Parsimony, Phylogeny, and Genomics pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

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出版者:Oxford Univ Pr

作者:Albert, Victor A. 编

出品人:

页数:240

译者:

出版时间:2006-3

价格:$ 111.87

装帧:Pap

isbn号码:9780199297306

丛书系列:

图书标签:

• 系统发育学
• 简约性
• 基因组学
• 分子进化
• 生物信息学
• 进化生物学
• 计算生物学
• phylogenetic analysis
• 模型选择
• 数据分析

《演化之链：从细胞到生态的生命史诗》 作者：[此处留空，或填写虚构作者名，如：艾伦·M·斯特恩；张文远] 出版社：[此处留空，或填写虚构出版社名，如：环宇科学出版社；蓝鲸文库] ISBN：[此处留空，或填写虚构ISBN] --- 简介： 生命，这个宏大而精密的系统，其壮阔的历程跨越了近四十亿年的时间。我们如何从最早的自我复制分子，逐步演化出细菌、植物、真菌，最终塑造出拥有复杂意识的人类？《演化之链：从细胞到生态的生命史诗》并非仅仅是一本关于物种更替的编年史，它是一次深入生命核心机制、跨越尺度边界的探险之旅。本书旨在构建一个统一的框架，用以理解生命在不同层级——从分子组装到全球生物圈——所遵循的基本驱动力与涌现出的复杂性。 第一部分：起源的基石——分子与细胞的协同 本书的起点聚焦于生命最基础的层面：分子的自组织与细胞的诞生。我们首先探讨的是“生命起源”的经典假说，但重点不在于对既有模型的复述，而是对其中关键“瓶颈”的深入剖析。 1. 信息的编码与复制的黎明： 我们细致审视了核酸（RNA/DNA）在早期地球环境中如何获得稳定性和催化能力。不同于将信息视为既定事实，本书将重点放在信息结构的脆弱性与冗余性之间的动态平衡如何驱动了早期分子系统的选择压力。书中详细分析了早期聚合反应的物理化学限制，以及氨基酸池的“手性”选择是如何在化学层面锁定了后续生物化学的路径。特别地，我们将探讨“代谢优先”模型与“遗传优先”模型之间的张力，并引入了关于脂质双层膜在非酶促环境下自发形成微区室的实验证据，论证了边界（膜）的出现如何为内部化学反应的积累提供了必要的“演化容器”。 2. 原核生物的统治与核心代谢的固化： 在真核生物出现之前，原核生物统治了地球数十亿年。这一时期的演化是关于效率最大化和资源利用的模块化。我们将深入剖析光合作用的起源及其对地球大气层的影响——即“大氧化事件”如何不仅是一场生物化学革命，更是一场全球尺度的环境灾难与机遇并存的剧变。本书重点对比了不同类型的微生物如何利用能量梯度（如质子驱动力）进行化学合成，揭示了所有生命形式中共享的、高度保守的能量转换模块（如ATP合成酶的结构基础），这部分内容强调了“模块化功能单元的锁定”在生物演化中的决定性作用。 3. 真核的飞跃：内共生理论的精细化阐释： 真核细胞的出现是生命史上最重大的结构性创新之一。本书不满足于对线粒体和叶绿体起源的简单描述，而是着重分析了核膜系统、内质网和细胞骨架的协同演化。我们探讨了宿主细胞与吞噬共生体的关系如何从简单的共生演化为不可分割的遗传与代谢耦合。例如，我们分析了线粒体基因组的显著“退化”过程，论证了这种退化并非演化的失败，而是对信息处理负担的“卸载”，从而允许宿主核基因组专注于更复杂的调控网络。这部分将涉及对基因组间的串扰与协同适应的深入讨论。 第二部分：宏观演化——形态、谱系与辐射 离开了单细胞的范畴，生命开始在时间与空间中雕刻出复杂的多细胞结构和多样的生态功能。 4. 多细胞性的涌现与功能分化： 多细胞生物的演化需要克服细胞间通讯、粘附与程序性细胞死亡（凋亡）的难题。本书将考察在不同谱系（植物、动物、真菌）中，多细胞性是如何独立起源的，并分析了细胞粘附分子（如钙依赖性粘附分子或整合素的祖先形式）在实现组织形成中的作用。我们特别关注了“生命周期”的演化——例如，何时以及为何某些物种倾向于将有性生殖、休眠期或群体行为嵌入其生命周期中，以应对环境的周期性波动。这部分将用跨物种的比较形态学数据来支持对早期动物（如海绵、水母）发育模块的重建。 5. 化石记录的偏见与“爆发性”事件的解析： 我们批判性地审视了寒武纪生命大爆发。与其将其视为一个真正的“爆发”，本书更倾向于将其解读为“可识别形态的爆发”。我们将分析化石记录的局限性（如软体动物的稀缺性），并结合现代发育生物学（Evo-Devo）的见解，探讨Hox基因的调控网络的早期固化如何为体型和器官布局的快速多样化提供了“遗传硬件”。我们还将探讨“雪球地球”事件后，气候稳定期如何为大型生物的出现提供了必要的能量和氧气基础。 6. 谱系关系与生物地理学的交织： 传统的系统发育树构建往往侧重于生物形态或特定基因的相似性。本书在此基础上，强调了大陆漂移、物种隔离与适应辐射之间的不可分割性。我们将利用分子钟数据与地质证据进行交叉验证，解析关键的生物地理学事件，例如南半球冈瓦纳古陆生物区系的形成，以及生物扩散（dispersal）与区域分化（vicariance）在塑造现今生物群落中的相对贡献。我们关注那些“活化石”物种，分析它们在特定生态位中抵抗演化变革的机制。 第三部分：动态的平衡——生态、互动与宏观调控 生命不是孤立的个体，而是相互作用的网络。本书的最后一部分将目光投向了生态系统这一更广阔的舞台。 7. 共生体网络与宿主-微生物的“超级生物体”概念： 我们挑战了将宿主视为独立演化单元的传统视角。肠道微生物组、根瘤菌与植物等案例表明，许多性状的适应性实际上是由“宿主-共生体复合体”共同承担的。本书详细讨论了水平基因转移（HGT）在微生物群落中的重要性，这种“信息共享”极大地加速了抗性、毒性或代谢能力的演化，使得微生物界的演化速度远超真核生物。我们将探讨如何量化这种复合体的“演化协同性”。 8. 竞争、捕食与协同演化的“军备竞赛”： 捕食者与猎物、寄生者与宿主之间的互动是驱动形态和行为创新的主要力量。本书将以具体的案例（如抗毒性植物与植食性昆虫的协同进化）来阐释“红皇后假说”在微观尺度上的运作。重要的是，我们将讨论这种持续的相互选择压力如何导致趋同演化——在相似的生态压力下，不相关的谱系如何独立地发展出相似的解决方案（如翼的形态），以及这种趋同性对理解演化约束的意义。 9. 生物圈的反馈回路与地球系统的稳定： 作为收尾，本书将视角拉回到地球尺度，探讨生命活动对气候、水文循环乃至岩石圈的深远影响。从盖亚假说的现代生物地球化学解读，到甲烷、二氧化碳在生命活动中的循环，我们看到生物圈不仅仅是环境的被动适应者，更是环境的主要塑造者。本书将分析关键的“阈值”——例如，极端气候事件或大规模生物灭绝如何重置生态演化的方向，并探讨当前人类活动对这些古老反馈回路构成的独特挑战。 --- 《演化之链》试图提供一个多尺度的、整合性的视角，揭示生命演化中那些跨越分子边界、细胞壁垒和地理距离的普遍原则。它引导读者超越对单一物种的关注，去理解生命作为一个动态、适应性极强的“系统”是如何在地球这颗行星上持续自我构建与重塑的。 目标读者： 生物学、古生物学、生态学及地球科学领域的学生、研究人员，以及对生命演化历史抱有深刻好奇心的广大科学爱好者。

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