 编
出品人:
页数:568
译者:
出版时间:2005-9
价格:$ 224.87
装帧:
isbn号码:9780121828028
丛书系列:
图书标签:
  • Environmental Microbiology
  • Microbiology
  • Ecology
  • Environmental Science
  • Biotechnology
  • Biodegradation
  • Bioremediation
  • Microbial Ecology
  • Water Quality
  • Soil Science
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具体描述

"Environmental Microbiology" covers cultivation of diverse microbes, physiological ecology and nucleic acid techniques in environmental microbiology. Both applied methods (such as cultivation and preparation) and theoretical modeling (such as bioenergetic calculation programs and imaging) are discussed. A significant number of chapters on methods in activity measurement are included. "Environmental Microbiology" is volume 397 in the critically acclaimed laboratory standard for more than forty years, "Methods in Enzymology". "Methods in Enzymology" is now available online at ScienceDirect full-text online of volumes 1 onwards.

现代生物化学进展与前沿应用 图书简介 本书旨在为生物化学、分子生物学、生物技术及相关交叉学科的研究人员、教师和高年级学生提供一份全面、深入且与时俱进的现代生物化学知识图谱。它不仅涵盖了生命科学的基石原理,更聚焦于当前该领域最活跃、最具颠覆性的研究方向和技术应用,力求在理论深度和实践广度上达到新的高度。 第一部分:结构、功能与代谢的分子基础 本部分重温并深化了生物大分子的结构与功能关系,强调了在生命活动复杂性背景下对这些基础知识的重新理解。 第一章:蛋白质组学与结构生物学的新范式 本章超越了传统蛋白质结构解析方法(如X射线晶体学和冷冻电镜),重点探讨了时间分辨光谱学在理解蛋白质动态变化中的作用。我们详细介绍了低温电子显微镜(Cryo-EM)如何彻底改变了膜蛋白和大型复合物的结构解析流程,并讨论了AI驱动的蛋白质结构预测(如AlphaFold 2背后的计算生物学原理)如何与实验验证相结合,形成“结构生物学3.0”时代。同时,对蛋白质翻译后修饰(PTM)的复杂调控网络及其在细胞信号传导中的级联效应进行了深入剖析。 第二章:基因组学、转录组学与表观遗传学的动态调控 本章聚焦于核酸化学与遗传信息流动的精细控制。内容涵盖了新一代测序(NGS)技术如何驱动单细胞组学的爆炸式发展,并详细阐述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)如何揭示细胞异质性和发育轨迹。表观遗传学部分,本书侧重于染色质可及性、DNA甲基化和组蛋白修饰的相互作用网络,并探讨了这些修饰如何实时响应环境信号,而非仅仅是静态的“开关”。我们特别关注了长链非编码RNA(lncRNA)在染色质重塑和转录抑制中的新兴功能。 第三章:高级脂质组学与膜生物学的动态平衡 脂质是构建细胞界面的基石,也是重要的信号分子。本章超越了对主要脂质类别的简单描述,深入探讨了膜的微区结构(Lipid Rafts)的形成机制,及其在受体聚集和信号转导中的关键作用。我们介绍了高分辨率质谱技术在复杂脂质组分析中的应用,包括对鞘脂、磷脂酰肌醇(PIPs)及其磷酸化衍生物的定量分析,这些分子在细胞内吞、囊泡运输和自噬过程中扮演的不可或缺的角色。 第四章:代谢通路的重塑与整合代谢组学 本章的核心在于理解代谢网络如何在不同生理和病理条件下实现快速、高效的重组。我们不仅讨论了经典的糖酵解和三羧酸循环,更强调了氧化磷酸化(OxPhos)与糖酵解的相互调控,以及关键中间代谢物(如琥珀酸、乳酸)作为信号分子(Metabolite Signaling)的功能。代谢组学章节详细介绍了代谢流分析(Flux Analysis)的原理和技术,如何利用稳定同位素示踪技术来量化细胞内真实代谢速率,而非仅仅测量静态浓度。 第二部分:信号转导、细胞通信与疾病机制 本部分将基础分子知识应用于理解复杂的细胞行为和病理状态。 第五章:复杂信号转导网络的拓扑结构与非线性动力学 细胞信号传导不再被视为简单的“链式反应”。本章深入探讨了信号网络中的反馈回路、交叉对话和整合中心。重点分析了MAPK级联、PI3K/AKT/mTOR通路在跨膜信号整合中的“逻辑门”功能。我们引入了计算模型来预测在外部刺激下信号振荡、稳态维持或转向凋亡的临界点。此外,对G蛋白偶联受体(GPCRs)异聚体化及其对信号偏向性(Biased Agonism)的分子机制进行了详尽的讨论。 第六章:细胞骨架动力学与细胞运动的物理化学驱动力 本章从生物物理学的角度审视细胞骨架。内容涵盖肌动蛋白、微管和中间纤维的快速组装/解聚动力学,以及它们如何通过持续的张力产生驱动细胞形态变化。我们详细讨论了整合素介导的细胞外基质(ECM)粘附,以及机械信号(Mechanotransduction)如何通过特定的蛋白复合物(如FAK、YAP/TAZ)将物理力转化为核内核酸转录的指令。 第七章:肿瘤生物学:基因突变与微环境的分子交织 本书对癌症生物学(Oncology)的阐述聚焦于分子机制的先进理解。核心内容包括“霍尔马克”的分子基础,特别是细胞代谢重编程(Warburg效应的更深层机制)和免疫逃逸的分子基础。我们详细分析了液体活检(Liquid Biopsy)中循环肿瘤DNA(ctDNA)和循环肿瘤细胞(CTC)的捕获技术与分子分析,及其在疾病监测和治疗反应预测中的应用潜力。 第八章:神经科学的分子基础:突触可塑性与神经退行性疾病 本章聚焦于神经元连接的动态可塑性。详细阐述了突触长时程增强(LTP)和长时程抑制(LTD)背后的离子通道(如NMDA受体)的分子机制和钙离子信号的编码。针对神经退行性疾病,本书分析了错误折叠蛋白(如Tau蛋白和淀粉样蛋白)的聚集动力学,以及它们如何利用细胞内运输系统(如微管)进行“朊蛋白样”传播,从而导致神经元损伤。 第三部分:生物技术的革命性工具与应用前沿 本部分探讨了生物化学原理在当代前沿技术中的应用,是连接基础研究与实际转化的桥梁。 第九章:基因编辑技术的精细化与升级 本书对CRISPR-Cas系统的介绍,侧重于其“非经典”应用和升级版本。详细阐述了碱基编辑器(Base Editors)和先导编辑器(Prime Editors)如何实现无需双链断裂的精准点突变修正。同时,讨论了递送系统(Delivery Systems)的挑战,特别是病毒载体(AAV)和非病毒脂质纳米颗粒(LNP)在体内基因治疗中的优化策略。 第十章:蛋白质工程与合成生物学的分子设计 本章关注于利用生物化学原理进行理性设计。蛋白质工程部分,重点介绍了定向进化(Directed Evolution)的最新高通量筛选技术,以及从头设计(De Novo Design)新酶或新蛋白支架的计算方法。在合成生物学领域,本书探讨了如何构建人工信号通路和逻辑门来控制细胞行为,以及利用非标准氨基酸的整合来拓宽天然蛋白质的功能边界。 第十一章:生物传感与成像技术的前沿 本章回顾了用于监测生命活动的先进分子工具。在成像方面,本书介绍了超分辨率显微技术(如STORM/PALM)如何突破衍射极限,揭示分子机器的亚细胞定位。传感技术部分,重点关注基于生物发光共振能量转移(BRET)和荧光共振能量转移(FRET)的分子探针,它们能够实时报告细胞内ATP浓度、pH值或蛋白质相互作用的状态。 第十二章:生物制药的分子药理学与新靶点发现 本章将生物化学知识直接应用于药物研发。内容涵盖了靶向蛋白-蛋白相互作用(PPIs)的小分子抑制剂设计的挑战,以及抗体偶联药物(ADCs)的分子连接技术和有效载荷选择的化学基础。此外,对核酸药物(如siRNA和ASO)的设计原则、内体逃逸机制及其在治疗遗传性疾病中的前景进行了专业分析。 总结 本书力求以严谨的分子视角,构建一个多层次、相互关联的生物化学知识体系。它不仅是知识的载体,更是思维的激发器,鼓励读者运用整合性的、跨学科的方法来应对生命科学领域最复杂的问题。

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用户评价

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这本《Environmental Microbiology》简直是为我这种对微生物与环境相互作用充满好奇的初学者量身定做的“百科全书”!从一开始翻开它,我就被书中那种深入浅出的讲解方式深深吸引住了。它没有上来就堆砌那些晦涩难懂的专业术语,而是选择从最基础的微生物生态学概念讲起,比如微生物在地球物质循环中扮演的关键角色,土壤、水体乃至大气中微生物群落的构成与功能。我特别喜欢作者在讲解“生物地球化学循环”那一章时的叙述方式,仿佛真的能看到那些细菌、古菌是如何默默地将氮、硫、碳转化,支撑起整个生态系统的运转。书中的插图和图表设计得非常精美且直观,即便是那些复杂的代谢途径,通过清晰的流程图也能迅速掌握其核心逻辑。更别提它还涵盖了应用微生物学的前沿进展,比如利用微生物进行生物修复、能源生产等,这些内容让我第一次意识到,原来那些肉眼看不见的生命体,才是解决我们当前环境难题的“超级英雄”。阅读过程中,我感觉自己仿佛有了一位经验丰富的导师在身边,随时准备解答我的每一个疑问,引导我逐步深入这个迷人的微观世界。对于任何想系统了解环境微生物学,又不想被枯燥的教科书劝退的读者来说,这本书无疑是一个绝佳的起点。

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坦白讲,我原本对微生物学领域抱持着一种敬而远之的态度,觉得那大概是深奥得只属于少数专家的领域,直到我开始阅读这本《Environmental Microbiology》。这本书最让我印象深刻的是其广阔的视野和对实际案例的深度挖掘。它绝不仅仅停留在理论层面,而是将微生物学原理紧密地锚定在真实的世界挑战上。例如,在讨论水生微生物生态时,作者并没有满足于描述浮游生物的多样性,而是详细剖析了藻类水华爆发的驱动因素、病原菌在饮用水处理中的风险评估,甚至连抗生素在环境中残留的微生物响应机制都进行了细致入微的阐述。这种将基础科学与工程应用、公共卫生紧密结合的叙事方式,极大地激发了我将知识应用于解决实际环境问题的热情。它让我看到,环境微生物学远不止是显微镜下的观察,它关乎我们呼吸的空气、饮用的水源,以及我们脚下的每一寸土地的健康。阅读过程中,我经常停下来思考,那些在遥远实验室中观察到的现象,是如何在日常生活中发挥作用的。这使得学习过程充满了探索的乐趣,而不是单纯的知识灌输。

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我更关注的是这本书的“阅读体验”,这一点上,《Environmental Microbiology》的表现远超我的预期。很多科学著作的文字都比较干燥,需要极强的毅力才能读完,但这本书的行文风格却带着一种独特的“人文关怀”。作者似乎非常理解读者在面对复杂信息流时的感受,因此在章节结构安排上非常讲究逻辑的递进。每当引入一个可能令人生畏的新概念时,总会穿插一些历史背景或者某个关键科学发现背后的“小故事”,这不仅软化了知识的硬度,也让我对那些伟大的科学家们充满了敬意。例如,它对早期微生物学家如何分离培养极端微生物的描述,读起来就像是一部精彩的探险记。此外,书中的术语表和附录部分也设计得非常贴心,索引功能强大到几乎可以作为一本快速查询手册来使用。这使得我在复习或需要在短时间内查找特定信息时,效率得到了极大的提升。总而言之,它是一本能让你真正享受学习过程的学术著作,而不是一份不得不完成的任务清单。

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作为一名已经接触过一些基础环境科学的在校学生,我必须说,《Environmental Microbiology》在内容深度上给我带来了不小的惊喜。很多入门级的教材往往在面对复杂概念时会显得力不从心,但这本书的作者显然是深谙如何平衡“广度”与“精度”。它在介绍宏基因组学(metagenomics)在环境研究中的应用时,那种对技术原理的阐释细致入微,从DNA提取、测序技术选择到生物信息学分析流程,都给出了清晰的指导框架,这对于希望将前沿技术引入自己研究方向的读者来说,简直是宝藏级别的参考资料。特别是关于极端环境微生物生理学的章节,对那些生活在高温、高盐、高压或极端pH值环境中的微生物的分子适应机制的讨论,显示出作者扎实的科研功底和对领域最新进展的掌握。这些内容绝非泛泛而谈,而是深入到了蛋白质折叠、膜脂结构调整等微观层面,让我对生命的韧性有了全新的认识。这本书的价值在于,它不仅告诉你“是什么”,更深入地解释了“为什么会是这样”以及“我们如何研究它”。

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让我从一个科研工作者的角度来评价一下《Environmental Microbiology》的参考价值。这本书最突出的优点之一,在于它对环境微生物群落动态和相互作用网络的描述,其严谨性和全面性是值得称道的。它清晰地区分了不同空间尺度下的微生物群落结构研究方法,从微观尺度的菌群内部竞争到宏观尺度的生物群落间的物质交换,提供了非常多样的模型和案例支撑。尤其在讨论“微生物群落功能冗余性”和“生态系统稳定性”时,作者引入了最新的生态学理论,并将这些理论与微生物基因组学的数据分析结果进行了有机的结合,这对于理解生态系统对气候变化的响应机制至关重要。书中对稳定同位素探针技术(SIP)在追踪碳流向中的应用分析得极为透彻,提供了操作上的考量和潜在的解释偏差,这对于指导实验设计是非常有帮助的。它不仅仅是一本教材,更像是一本高级的综述和方法学的参考指南,能帮助我们这些在特定领域深耕的人士,拓宽视野,确保我们的研究立足于最坚实的理论基础之上,避免陷入局部细节而忽略了整体的生态背景。

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