Genetic Analysis of Complex Disease

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出版者:Wiley-Liss
作者:Jonathan L. Haines
出品人:
页数:512
译者:
出版时间:2006-5-5
价格:USD 152.95
装帧:Paperback
isbn号码:9780471089520
丛书系列:
图书标签:
  • 遗传分析
  • 复杂疾病
  • 基因组学
  • 生物统计学
  • 流行病学
  • 遗传学
  • 医学遗传学
  • 多基因遗传
  • GWAS
  • 表型关联
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具体描述

Second Edition features the latest tools for uncovering the genetic basis of human disease

The Second Edition of this landmark publication brings together a team of leading experts in the field to thoroughly update the publication. Readers will discover the tremendous advances made in human genetics in the seven years that have elapsed since the First Edition. Once again, the editors have assembled a comprehensive introduction to the strategies, designs, and methods of analysis for the discovery of genes in common and genetically complex traits. The growing social, legal, and ethical issues surrounding the field are thoroughly examined as well.

Rather than focusing on technical details or particular methodologies, the editors take a broader approach that emphasizes concepts and experimental design. Readers familiar with the First Edition will find new and cutting-edge material incorporated into the text:

* Updated presentations of bioinformatics, multiple comparisons, sample size requirements, parametric linkage analysis, case-control and family-based approaches, and genomic screening

* New methods for analysis of gene-gene and gene-environment interactions

* A completely rewritten and updated chapter on determining genetic components of disease

* New chapters covering molecular genomic approaches such as microarray and SAGE analyses using single nucleotide polymorphism (SNP) and cDNA expression data, as well as quantitative trait loci (QTL) mapping

The editors, two of the world's leading genetic epidemiologists, have ensured that each chapter adheres to a consistent and high standard. Each one includes all-new discussion questions and practical examples. Chapter summaries highlight key points, and a list of references for each chapter opens the door to further investigation of specific topics.

Molecular biologists, human geneticists, genetic epidemiologists, and clinical and pharmaceutical researchers will find the Second Edition a helpful guide to understanding the genetic basis of human disease, with its new tools for detecting risk factors and discovering treatment strategies.

《基因解码:破解人类疾病的遗传密码》 人类的健康与疾病,在很大程度上受到我们基因组的深刻影响。从罹患罕见的单基因遗传病,到更普遍且复杂的疾病,如癌症、糖尿病、心血管疾病和神经退行性疾病,遗传因素始终扮演着至关重要的角色。然而,理解这些遗传因素如何与环境、生活方式以及其他生物学过程相互作用,以致影响个体的健康轨迹,却是一项极具挑战性的科学任务。 《基因解码:破解人类疾病的遗传密码》旨在深入探讨复杂疾病的遗传基础,为读者揭示一个跨越分子生物学、遗传学、流行病学乃至生物信息学的广阔研究领域。本书并非简单罗列疾病名称与相关基因,而是着力于阐述理解这些复杂关系的科学方法、理论框架和前沿技术。 本书内容涵盖以下核心方面: 第一部分:遗传学基础回顾与复杂性引入 在深入探讨复杂疾病之前,本书将首先回顾孟德尔遗传学的基本原理,包括基因、等位基因、基因型、表现型、遗传模式(显性、隐性、伴性等)的概念。在此基础上,我们将转向理解“复杂疾病”的特有属性。与由单一基因突变引起的单基因病不同,复杂疾病的发生通常涉及多个基因的协同作用,且受到环境因素的显著影响。本书将详细介绍多基因遗传、基因-环境互作(GxE)、表观遗传学修饰在复杂疾病发生发展中的作用,以及这些因素如何导致个体间疾病风险的巨大差异。 第二部分:解析复杂疾病的遗传学研究方法 理解复杂疾病的遗传基础,离不开强大的研究工具和严谨的研究设计。本书将详细介绍当前主流的遗传学研究方法,包括: 全基因组关联研究 (GWAS): 阐述GWAS的基本原理、研究设计、数据分析流程以及如何识别与复杂疾病风险相关的常见变异。我们将深入讨论GWAS的优势与局限性,例如对罕见变异的敏感度较低,以及如何通过 meta-analysis 等策略来增强研究的统计效能。 候选基因关联研究: 介绍基于生物学推测或先导研究,选择特定基因进行关联分析的方法,并探讨其在特定研究情境下的适用性。 全外显子组测序 (WES) 和全基因组测序 (WGS): 重点介绍WES和WGS在识别罕见变异和结构变异中的作用,以及这些技术如何帮助我们发现对复杂疾病具有重要影响的遗传因素。 连锁分析与家系研究: 回顾传统的家系研究方法,以及其在定位致病基因和评估遗传力方面的贡献,特别是对于具有明显遗传倾向的复杂疾病。 功能遗传学研究: 阐述如何通过体外实验(如基因敲除/敲低、过表达)、动物模型和细胞模型来验证GWAS等发现的遗传变异的功能意义,从而深入理解其致病机制。 第三部分:生物信息学工具与大数据分析在遗传学研究中的应用 随着高通量测序技术的飞速发展,海量的遗传学数据应运而生。本书将重点介绍生物信息学在处理和解读这些数据中的关键作用。内容将包括: 基因组数据库与资源: 介绍重要的基因组数据库(如Ensembl, UCSC Genome Browser)、变异数据库(如dbSNP, gnomAD)以及疾病相关数据库(如OMIM, ClinVar)的使用方法,帮助读者检索和理解基因组信息。 基因型质量控制与数据预处理: 阐述数据清洗、缺失值处理、杂合性检验、 Hardy-Weinberg 平衡检验等预处理步骤,确保分析结果的可靠性。 关联分析软件与统计学方法: 介绍常用的关联分析软件(如PLINK, SAIGE),以及单变量和多变量回归、主成分分析(PCA)等统计学方法在控制混杂因素和评估遗传效应中的应用。 多基因风险评分 (PRS) 的构建与应用: 详细介绍如何整合多个风险基因位点的效应,构建个体化的多基因风险评分,并探讨其在预测疾病风险、辅助临床决策和指导个性化健康管理方面的潜力。 基因-基因互作 (GGI) 和基因-环境互作 (GxE) 的分析策略: 介绍探索基因之间或基因与环境因素之间复杂互作效应的研究方法和统计模型。 第四部分:复杂疾病的遗传学研究案例与未来展望 本书将通过一系列经典和前沿的复杂疾病遗传学研究案例,将理论知识与实际应用相结合。我们将深入剖析这些研究是如何设计、执行以及如何利用先进技术解析特定疾病(如2型糖尿病、阿尔茨海默病、某些癌症类型、精神疾病等)的遗传基础的。 最后,本书将展望复杂疾病遗传学研究的未来发展方向,包括: 整合组学研究: 探讨如何将基因组学与其他组学数据(如转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组学)整合,以更全面地理解疾病的发生机制。 单细胞分辨率的研究: 介绍单细胞技术在揭示疾病发生过程中细胞异质性与遗传调控方面的潜力。 机器学习与人工智能在遗传学分析中的应用: 探讨AI如何加速基因发现、模式识别和预测模型构建。 精准医学与遗传学: 强调遗传学研究如何推动精准医疗的发展,实现疾病的早期诊断、风险评估、靶向治疗和个性化预防。 《基因解码:破解人类疾病的遗传密码》将为遗传学家、医学研究者、临床医生、生物信息学家以及对人类遗传学和疾病发生机制感兴趣的学生和公众,提供一个全面、深入且具有前瞻性的视角,助力读者理解并探索人类基因组的奥秘,为攻克复杂疾病贡献智慧和力量。

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读后感

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用户评价

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说实话,市面上关于基因组学的书汗牛充栋,但大多都停留在描述“我们发现了什么”,而很少深入探讨“我们是如何发现的,以及为什么结果是这样的”。这本书的价值恰恰在于后者。它像一把手术刀,精准地解剖了现代遗传学分析技术背后的数学和统计学原理。我尤其对其中关于数量遗传学模型(Quantitative Genetics Models)的章节印象深刻。作者没有回避那些复杂的数学公式,反而通过图示和生动的比喻,将它们解构得清晰明了。我以前总觉得像混合模型、混合效应这些概念遥不可及,但读完这一部分,我突然明白了它们在校正群体结构时的关键作用。这种由浅入深,层层递进的讲解方式,避免了信息过载,保证了读者能够真正消化吸收每一个核心概念。这本书的深度和广度令人惊叹,它迫使你停下来,思考每一个假设背后的合理性,而不是被动接受既有结论。

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这本书简直是为我这种对复杂疾病遗传学充满好奇的初学者量身定做的!我一直想深入了解,但那些教科书动辄上千页,晦涩难懂,读起来就像在啃一块又硬又冷的石头。这本《Genetic Analysis of Complex Disease》却完全不一样,它的叙述方式非常流畅自然,仿佛一位经验丰富的教授在耐心地为你拆解一个个难题。作者似乎深谙初学者的痛点,从最基础的孟德尔遗传学原理讲起,然后循序渐进地引入连锁分析、全基因组关联研究(GWAS)的种种细节。尤其让我印象深刻的是,书中对“遗漏的遗传力”(Missing Heritability)问题的探讨,角度非常新颖,没有简单地给出结论,而是引导读者思考当前研究方法的局限性与未来的突破点。文字间充满了对科学严谨性的坚守,但同时又保持着一种恰到好处的亲和力,让人在学习枯燥的统计学概念时,也不会感到窒息。它成功地将一个理论性极强的领域,变得触手可及,极大地激发了我继续探索下去的动力。我强烈推荐给所有被复杂疾病的遗传背景困扰的朋友们。

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我拿到这本书时,内心是充满期待但又带着一丝怀疑的,因为“复杂疾病”这个词本身就暗示了研究的艰巨性。然而,这本书的结构设计,简直是教科书级别的典范。它的逻辑层次感极其清晰,章节之间的过渡衔接得毫无痕迹,读起来让人感觉知识点是自然而然地生长出来的,而不是被生硬地拼凑在一起。特别是关于多基因风险评分(PRS)构建和验证的那几章,内容翔实到令人咋舌。它不仅介绍了算法的核心思想,还非常细致地讨论了在不同人群中使用PRS时可能出现的偏差和伦理考量。我特别喜欢作者在每章末尾设置的“案例分析”环节,通过真实的疾病数据模拟,让我们真切地感受到理论是如何应用于解决实际问题的。这本书绝对不是那种浮光掠影地介绍概念的入门读物,它更像是一本工具书,充满了可操作性的指导和深入的批判性思考。对于已经有一定生物信息学基础的研究人员来说,它提供了一个绝佳的框架,用以梳理和优化自己的研究流程。

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这本书带给我一种“豁然开朗”的体验,特别是对于那些长期困扰我的方法学难题。我个人在处理罕见突变和结构变异对复杂疾病影响时,一直找不到一个统一的视角来整合这些异质性的遗传因素。这本书提供了一个非常宏大的视角,它将宏基因组学、表观遗传学的数据整合进传统的复杂疾病分析框架中,展示了如何构建一个更加全面的遗传风险图谱。它的行文风格非常直接、有力,没有过多的修饰,直奔主题,这对于时间宝贵的科研人员来说是极大的福音。书中对不同研究设计(如队列研究、病例对照研究、家系研究)的优劣势对比分析,简直是黄金标准,清晰地指出了每种设计在评估特定遗传效应时的盲点。读完后,我立即修改了手头上一个正在进行的项目的设计方案,因为它让我意识到了一个我之前忽略的关键混杂因素。这本书的实用性和前瞻性是毋庸置疑的。

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坦率地说,这本书的出版时间虽然不算最新,但它所建立的分析思想和方法论的根基是如此扎实,以至于至今仍具有极强的指导意义。我欣赏作者的远见卓识,书中对未来精准医疗和个性化风险预测的展望,虽然是建立在当时的技术基础之上,但其逻辑推演依然精准到位。这本书不仅仅是介绍已有的技术,更像是传授一种“思考复杂疾病遗传学问题的方式”。它不教你如何使用某个特定的软件,而是教你理解软件背后的统计学逻辑,这才是真正宝贵的财富。我特别喜欢它对遗传异质性(Genetic Heterogeneity)的讨论,作者没有将其视为一个障碍,而是将其视为复杂疾病研究的必然属性,并提供了相应的建模策略。这本书的阅读体验,就像是攀登一座知识的高峰,虽然过程需要努力,但一旦到达顶端,视野会变得无比开阔,能够清晰地看到整个学科的脉络和未来的发展方向。

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