Protein Mass Spectrometry, Volume 52

Protein Mass Spectrometry, Volume 52 pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:
作者:Whitelegge, Julian 编
出品人:
页数:552
译者:
出版时间:2008-10
价格:2312.00元
装帧:
isbn号码:9780444530554
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质组学
  • 质谱
  • 蛋白质分析
  • 生物化学
  • 分子生物学
  • 生物技术
  • 分析化学
  • 生命科学
  • 蛋白质鉴定
  • 蛋白质定量
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具体描述

This book is designed to be a central text for young graduate students interested in mass spectrometry as it relates to study of protein structure and function as well as proteomics.

It is a definite must have work for:

- libraries at academic institutions with Master and Graduate programs in Biochemistry, Molecular Biology, Structural Biology and Proteomics;

- individual laboratories with interests covering these areas; and

- libraries and individual laboratories in the pharmaceutical and biotechnology industries.

. serves as an essential reference to those working in the field

. incorporates the contributions of prominent experts

. features comprehensive coverage and a logical structure

《蛋白质质谱学:第五十二卷》 蛋白质质谱学领域不断发展,为揭示生命的分子奥秘提供了前所未有的强大工具。《蛋白质质谱学:第五十二卷》汇集了来自世界各地的顶尖研究人员的最新研究成果和深刻见解,为读者提供了一个全面而深入的视角,探索这一前沿科学的最新进展。 本书涵盖了蛋白质质谱学从基础理论到前沿应用的广泛主题。在基础理论方面,本卷深入探讨了质谱仪的最新设计和技术进步,包括高分辨率质谱仪、串联质谱技术以及新型离子化方法。这些技术革新极大地提升了蛋白质鉴定、定量分析和修饰研究的灵敏度、准确性和通量。读者将了解到如何最大化利用这些尖端仪器,克服复杂生物样品中的挑战,并获得更详尽的蛋白质组信息。 在蛋白质鉴定与定量方面,《第五十二卷》提供了关于数据处理算法、数据库搜索策略以及标记和无标记定量方法的最新进展。作者们分享了在处理大规模蛋白质组数据时提高效率和准确性的实用技巧,特别是在比较不同样本或条件下蛋白质表达水平的差异时。对于从事癌症研究、药物发现或疾病机制探索的科学家来说,这些内容将是宝贵的参考。 蛋白质翻译后修饰(PTMs)是调控蛋白质功能和信号传导的关键。本卷特别关注了PTMs的鉴定和功能分析,包括磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化等。通过对新型PTM识别策略和富集技术的介绍,读者将能够更全面地描绘蛋白质修饰的景观,并深入理解其在细胞生理和病理过程中的作用。特别是,关于特定PTM在特定疾病中的作用的研究,为开发新的诊断标记物和治疗靶点提供了重要线索。 除了蛋白质组学整体研究,本书还聚焦于蛋白质质谱学在特定应用领域的突破。例如,在疾病诊断和预后方面,有研究展示了如何利用蛋白质质谱学技术识别与特定疾病相关的生物标记物,为早期诊断和个性化治疗提供可能。在药物研发领域,本卷探讨了蛋白质质谱学在靶点识别、药物作用机制研究以及药物疗效评估中的应用,帮助研究人员更有效地加速新药的开发进程。 此外,《蛋白质质谱学:第五十二卷》还深入探讨了蛋白质组学与其它组学技术(如基因组学、转录组学和代谢组学)的整合。通过多组学数据的联合分析,研究人员能够更全面地理解生命系统的复杂性和动态性,揭示基因、RNA、蛋白质和代谢物之间的相互作用网络,从而获得更深入的生物学见解。 在质谱数据分析和生物信息学方面,本书介绍了用于蛋白质组学数据挖掘的最新算法和软件工具。作者们分享了如何有效地进行数据可视化、网络分析以及从海量数据中提取有意义的生物学信息。这对于处理日益增长的蛋白质组学数据集至关重要。 最后,本书还展望了蛋白质质谱学未来的发展方向,包括单细胞蛋白质组学、空间蛋白质组学以及人工智能在蛋白质组学数据分析中的应用。这些新兴技术有望将我们对生物系统的理解推向新的高度。 《蛋白质质谱学:第五十二卷》是蛋白质质谱学研究人员、博士后、研究生以及对蛋白质科学感兴趣的生物学家的必备参考书。它不仅提供了对最新研究的全面概述,更重要的是,它激发了读者在蛋白质质谱学领域进行创新性研究的灵感。通过阅读本书,您将能够掌握最前沿的技术和理论,并为理解生命过程的复杂性做出贡献。

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读后感

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用户评价

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我特别留意了有关**靶向蛋白质组学(Targeted Proteomics)**的应用章节,发现其内容完全侧重于**构建和验证高灵敏度的定量方法**,而非讨论蛋白质组学在疾病诊断中的宏观应用前景。这本书没有对某种特定疾病(如癌症或阿尔茨海默病)的蛋白质组图谱进行回顾,也没有探讨如何利用大规模临床数据来验证生物标志物。相反,作者们花费了大量篇幅来讨论**内标肽(Heavy Labeled Peptides)的合成质量控制**以及在SRM/PRM方法中**内标与内源性肽段响应曲线匹配的精度问题**。这是一种极度技术化的关注点,它深入到如何通过微调碰撞能量和内标添加量,来保证在极低浓度下内源性肽段测量的线性范围和回收率的准确性。读者如果想了解哪些蛋白质是新型的诊断标志物,或者这些标志物在临床决策中扮演的角色,这本书不会给出任何答案。它的世界观仅限于实验室台面上,如何确保每个微小的定量信号都是**可信赖和可重复**的。

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我阅读了本书中关于**蛋白质翻译后修饰(PTM)质谱分析**的章节,深感其内容聚焦于**特定修饰的特异性富集与鉴定**,完全避开了对基础修饰(如磷酸化、乙酰化)的泛泛而谈。作者似乎更热衷于探讨那些“棘手”的修饰,比如糖基化或泛素化,这些在常规流程中常常被忽略或鉴定失败的领域。例如,书中详尽地描述了针对N-连接糖链进行酶解、标记和选择性富集的一整套优化方案,其涉及的化学试剂选择、反应条件的温度控制和时间依赖性,都细致到令人发指的地步。如果有人期望在这本书里找到关于如何设置ICP-MS进行元素分析,或者关于核磁共振(NMR)在蛋白质结构解析中的应用,那绝对是找错了地方。该书的视角极其狭窄,却又极其精深地集中在**如何利用高分辨质谱分离和识别那些化学性质相近、丰度极低的目标修饰基团**。特别是对于那些需要开发新方法的生物化学家而言,书中展示的几种新型交联试剂的反应机理和选择性分析,提供了宝贵的参考,但这些内容完全没有触及蛋白质的二级或三级结构的常规解析方法。

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这本关于蛋白质质谱分析的著作,在我看来,更像是一本针对资深研究人员的“工具箱”而非入门指南。首先,从其内容的深度来看,它显然没有试图去覆盖质谱分析的基础原理,例如质谱仪的基本构造、离子化技术的ABC——那些在更早期的教材中就已经被嚼烂的部分。相反,它直接跳跃到了应用层面,特别是针对那些在蛋白质组学领域摸爬滚打多年的同行们所关心的前沿技术挑战。书中对于复杂样本(比如临床样本或细胞裂解液)中低丰度蛋白的识别和定量策略的探讨极为深入,那些关于数据依赖采集(DDA)和数据非依赖采集(DIA)方法的参数优化细节,以及如何处理高分辨率质谱数据中碎片离子信息饱和的问题,都展现出作者对实际实验难点的深刻理解。我尤其欣赏其中关于**定性与定量策略的整合**部分,它详细讨论了如何通过多维分离技术(如二维液相色谱)与串联质谱的联用,最大限度地挖掘蛋白质组信息,但这部分内容对于刚接触质谱的本科生来说,无疑是天书。书中没有花篇幅解释为什么我们需要Q-TOF或者Orbitrap,而是直接讨论了如何在特定实验环境下(比如靶向蛋白质组学)选择最合适的仪器平台和数据处理流程。整体感觉,它假定读者已经熟练掌握了LC-MS/MS的基本操作和数据解读,其重点完全放在了**如何突破现有瓶颈,实现更高覆盖度和更精确的定量**上。

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这份材料在讨论**蛋白质-蛋白质相互作用组(PPI)的质谱研究**时,明显偏向于**高通量共免疫沉淀(Co-IP/MS)的优化**,而非生物网络拓扑学的构建。书中详细分析了如何选择最佳的洗脱条件(如低pH缓冲液与高浓度盐梯度)来最大限度地回收弱结合的蛋白质伴侣,并且对比了不同裂解液中去污剂的性能对“假阳性”捕获的影响。然而,对于如何利用捕获到的相互作用数据进行**网络可视化、模块识别或关键枢纽蛋白的筛选**,本书仅作了简略提及,甚至可以说是不置一词。它没有提及Cytoscape的使用方法,也没有深入探讨基于拓扑参数的生物学意义。因此,对于一个专注于生物信息学或系统生物学建模的读者来说,这本书在“连接点”之后的内容全部缺失了。它提供的仅仅是**如何高效、干净地获取那些“连接点”的原始列表**,至于这些列表如何转化成可理解的生物学模型,则完全是另一套学科体系的工作了。

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这本书给我最直观的印象是,它是一本为**方法开发人员和核心设施技术骨干**量身定制的参考手册,其内容与生物信息学基础课程中的统计学建模部分几乎绝缘。对于一个期望了解如何进行**差异蛋白质组学数据统计分析**的初级用户来说,这本书的价值有限。它提供的不是ANOVA或t检验的数学推导,而是如何针对质谱数据中的批次效应(Batch Effect)进行**高级回归模型校正**的实际操作流程。书中讨论的重点是如何构建一个稳健的实验设计矩阵,以应对样本间的系统误差,并且详述了如何评估和选择最佳的归一化方法,比如中位数比值法与更复杂的基于参考样本的校正方法之间的优劣。但是,请注意,它完全没有涉及构建预测模型的机器学习算法,也没有对常见的蛋白质数据库进行深入的结构性介绍。它关注的是**数据流的质量控制和校准**,而不是数据背后的生物学解释框架,更别提蛋白质结构预测或药物靶点相互作用的动力学模拟了。

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