DNA, Words and Models pdf epub mobi txt 电子书下载 2026

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出版者:Cambridge Univ Pr

作者:Robin, Stephane/ Rodolphe, Francois/ Schbath, Sophie

出品人:

页数:158

译者:

出版时间:2005-10

价格:$ 102.83

装帧:HRD

isbn号码:9780521847292

丛书系列:

图书标签:

DNA
生物信息学
计算生物学
分子生物学
建模
算法
数据分析
基因组学
生物统计学
系统生物学

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具体描述

An important problem in computational biology is identifying short DNA sequences (mathematically, 'words') associated to a biological function. One approach consists in determining whether a particular word is simply random or is of statistical significance, for example, because of its frequency or location. This book introduces the mathematical and statistical ideas used in solving this so-called exceptional word problem. It begins with a detailed description of the principal models used in sequence analysis: Markovian models are central here and capture compositional information on the sequence being analysed. There follows an introduction to several statistical methods that are used for finding exceptional words with respect to the model used. The second half of the book is illustrated with numerous examples provided from the analysis of bacterial genomes, making this a practical guide for users facing a real situation and needing to make an adequate procedure choice.

好的，这是一本关于古代哲学、符号学与早期印刷文化的图书简介，完全不涉及DNA、词语或现代模型等内容。 --- 书名：《巴比伦的泥板、亚历山大的图书馆与中世纪的抄写员：符号的演化与知识的结构》内容简介一、导论：知识的物质载体与意义的诞生本书深入探究了人类文明早期，知识是如何被编码、存储和传递的。我们不再将文字视为一种抽象的符号系统，而是将其视为具有物质形态的、与社会结构紧密交织的实体。我们将从美索不达米亚的泥板时代开始，考察楔形文字的结构如何反映了当时复杂的官僚和宗教体系，以及这些泥板的烧制与储存过程，如何定义了“永久性”的知识概念。重点分析部分将聚焦于早期书写材料的物理特性对信息量和信息传播速度的限制。例如，泥板的笨重性如何促成了简写和类目化（cataloging）的发展，以及它与后来的莎草纸和羊皮纸在功能上的根本区别。二、卷轴的帝国：亚历山大图书馆的知识架构本部分将详细描绘亚历山大图书馆的运作模式，这不是一个现代意义上的档案馆，而是一个集学术研究、文献校订与政治宣传为一体的知识中心。我们考察了古希腊学者如何面对浩如烟海的文献资料进行分类和编辑。卡利马库斯的《目录》：详细解析卡利马库斯如何构建其著名的“匹纳克斯”（Pinakes），即图书馆的分类系统。这个系统不仅是简单的按作者或主题划分，更是对已知世界知识版图的一次系统性测绘。我们将分析其采用的“主题-作者-作品”的层级结构，以及这种结构如何成为西方图书馆学思想的源头。文本的校勘与权威化：探究在缺乏标准化印刷的情况下，文本如何通过代代相传的抄写过程产生变异。图书馆的工作人员如何通过比较不同版本的文本，确立“权威文本”（canonical version）的过程，这实质上是一种知识的“标准化”运动，其背后是托勒密王朝对文化霸权的追求。三、手抄本的时代：修道院、缮写室与知识的保守从中世纪早期基督教修道院的抄写间（Scriptorium）开始，本书转向探讨知识在宗教机构中的中心化地位。在西方世界，羊皮纸取代了莎草纸，其耐用性使得手抄本成为主要的知识载体。 “复制的仪式”：我们将分析抄写员的工作环境、工具（鹅毛笔、墨水配方）以及抄写的物质性劳动。抄写本身不仅仅是重复劳动，更是一种宗教性的虔诚行为。对经文的细致复制，确保了神圣知识的纯洁性和连续性。装饰艺术与意义的叠加：细致考察装饰性手抄本（Illuminated Manuscripts）中的微缩插画和首字母大写（Historiated Initials）。这些视觉元素并非简单的点缀，而是对文本含义的再诠释、引导读者进入特定解读路径的“视觉注释”。我们将分析其色彩的选择（如珍贵的群青）与文本的价值之间的共谋关系。知识的碎片化与“藏经阁”的思维：在卷轴转向“对开本”（codex）的过程中，知识的组织方式发生了微妙的变化。对开本便于快速翻阅特定章节，但也使得知识的线性阅读体验受到挑战，促使学者发展出如页码、页眉等索引工具的雏形。四、印刷术的颠覆：从活字到知识的“民主化”陷阱本书的后半部分着眼于印刷术在欧洲的兴起，但视角并非集中于技术本身，而是技术对知识结构的冲击。古腾堡的活字印刷术如何改变了知识的稀缺性、可达性及其社会功能。排版艺术与信息的密度：研究早期的印刷商如何模仿手抄本的美学，以及为了适应机械复制的需要，字体设计如何趋于标准化和几何化。我们将分析早期的“字体”（Typeface）选择如何服务于特定的读者群体——是学术界、法律界还是宗教改革运动。书页的革命：印刷术使得知识的“文本一致性”成为可能，这极大地促进了科学方法和辩论的发展。然而，我们也探讨了其局限性：印刷品在知识传递上的快速性，往往伴随着对内容“深度”的削弱。在信息量暴增的初期，学者们如何应对信息过载的挑战，并发展出新的筛选和权威建立机制。 “标准文本”的政治：考察印刷术如何被用于统一语言、构建民族叙事，以及国家权力如何通过控制印刷许可来管理知识的扩散。知识不再仅仅是修道院或王室的财产，但它很快被新的商业和政治力量所捕获。总结：永恒的张力本书最终论证，从刻在泥板上的楔形符号到印刷在纸张上的铅字，知识载体的每一次物质变革，都必然伴随着社会权力结构和意义生产方式的重组。我们通过对古代和中世纪知识物质形态的细致考察，揭示了符号系统如何在物质的限制与技术的解放之间，不断寻找其表达的极限与权威的根基。本书旨在提供一种对“知识历史”的物质化解读，避免将古老的智慧视为纯粹的、脱离载体的思想流动。