Ubiquitin-proteasome Protocols

Ubiquitin-proteasome Protocols pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Humana Pr Inc
作者:Patterson, Cam (EDT)/ Cyr, Douglas M. (EDT)
出品人:
页数:381
译者:
出版时间:
价格:1003.00元
装帧:HRD
isbn号码:9781588292520
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质酶体
  • 泛素
  • 蛋白质降解
  • 细胞生物学
  • 分子生物学
  • 生物化学
  • 实验方案
  • 蛋白修饰
  • 信号转导
  • 疾病机制
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具体描述

图书:《从混沌到秩序:细胞调控的分子机制》 图书简介 本书《从混沌到秩序:细胞调控的分子机制》旨在为生命科学领域的研究人员、高级本科生和研究生提供一个全面且深入的视角,探讨细胞生命活动中至关重要的调控网络。本书聚焦于细胞如何精确地控制自身的生理状态,从基因表达的开启与关闭,到蛋白质的合成、修饰、定位与降解,再到信号通路的精细调控,以及细胞周期、分化和凋亡等复杂过程。 全书分为六个核心部分,共计三十章,结构严谨,内容涵盖了分子细胞生物学、信号转导、表观遗传学以及系统生物学的前沿进展。 第一部分:分子基石——基因表达的精细调控 本部分首先回顾了分子生物学的基本原理,随后深入探讨了基因转录和转录后调控的复杂机制。 第一章:染色质结构与动态重塑: 详细阐述了真核生物染色质的组装、解聚,以及非编码 RNA(如 lncRNA 和 circRNA)在调控基因可及性中的作用。重点分析了组蛋白的各种翻译后修饰(PTMs)如何建立和解读“组蛋白密码”。 第二章:转录起始与延伸的分子机器: 深入解析了 RNA 聚合酶 II 复合物的组装过程,以及核心转录因子(如 TFIID、Mediator 复合体)如何感知上游信号,并精确地启动或抑制基因的转录。 第三章:RNA 加工与命运决定: 涵盖了 mRNA 剪接(Splicing)的分子机制,包括可变剪接如何极大地扩展基因组的编码潜力。同时,探讨了 mRNA 5' 端加帽和 3' 端加尾对 mRNA 稳定性和翻译效率的决定性影响。 第四章:信使 RNA 的稳态与降解: 阐述了 mRNA 从核输出到细胞质翻译,直至最终被降解的完整生命周期。重点讨论了非编码 RNA 对 mRNA 稳定性的调控,以及无义介导的 mRNA 降解(NMD)通路。 第二部分:蛋白质的生命周期——合成、折叠与质量控制 蛋白质是细胞功能的主要执行者。本部分关注蛋白质从氨基酸序列到三维功能结构,再到最终降解的全部过程。 第五章:核糖体与翻译的精准控制: 描述了真核生物翻译起始因子(eIFs)的复杂调控网络,包括上游开放阅读框(uORFs)和 IRES 介导的翻译调控。 第六章:蛋白质折叠与分子伴侣: 深入探讨了 Hsp70 和 Hsp90 等分子伴侣在协助新合成多肽链正确折叠中的关键作用,以及它们如何应对细胞应激带来的错误折叠挑战。 第七章:内质网相关蛋白质降解(ERAD): 详细介绍了蛋白质在内质网中质量控制的机制,包括未折叠蛋白质的识别、泛素化以及被转运回细胞质进行降解的通路。 第八章:蛋白质修饰的动态景观: 系统梳理了主要的蛋白质翻译后修饰,如磷酸化、乙酰化、甲基化、羟基化等,并重点分析了这些修饰如何作为分子开关来调控蛋白质的活性、定位和相互作用。 第三部分:信号转导的层级结构 本部分聚焦于细胞如何感知外部或内部环境的变化,并通过信号分子网络将信息传递至细胞核或效应器分子。 第九章:受体酪氨酸激酶(RTK)信号通路: 以 EGFR、Insulin Receptor 等为例,详述了受体二聚化、自磷酸化及其下游分子(如 Grb2, SOS, Ras)的激活机制,以及 MAPK 级联反应。 第十章:G 蛋白偶联受体(GPCR)的信号多样性: 探讨了 GPCR 如何激活不同类型的 G 蛋白(Gs, Gi, Gq),进而调控第二信使(cAMP, IP3, DAG)的产生,以及 PLC 和腺苷酸环化酶的功能。 第十一章:细胞因子与 JAK-STAT 通路: 阐述了细胞因子受体如何激活 JAK 激酶,进而磷酸化并激活 STAT 转录因子,实现基因表达的快速响应。 第十二章:磷脂信号与细胞骨架重塑: 深入研究了 PI3K/Akt/mTOR 轴在线性生长与代谢调控中的中心地位,以及磷脂信号分子如何影响细胞形态和迁移。 第十三章:细胞粘附与细胞外基质的相互作用: 重点分析了整合素信号通路,及其如何通过 FAK 和 Src 家族激酶连接细胞外环境与细胞内部的应激反应。 第四部分:细胞命运的决定——周期、凋亡与衰老 本部分整合了前述的分子机制,探讨它们如何协同工作,以决定细胞的增殖、死亡或永久静止状态。 第十四章:细胞周期的精确调控: 详细剖析了细胞周期蛋白(Cyclins)和 CDK 激酶如何驱动细胞从 G1 期到 M 期的精准转换,以及检查点(Checkpoints)在确保基因组完整性中的作用。 第十五章:程序性细胞死亡(凋亡)的分子执行者: 深入研究了内源性和外源性凋亡通路的激活,重点描述了 Caspase 家族的激活级联反应,以及 Bcl-2 家族蛋白在调节线粒体通透性中的抗衡作用。 第十六章:细胞衰老(Senescence)的分子特征: 探讨了细胞衰老诱导的机制(如 DNA 损伤、端粒缩短),以及衰老相关分泌表型(SASP)对组织微环境的长期影响。 第十七章:干细胞自我更新与分化的分子开关: 分析了特定转录因子(如 Oct4, Sox2, Myc)在维持干细胞多能性中的作用,以及信号通路在诱导细胞走向特定谱系分化时的作用。 第五部分:系统层面的调控:稳态与病理生理 本部分将分子调控置于更宏大的生理背景下,探讨其在组织稳态维持和疾病发生中的角色。 第十八章:免疫系统的分子激活: 聚焦于 T 细胞受体(TCR)信号的初始激活,以及 B 细胞受体信号的下游事件,阐述了炎症反应和自身免疫疾病中的信号失调。 第十九章:代谢信号的整合: 详细描述了 AMP-activated protein kinase (AMPK) 和 mTOR 如何充当能量传感器,调控细胞对营养物质的吸收和利用。 第二十章:神经信号转导的前沿: 探讨了突触传递中的离子通道、神经递质受体,以及突触可塑性的分子基础(如 LTP 和 LTD)。 第二十一章:细胞间通讯的复杂网络: 阐述了旁分泌、自分泌和内分泌信号分子如何跨越细胞边界,实现组织的协同功能。 第六部分:前沿技术与未来展望 本部分介绍了当前研究分子调控机制所依赖的关键技术平台,并展望了该领域的未来方向。 第二十二章:高通量组学技术在调控研究中的应用: 涵盖了 ChIP-seq, ATAC-seq, RNA-seq, 和 Proteomics 在解析调控网络全景图中的优势与局限性。 第二十三章:基因编辑技术(CRISPR/Cas9)在功能研究中的精确性: 详细介绍了如何利用 CRISPR 系统进行基因敲除、激活或抑制,以解析特定调控元件的功能。 第二十四章:活细胞成像技术对动态过程的实时观测: 讨论了 FRET、BRET 和光漂白技术在监测蛋白质相互作用和信号转导活动方面的应用。 第二十五章:计算机模拟与网络重建: 介绍了系统生物学方法如何将大量的实验数据整合,构建可预测的分子调控网络模型。 本书以其详实的图表、精炼的文字和对前沿文献的准确把握,力求成为生命科学研究者理解和探索细胞生命活动的权威参考书。它不仅教授“是什么”,更深入剖析“如何发生”和“为何如此”,旨在激发读者对细胞生命奥秘的进一步探究热情。

作者简介

目录信息

读后感

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用户评价

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作为一名初入蛋白质组学研究的研究生,我对于如何有效地研究蛋白质的修饰,特别是泛素化修饰,感到十分迷茫。《泛素-蛋白酶体通则》这本书,无异于为我打开了一扇通往新世界的大门。这本书的内容非常丰富,从泛素分子的基本知识,到泛素链的形成、识别,再到蛋白酶体复合物的功能,几乎涵盖了UPS系统的所有重要方面。我特别喜欢书中关于“泛素化底物的鉴定”的章节,它详细介绍了如何利用质谱技术来识别泛素化位点,以及如何通过比较不同条件下的蛋白质组学数据来发现参与UPS调控的蛋白质。这些信息对于我进行蛋白质组学研究至关重要。书中还提供了一些关于如何优化细胞裂解和蛋白质提取方法的建议,这对于获得高质量的样品至关重要,并直接影响到后续的质谱分析结果。我尝试了书中介绍的几种不同的细胞裂解液配方,并发现其中一种能够显著提高我目标蛋白的提取效率。此外,书中关于“抗体在UPS研究中的应用”的讨论也让我受益匪浅,它详细介绍了如何选择、验证和使用针对泛素链和泛素化蛋白的抗体,这对于提高Western Blotting和免疫沉淀实验的特异性和灵敏度至关重要。这本书不仅仅是一本实验技术手册,更是一本关于蛋白质组学研究方法的指南,它为我今后的研究打下了坚实的基础。

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这本书的书名着实吸引人——《泛素-蛋白酶体通则》。在拿到它之前,我对于泛素-蛋白酶体系统(UPS)的研究还处于一个比较模糊的阶段,知道它在细胞内扮演着“垃圾处理器”的角色,但对于其精细的调控机制、涉及的分子如何相互作用,以及如何将这些知识转化为实验操作,我内心一直充满着疑问。当我翻开这本书的第一页,就被其扎实的理论基础和详尽的实验设计深深吸引。它不仅仅是一本操作手册,更像是一本通往UPS神秘世界的导览。作者们以一种循序渐进的方式,从泛素化修饰的基本原理讲起,逐步深入到UPS各个关键组分的功能解析,包括E1、E2、E3酶的活性检测,泛素链的形成与识别,以及蛋白酶体复合物的组装与功能分析。我特别喜欢其中关于E3连接酶多样性的讨论,它清晰地解释了为什么UPS能够如此精确地调控数量庞大的蛋白质底物。对于每一个实验步骤,书中都提供了详细的试剂配制、仪器设置、反应条件优化建议,甚至还预设了可能遇到的问题及解决方案,这对于像我这样需要从头开始学习相关技术的初学者来说,简直是福音。书中的图示也十分精美,那些展示蛋白质相互作用、信号通路调控以及实验流程的示意图,帮助我快速建立起宏观的认识。我甚至还尝试了书中介绍的几种细胞共聚焦成像技术,用来观察特定底物在细胞内的定位和泛素化水平变化,结果非常令人满意。总而言之,这本书为我打开了一扇了解UPS世界的窗户,让我能够更加自信地着手进行相关的实验研究,并逐渐形成自己独立的实验思路。

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作为一名长期从事细胞凋亡研究的研究者,我一直对泛素-蛋白酶体系统(UPS)在细胞死亡调控中的作用感到好奇。毕竟,许多凋亡相关的蛋白都需要经过UPS的降解来维持细胞内稳态,而UPS的失调又可能导致细胞凋亡通路异常激活或抑制。当我拿到《泛素-蛋白酶体通则》这本书时,我怀着忐忑的心情翻阅,生怕里面的内容过于晦涩难懂,或者与我的研究领域关联不大。然而,出乎意料的是,这本书的内容非常贴合我的需求。它在介绍泛素化过程的通用方法时,也巧妙地穿插了许多UPS在不同细胞过程中的具体案例,其中就包括了细胞凋亡的调控。例如,书中详细描述了如何使用免疫共沉淀(Co-IP)技术来鉴定与E3连接酶相互作用的底物蛋白,这对于我寻找新的凋亡抑制剂或激活剂非常有用。书中关于抗体选择和验证的建议也极其宝贵,毕竟在UPS的研究中,特异性的抗体是成功的关键。我尝试了书中推荐的一种针对特定泛素链的抗体,其检测效果远超我之前使用的其他抗体。此外,书中关于siRNA/shRNA介导的基因沉默技术在UPS研究中的应用也给了我很大启发,这可以帮助我更精确地验证某个E3连接酶在细胞凋亡中的功能。这本书不仅提供了实验操作指南,更重要的是,它教会了我如何将UPS研究的通用技术,灵活地应用于解决我自己的研究问题。

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在对激酶信号通路进行研究的过程中,我逐渐意识到泛素-蛋白酶体系统(UPS)对其精确调控起着至关重要的作用。激酶的活性、稳定性以及其下游底物的降解,都与UPS密切相关。然而,我对UPS的研究方法和技术细节了解不多。《泛素-蛋白酶体通则》这本书,正好填补了我的知识空白。它以一种非常系统化的方式,介绍了UPS研究的各个环节,并将其与激酶信号通路的研究相结合。书中关于“UPS对激酶信号通路调控”的章节,详细阐述了UPS如何影响激酶的激活、失活以及其底物的降解,并列举了许多具体的案例。我特别喜欢书中关于“如何利用免疫共沉淀(Co-IP)技术来研究激酶的泛素化修饰”的详细介绍。它不仅提供了详细的操作步骤,还深入分析了影响实验结果的各种因素,并给出了相应的优化策略。我根据书中的指导,成功地检测到了我研究的激酶在特定条件下的泛素化修饰,这为我进一步研究其功能提供了重要的线索。此外,书中关于“UPS与激酶抑制剂的协同作用”的讨论,也给了我很大的启发。我开始思考,是否可以通过联合使用UPS抑制剂和激酶抑制剂来达到更好的治疗效果。这本书的价值在于它不仅提供了扎实的实验技术,更重要的是,它将UPS研究与我熟悉的激酶信号通路研究紧密结合,为我提供了新的研究思路和方向。

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我是一名对癌症生物学充满兴趣的研究人员,而泛素-蛋白酶体系统(UPS)在癌症发生发展中的作用,一直是我的关注焦点。许多致癌基因和抑癌基因的表达和功能都受到UPS的调控,因此,深入了解UPS的研究方法,对于开发新的癌症治疗策略至关重要。《泛素-蛋白酶体通则》这本书,正好满足了我的需求。它以一种非常系统化的方式,介绍了UPS研究的方方面面,并将其与癌症生物学紧密结合。书中关于“UPS与癌症”的章节,详细阐述了UPS功能异常如何导致基因组不稳定、细胞周期失调以及肿瘤发生。我特别欣赏书中关于“UPS抑制剂在癌症治疗中的应用”的讨论,它不仅介绍了目前已有的UPS抑制剂,还展望了未来可能的新型抑制剂的开发方向。此外,书中关于“如何利用UPS研究来寻找新的癌症治疗靶点”的策略,也给了我很大的启发。我尝试了书中介绍的,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术来筛选与UPS相关的癌症易感基因的方法,并取得了一些初步的成果。书中还提供了关于如何利用小鼠模型来研究UPS在癌症中的作用的建议,这对于我未来的体内研究非常有价值。这本书的价值在于它不仅提供了扎实的实验技术,更重要的是,它将UPS研究与实际的疾病治疗紧密联系起来,为我提供了新的研究思路和方向。

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当我拿到《泛素-蛋白酶体通则》这本书时,我的研究正处于一个瓶颈期。我一直在尝试鉴定一个与我研究的信号通路相关的E3连接酶,但进展甚微。我尝试了多种方法,但总是无法获得可靠的结果。我对UPS系统并不陌生,但却缺乏系统性的实验指导。这本书的出现,就像是给我指明了方向。它不仅仅罗列了各种技术,更重要的是,它提供了一个完整的框架,让我能够理解UPS的各个组成部分是如何协同工作的,以及如何利用不同的技术去探索它们之间的关系。书中关于“E3连接酶的鉴定”这一章节,给了我极大的启发。它详细介绍了如何通过下拉分析(pull-down assays)、免疫共沉淀(Co-IP)、酵母双杂交(Y2H)等多种技术来寻找E3连接酶及其底物。书中对每种技术的优缺点、适用范围以及实验条件的优化都进行了详细的阐述,这让我能够根据自己的具体情况,选择最合适的方法。我特别尝试了书中介绍的,结合质谱技术进行E3连接酶底物鉴定的策略,并取得了一定的进展。此外,书中关于“泛素化修饰对蛋白质功能的影响”的讨论,也让我重新审视了我之前的实验设计,并进行了相应的调整。这本书不仅解决了我的技术难题,更重要的是,它拓宽了我的研究思路,让我能够以一种更全面的视角来理解UPS在细胞调控中的作用。

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作为一名长期致力于蛋白质降解机制研究的学者,我对泛素-蛋白酶体系统(UPS)一直保持着高度关注。《泛素-蛋白酶体通则》这本书,如同一本百科全书,为我提供了UPS研究的全面视角和精细操作指南。我特别欣赏书中关于“泛素化修饰的生物学意义”的深入探讨,它不仅仅停留在表面描述,而是深入分析了泛素化修饰在细胞信号转导、DNA损伤修复、免疫应答等多种生理过程中的关键作用。书中关于“不同泛素链类型的功能解析”的章节,让我对UPS的复杂性有了更深的理解,特别是K63链在信号转导中的作用,以及如何通过特异性抗体来检测和区分它们。我尝试了书中关于“利用体外重建系统研究泛素链的形成和降解”的实验方法,并成功地观察到了清晰的泛素链形成,这对于理解蛋白质降解的动态过程非常有帮助。此外,书中关于“蛋白质组学在UPS研究中的应用”的章节,也为我提供了新的研究思路,例如如何利用高通量筛选来鉴定新的UPS调控因子,或者如何通过定量蛋白质组学来研究UPS在不同疾病状态下的变化。这本书的价值在于它不仅提供了前沿的实验技术,更重要的是,它将UPS研究置于更广阔的生物学背景下进行阐述,让我能够以更宏观的视角来理解这一复杂的细胞调控系统。

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我在免疫学领域工作,最近的研究重点放在了T细胞的激活和分化过程中,而UPS在这些过程中扮演着至关重要的角色,比如调控转录因子和信号分子的稳定性。因此,寻找一本能够深入解读UPS研究方法的书籍变得尤为重要。《泛素-蛋白酶体通则》这本书的出现,可谓是恰逢其时。这本书非常全面地涵盖了UPS研究的各个方面,从最基础的蛋白质提取、Western Blotting,到更为复杂的免疫共沉淀(Co-IP)、体外泛素化实验,甚至是利用细胞成像技术来观察泛素化过程。我尤其欣赏书中关于Co-IP实验的详尽描述,它不仅提供了详细的操作步骤,还深入分析了可能影响实验结果的各种因素,例如抗体选择、洗涤条件、样品处理等,并给出了相应的优化策略。这对于我们这类需要大量进行蛋白质相互作用研究的领域来说,简直是宝藏。书中还对不同类型的泛素链(如K48、K63、线性泛素链等)的特异性检测方法进行了详细介绍,这对于理解UPS在不同信号通路中的作用至关重要。我根据书中的指导,成功地开发了一种能够区分K48和K63泛素化的实验方案,这为我深入研究T细胞激活过程中的UPS调控机制打下了坚实的基础。这本书的价值在于它将复杂的UPS研究技术,以一种易于理解和操作的方式呈现出来,并将其与生物学应用紧密结合。

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说实话,在拿到《泛素-蛋白酶体通则》之前,我对蛋白质降解这一概念的理解仅停留在“坏掉的蛋白质会被清除”这个非常粗浅的层面。我对泛素-蛋白酶体系统(UPS)知之甚少,更别提如何对其进行实验研究了。然而,这本书彻底改变了我对蛋白质代谢的认知。它以一种非常系统化的方式,从最基本的泛素分子结构和功能讲起,逐步深入到泛素链的形成、识别,以及最终蛋白质在蛋白酶体中的降解过程。书中关于泛素偶联酶(E2)和泛素连接酶(E3)的分类和功能介绍,让我对UPS的复杂性和精确性有了全新的认识。我印象最深刻的是书中对“泛素化修饰的特异性”的阐述,它解释了为什么UPS能够如此精确地识别并降解特定的蛋白质,而不是随机清除。这背后涉及的分子识别机制,让我惊叹于生命的精妙。这本书中的实验部分设计得非常严谨,从试剂的准备到操作的细节,都写得非常清楚。我特别尝试了书中关于“利用体外重组系统检测泛素连接酶活性”的部分,并成功地观察到了泛素链的形成,这对我来说是一个巨大的进步。此外,书中还提供了许多关于如何克服实验中常见问题的建议,例如非特异性结合、背景干扰等,这些都极大地提高了我的实验成功率。这本书不仅仅是一本技术手册,更是一本关于蛋白质稳态调控的科普读物,它让我对细胞内的精细运作有了更深刻的理解。

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坦白说,最初选择这本《泛素-蛋白酶体通则》,主要是因为我正在进行一项关于神经退行性疾病的研究,而UPS功能障碍被认为是许多这类疾病的重要病理机制。我希望能够通过这本书,找到一些直接针对UPS通路进行干预的策略,或者开发出能够检测UP S功能状态的生物标志物。这本书的价值在于它不仅提供了基础的实验方法,更重要的是,它将这些方法置于更广泛的生物学背景下进行阐述。例如,书中详细介绍了如何通过Western Blotting技术来检测蛋白质的泛素化水平,但它并没有止步于此,而是进一步探讨了不同泛素链类型(如K48、K63等)在不同生理过程中的作用,以及如何通过特定的抗体来区分它们。这种深入的解析让我意识到,仅仅检测泛素化水平是远远不够的,理解泛素链的类型及其下游效应才是关键。书中还涉及了一些更为前沿的技术,比如质谱技术在鉴定泛素化底物方面的应用,这让我对未来的研究方向有了新的启发。我尤其欣赏书中关于“目标蛋白质的获取与纯化”部分,这对于后续的生化分析至关重要,它详细列举了各种细胞裂解液的配方和优化步骤,以及如何减少非特异性结合和降解。读完这本书,我感觉自己对UPS的理解从“知道有这么个系统”提升到了“能够设计实验去探索这个系统的具体功能和调控”。它给了我进行更深入、更具创新性研究的信心和基础。

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