肾活检病理学是随着临床肾穿刺技术的广泛开展及应用而逐渐发展起来的。20世纪50年代初，丹麦的两位医师Iversen和Bran首先采用经皮肾穿刺技术，用于对肾病患者疾病的诊断，开创了肾活检病理学诊断的新时代。半个多世纪以来，随着免疫学、免疫病理学和电镜技术的不断发展，尤其是用于检测肾组织内沉积的各种免疫球蛋白、补体、纤维蛋白(纤维蛋白原)和其他成分(如乙型肝炎病毒抗原、Ⅲ型胶原蛋白等)的抗体的商品化，以及肾穿刺技术安全性的大大提高，经皮肾穿刺技术已成为临床诊断肾病的一个重要手段，由此应运而生的肾活检病理学也成为现代病理学的一个新分支。
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