《中国高技术产业发展年鉴(2009)》内容共分六大部分：（一）产业综合篇：介绍了2008年中国高技术产业发展、国家高新技术产业开发区、创业投资业的发展情况；并对高技术产业中的一些重点行业，主要包括信息产业、新材料产业、生物产业、航空航天产业、可再生能源产业、软件产业、集成电路产业、互联网产业、宽带产业、转基因植物产业、医药产业以及中国现代中药产业等的发展情况、特点与发展趋势进行了分析。
（二）地区发展篇：37个省（自治区、直辖市）、计划单列市发展和改革委员会撰写了2008年当地高技术产业发展的基本情况、特点和发展思路。
（三）海外发展篇：介绍了世界电子信息产业、软件产业、可再生能源产业、医药行业、生物技术产业等产业发展情况，和世界研发支出、科学技术与工业的基本现状与趋势以及近年韩国提升产业竞争力的主要措施。
（四）政策法规篇：收录了国务院和各部委2008年发布的与高技术产业发展相关的政策、法规和规划。
（五）大事记录篇：收集了2008年高技术产业发展及信息产业、生物与医药产业、新材料产业、新能源产业、航天航空产业发展中的一些重要事件。
（六）基础数据篇：为便于读者查找高技术产业中的一些基础数据，《中国高技术产业发展年鉴(2009)》收录了国家统计局关于《全国高技术产业动态检测信息快报》的主要经济指标和OECD《Main Science and Technology Indicators》的相关数据。
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