Class 2 Transferases IV

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出版者:Springer Verlag
作者:Schomburg, Dietmar (EDT)/ Schomburg, Ida (EDT)
出品人:
页数:627
译者:
出版时间:
价格:2771.00 元
装帧:HRD
isbn号码:9783540325925
丛书系列:
图书标签:
  • 酶学
  • 糖基转移酶
  • 生物化学
  • 蛋白质
  • 糖生物学
  • 代谢
  • 分子生物学
  • 结构生物学
  • 催化机制
  • 生物医学
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具体描述

好的,这是一本关于复杂酶学机制与蛋白质工程的专著的简介,重点关注转运酶(Transferases)在生物催化中的应用及其结构-功能关系,但不提及或暗示任何名为“Class 2 Transferases IV”的书籍: --- 酶催化领域前沿:结构生物学与定向进化在新型转运酶设计中的应用 本书深入探讨了生物体内最为精妙且功能多样的酶家族之一——转运酶(Transferases)——的分子机制、结构动力学及其在现代生物技术中的颠覆性潜力。 聚焦于当前酶学研究中最具挑战性的领域,本书旨在为生物化学家、结构生物学家以及药物研发人员提供一个全面、深入且具有实践指导意义的参考框架。 转运酶,作为催化分子基团(如磷酸基团、糖基、氨基或甲基)在底物间转移的催化剂,是生命活动中几乎所有代谢通路的中心枢纽。本书首先构建了一个坚实的理论基础,详细剖析了不同转运酶亚类的催化循环、过渡态稳定机制,以及关键活性位点残基的协同作用。我们摒弃了对经典反应的泛泛而谈,转而深入研究那些在非标准条件下展现出非凡稳定性和高周转率的“超级转运酶”。 第一部分:转运酶的结构基础与构象柔性 本部分将读者引入到转运酶的分子世界,重点解析其三维结构的复杂性。我们利用最先进的冷冻电镜(Cryo-EM)和高分辨率X射线晶体学数据,解构了数个具有代表性的转运酶(如涉及核苷酸糖基转移酶或特定氨基酸代谢途径中的酰基转移酶)的动态结构。 门户(Gatekeeper)机制的精细调控: 详细分析了底物进入活性口袋和产物脱离过程中的构象变化。我们引入了“耦合振动模式”的概念,阐述了酶与底物/辅因子结合时,远离活性中心的远程结构域如何通过非共价键网络精确地诱导催化中心的构象重排,从而实现对反应速率的毫秒级控制。 水合层与非水溶性环境的界面研究: 探讨了在细胞膜相关或疏水性底物处理的转运酶中,酶壳层(Solvent Interface)的微环境如何影响水分子在质子转移或电荷转移步骤中的作用。特别关注了那些涉及共价中间体的酶,其活性位点内局部极性的精确调控对降低活化能的贡献。 变构调控的拓扑学: 深入剖析了多聚体转运酶中,调节亚基(Allosteric Subunits)如何通过信号传导路径影响催化亚基的活性。书中提供了多个案例研究,展示了磷酸化、金属离子螯合或产物抑制物结合如何引发跨越数个纳米尺度的结构域移动,实现对酶活性的瞬时“开/关”切换。 第二部分:代谢通路的整合与互作网络 转运酶并非孤立存在,它们是复杂代谢网络中的关键节点。本书超越了传统的单酶分析,着重于转运酶在多酶复合物(Multi-Enzyme Complexes)中的功能整合。 代谢通道(Metabolic Channeling)的物理基础: 阐述了底物或中间体如何通过酶间接触界面直接转移,避免与细胞质环境的接触,从而提高反应的特异性和效率。我们利用荧光共振能量转移(FRET)和时间分辨光谱技术,定量分析了特定级联反应中转运酶与下游酶的结合强度和停留时间。 能量耦合与辅因子再生: 许多关键转运反应依赖于高能辅因子的再生(如ATP水解或NAD(P)H的氧化还原)。本章细致考察了这些能量耦合的结构基础,特别是那些涉及“分子机器”组装的转运酶,它们如何实现能量的“即时供应”与“定向输送”。 第三部分:定向进化与理性设计驱动的酶工程 本部分是本书的核心应用篇章,着重介绍如何利用现代生物技术手段,对天然转运酶进行改造,以满足工业和药物开发的需求。 高通量筛选与定向进化策略的革新: 介绍了针对转运酶特性的新型筛选技术,例如基于膜蛋白表达系统或微流控芯片的活性检测方法。重点讨论了如何设计筛选系统以靶向特定的“非天然”底物或提高对非生理温度/pH的耐受性。 理性设计与计算机辅助酶设计(CAD): 详述了如何利用分子动力学模拟(MD)和量子化学计算(QM/MM)来预测突变对过渡态能量的影响。书中提供了几个成功的案例,展示了通过精确替换活性位点关键残基,成功将具有低催化效率的天然转运酶转化为高活性的生物催化剂的详细流程。 非天然底物的空间兼容性改造: 面对复杂药物前体或新型生物燃料中间体的合成需求,我们探讨了如何通过“文库扫描”和“对接模拟”相结合的方法,拓宽转运酶的底物识别范围。尤其关注了如何利用结构信息来识别并消除天然产物抑制机制,从而实现连续反应的高效进行。 本书的独特之处在于其对催化机制的深度挖掘与对工程应用的无缝衔接。 它不仅呈现了转运酶的静态结构之美,更揭示了其动态功能背后的精密调控逻辑,为下一代生物制造和精准医疗的酶工具箱构建提供了坚实的科学蓝图。 读者在阅读后,将能以全新的视角理解和驾驭这些生命系统的“分子搬运工”。 ---

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