Protein-protein Interactions and Networks

Protein-protein Interactions and Networks pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:
作者:Panchenko, Anna (EDT)/ Przytycka, Teresa (EDT)
出品人:
页数:220
译者:
出版时间:2008-9
价格:$ 134.47
装帧:
isbn号码:9781848001244
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质相互作用
  • 蛋白质网络
  • 生物信息学
  • 系统生物学
  • 分子生物学
  • 计算生物学
  • 网络分析
  • 蛋白质组学
  • 生物网络
  • 信号通路
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具体描述

The biological interactions of living organisms, and protein-protein interactions in particular, are astonishingly diverse. This comprehensive book provides a broad, thorough and multidisciplinary coverage of its field. It integrates different approaches from bioinformatics, biochemistry, computational analysis and systems biology to offer the reader a comprehensive global view of the diverse data on protein-protein interactions and protein interaction networks.

《蛋白质的秘密编织:生命蓝图的解读》 本书并非关于“Protein-protein Interactions and Networks”这一特定主题。相反,它将带领读者踏上一段探索生命基础的旅程,深入理解构成所有生命形式的微观世界。我们将从构成万物的基本单元——蛋白质——出发,揭示它们在细胞生命活动中所扮演的至关重要的角色。 第一章:蛋白质的千姿百态——生命的结构与功能基石 本章将全面介绍蛋白质的化学组成和结构多样性。我们将首先深入探讨氨基酸——构成蛋白质的基本“积木”——它们的化学性质、分类及其如何通过肽键连接形成多肽链。随后,我们将层层剥开蛋白质结构的复杂性:从一级结构(氨基酸序列)到二级结构(α-螺旋和β-折叠),再到三级结构(三维空间构象)和四级结构(多亚基复合物)。我们将详细阐述每种结构层级对蛋白质功能的影响,以及影响蛋白质正确折叠的关键因素,并触及蛋白质折叠错误可能导致的疾病。 第二章:酶——生命活动的催化者 作为蛋白质最重要的功能之一,酶的作用在生命活动中不可或缺。本章将深入研究酶的催化机理,包括活性位点、底物特异性、降低活化能的机制以及各种酶促反应的动力学模型。我们将介绍酶活性的调节方式,如变构调节、共价修饰和酶的合成调控。此外,我们将列举一些关键的代谢途径中的重要酶,并解释它们在维持生命代谢平衡中的作用。 第三章:信号转导——细胞间的对话与响应 细胞并非孤立存在,它们需要通过复杂的信号转导系统来感知和响应外界环境的变化。本章将聚焦于细胞信号转导的核心机制。我们将介绍不同类型的信号分子,如激素、神经递质和生长因子,以及它们如何通过细胞膜上的受体结合来传递信息。我们将深入解析细胞内信号转导的通路,包括G蛋白偶联受体、酪氨酸激酶受体等经典信号通路,以及第二信使(如cAMP, IP3, Ca2+)在信号放大和传递中的作用。最后,我们将探讨信号转导失调在疾病发生中的作用,例如癌症和神经系统疾病。 第四章:肌肉收缩与运动——蛋白质的动力学表现 生命离不开运动,而许多运动的根源在于蛋白质的动态变化。本章将以肌肉收缩为例,生动展示蛋白质在产生机械力方面的卓越能力。我们将详细解析肌动蛋白和肌球蛋白在肌肉收缩中的相互作用机制,以及钙离子在调控这一过程中的关键角色。我们将介绍相关的调控蛋白,如肌钙蛋白和原肌球蛋白,以及它们如何协同工作实现肌肉的收缩和舒张。此外,我们还将触及其他类型的细胞运动,如鞭毛运动和细胞爬行,以及其中涉及的关键蛋白质。 第五章:抗体与免疫——保卫身体的蛋白质战士 免疫系统是守护我们健康的天然屏障,而抗体则是免疫系统中的关键执行者。本章将深入探讨抗体的结构、功能及其在识别和清除病原体中的作用。我们将介绍抗体的基本结构,包括重链和轻链,以及它们的抗原结合位点。我们将阐述抗体的多样性产生机制,包括基因重排和体细胞超突变。此外,我们将讨论抗体介导的免疫效应,如中和、调理和激活补体系统。最后,我们将简单介绍疫苗接种的原理,以及其与抗体产生的关联。 第六章:DNA复制与修复——生命的遗传密码守护者 遗传信息的准确传递是生命延续的基础,而DNA复制和修复系统则承担着这一重任。本章将深入解析DNA复制的分子机制,包括DNA聚合酶的作用、复制叉的形成以及端粒酶在染色体末端复制中的作用。我们将探讨DNA复制过程中可能出现的错误,以及DNA修复系统如何纠正这些错误,从而维护基因组的稳定性。我们将介绍多种DNA修复途径,如碱基切除修复、核苷酸切除修复和错配修复,并讨论DNA损伤的来源和其对细胞命运的影响。 第七章:蛋白质的降解与再利用——细胞的物质循环 细胞并非一成不变,它不断地合成新的蛋白质,同时也将衰老或受损的蛋白质进行降解和再利用。本章将探讨蛋白质的降解途径,主要聚焦于泛素-蛋白酶体系统(UPS)和自噬。我们将详细介绍泛素化过程,以及蛋白酶体如何识别和降解泛素化的目标蛋白质。我们还将阐述自噬机制,包括自噬体的形成和溶酶体介导的降解。我们将讨论蛋白质降解在维持细胞稳态、清除受损细胞器和应对饥饿条件中的重要性。 第八章:蛋白质与疾病——理解生命的脆弱性 许多疾病的发生都与蛋白质的功能异常有关。本章将探讨蛋白质在多种疾病发生发展中的作用。我们将以阿尔茨海默病、帕金森病和囊性纤维化为例,详细阐述蛋白质错误折叠、功能缺失或过度活化如何导致这些疾病。我们将讨论基因突变如何影响蛋白质的结构和功能,以及环境因素如何诱导蛋白质的病理性改变。最后,我们将简要介绍基于蛋白质靶点的药物研发策略,为理解和治疗疾病提供新的视角。 本书旨在通过对蛋白质不同生命过程的细致解读,帮助读者建立起对生命活动基本机制的深刻理解。每一章的论述都将力求严谨、清晰,并辅以生动的实例,使复杂的生物学概念易于掌握。我们相信,通过了解蛋白质这一生命的基本“工人”的方方面面,读者将能更全面地认识生命的奇妙与精巧。

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读后感

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用户评价

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这本《蛋白质-蛋白质相互作用与网络》的书,我一口气读完了,说实话,感觉就像是进入了一个微观世界的宏伟蓝图展览。初翻开书页时,我本以为会是一些枯燥的生化反应图谱,没想到作者将复杂的分子机器运作,描述得如同史诗般波澜壮阔。它不仅仅是罗列了哪些蛋白质会相互“握手”,而是深入探讨了这些相互作用如何构建起生命活动的基本逻辑。书中对动态平衡和信号传导网络的精妙剖析,简直让人叹为观止。特别是关于如何利用计算方法预测新型相互作用位点的章节,逻辑严密,推演过程清晰得如同数学证明,让人不得不佩服作者的功底。我尤其欣赏它在理论与实验数据之间的完美衔接,每一个模型假设后面,都有坚实的生物学证据作为支撑,这让这本书既有高度的学术价值,又具备极强的可读性和实践指导意义。那种在知识海洋中乘风破浪,最终抵达彼岸的满足感,正是我阅读此书后最深刻的体验。

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这是一本充满思辨性的著作,它迫使我不断地停下来,思考我们对生命理解的边界在哪里。书中对“功能性模块”的界定和分析方法,尤其具有启发性。作者并没有直接给出标准答案,而是详细介绍了各种挖掘潜在功能组的算法和统计检验的局限性。这种开放式的探讨方式,非常适合科研工作者和研究生。我发现,这本书的价值不仅在于传授已知的知识,更在于激发读者去质疑现有模型,去探索那些尚未被发现的相互作用规则。它像一位严谨的导师,在你迷茫时提供清晰的工具和框架,但最终的探索之路,必须由你自己去走。读完后,我感觉自己手里握着了一套比以往任何时候都更强大的分析工具箱。

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这本书的排版和插图设计,也值得称赞。那些复杂的相互作用图谱,如果处理不当,很容易变成一团乱麻,让人望而却步。但这里的图示,每张都经过精心设计,色彩搭配既能有效区分不同类型的相互作用(比如共价、非共价、间接),又能保持整体画面的和谐感和信息密度。尤其是对那些罕见或低丰度的蛋白质复合物的阐述部分,作者巧妙地运用了多种可视化技术,将原本难以观察的动态过程“凝固”在了纸面上。这种对美学和信息清晰度的双重追求,极大地提升了阅读体验。总而言之,这是一本将深奥的科学内容,通过优雅的文字和视觉语言完美呈现的典范之作,它为这个交叉学科领域树立了一个极高的标准。

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说句实在话,这本书的难度不低,尤其对于那些非生物学背景的读者来说,前几章的分子结构和生物化学基础需要反复研读。但一旦跨过那道坎,接下来的内容简直是令人振奋的冒险。我最喜欢的是它在不同层次上展现蛋白质相互作用的视角。它没有停留在静态的分子对接层面,而是引入了时间维度,讨论了相互作用的瞬时性、可逆性以及环境依赖性。有一处关于蛋白质修饰(如磷酸化)如何充当“开关”来调控网络连接强弱的论述,简直是神来之笔。它揭示了生命系统如何在毫秒级别上实现复杂的决策制定,这种精细的调控机制,让我对生命体的“智能”有了更深层次的理解。这本书对细节的执着和对全局观的把握,是少有的杰作。

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我必须承认,我对生物信息学和系统生物学的兴趣,很大程度上是被这本书点燃的。坦率地说,我之前对“网络”这个概念在生物学中的应用理解非常肤浅,总觉得它和物理世界的网络结构相去甚远。然而,这本书彻底颠覆了我的认知。它用极其生动的比喻,解释了蛋白质网络中的“枢纽”蛋白和“模块”结构,就像在解读一个超级复杂的城市交通系统,每一个交汇点都至关重要。书中对网络拓扑性质的讨论,例如小世界效应和无标度特性,不仅仅是理论上的炫技,更是直接指向了疾病发生和药物靶点选择的关键。我花了大量时间去理解那些关于网络鲁棒性的章节,作者是如何论证一个突变如何能轻易地“瘫痪”整个通讯链,这种由点及面的宏观视角,让我对生命系统的复杂性有了全新的敬畏。

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