《微生物基因组》是由微生物基因组学开创者们撰写，重点介绍了10年来微生物学转向全基因组序列研究的进展，包括微生物基因组学的历史、作为基因组学工具的生物信息学、核心功能、微生物基因组的进化、微生物基因组的调查和基因组数据库的应用共6个部分。所有内容均涉及本学科前沿，作者们现身说法，深入浅出，既能使初涉微生物基因组学领域的研究生们感兴趣．又能使在微生物学和基因组学方面有造诣的专家们参考，是微生物学专著中的精品。
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