全書共收錄瞭常見的消化疾病35種，按概述、診斷、分證論治和中成藥應用舉例、療效判定標準等五個部分編寫。概述部分以精練的語言簡單介紹瞭該病的定義、病因學、流行病學和中醫病名。診斷部分分為疾病診斷、西醫分類診斷和中醫證候診斷，其中疾病診斷參照瞭西醫學對該病的最新認識與指南；分類診斷按需要對該疾病的分型、分期、分級、分度等進行論述；證候診斷是全書的精華部分，按照循證醫學的方法，通過臨床薈萃分析手段集中瞭該病最常見的臨床證候標準並基本按照證候由高到低的頻率排列，證候標準在參照國傢標準的基礎上，按主癥和次癥的不同而定，具有較強的臨床操作性與實用性。療效判定標準收錄瞭臨床療效標準和證候療效標準，為臨床與科研提供依據；而證候療效標準的癥狀分級則放在附錄篇中，各論中不再單獨論述。分證論治分彆對各證候的治法、主方、方藥進行論述，主方以成方為主並提供齣處供讀者參考；方藥則按照君、臣、佐、使進行排列。中成藥應用舉例參考國傢基本用藥目錄收錄的中成藥為主。
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