Metabolic Engineering

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出版者:Academic Press
作者:Gregory N. Stephanopoulos
出品人:
页数:725
译者:
出版时间:1998-10-16
价格:USD 220.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9780126662603
丛书系列:
图书标签:
  • biology
  • Metabolic
  • Engineering
  • 代谢工程
  • 合成生物学
  • 生物技术
  • 基因工程
  • 代谢途径
  • 生物反应器
  • 细胞工程
  • 系统生物学
  • 生物分子工程
  • 工业微生物学
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具体描述

Metabolic engineering is a new field with applications in the production of chemicals, fuels, materials, pharmaceuticals, and medicine at the genetic level. The field's novelty is in the synthesis of molecular biology techniques and the tools of mathematical analysis, which allow rational selection of targets for genetic modification through measurements and control of metabolic fluxes. The objective is to identify specific genetics or environmental manipulations that result in improvements in yield and productivities of biotechnological processes. Key features of the book are pathway integration and the focus on metabolic flux as a fundamental determinant of cell physiology. The book keeps mathematical complexity to a minimum, and provides a glossary of biological terms to facilitate use of the book by a broader spectrum of readers. A web page exists to communicate updates of the codes and homework problems. It demonstrates metabolic engineering in action with numerous examples of pathway modification. It includes methods for identifying key enzymes in metabolic networks. It contains a comprehensive review of metabolic biochemistry. It discusses metabolic regulation at the gene, enzyme, operon, and cell levels. It explains concepts of stoichiometry, kinetics, and thermodynamics of metabolic pathways. It minimizes mathematical complexity. It features links to a Web page to communicate updates of the software code and homework problems.

《生命蓝图的精雕细琢:现代合成生物学的技术与应用》 导言:重塑生命的无限可能 在浩瀚的生命科学领域,人类对生命本质的探索从未止步。从古老的炼金术到现代的基因测序,我们对生物体结构的理解日益深入,对生命过程的操控能力也愈发精湛。本书《生命蓝图的精雕细琢:现代合成生物学的技术与应用》旨在为您揭示一个激动人心的前沿领域——合成生物学,它不仅仅是理解生命,更是以工程师的思维和工具,设计、构建并改造具有全新功能的生物系统,从而为解决人类面临的重大挑战提供前所未有的解决方案。 本书将带领您穿越生物学的传统疆域,进入一个由模块化设计、标准化元件和系统性思维驱动的崭新时代。我们将深入剖析合成生物学的核心理念,探讨其技术基石,并展示其在生物制造、医药健康、环境保护、能源开发以及农业生产等多个领域的颠覆性应用。这本书是为那些对生命科学充满好奇,渴望了解如何“编写”生命的语言,并运用这项强大技术改造世界的读者量身定制的。无论您是生物学研究人员、工程师、企业家,还是仅仅对未来科技充满憧憬的学生,都能在这本书中找到启发和指引。 第一章:合成生物学——生命工程的新篇章 本章将深入浅出地介绍合成生物学的概念、发展历程及其核心特征。我们将追溯其思想根源,从摩尔定律到基因工程的演进,最终抵达合成生物学作为一个独立学科的崛起。我们会详细阐述合成生物学如何借鉴工程学的设计原则,如模块化、抽象化和标准化,将复杂的生命系统分解为可理解、可预测、可操控的基本单元。 生命工程的理念演进: 从基因工程的“编辑”到合成生物学的“设计与构建”,我们将梳理这一思想的飞跃。 核心原则解析: 深入讲解模块化、抽象化、标准化、解耦以及鲁棒性等合成生物学特有的工程学思维。 “标准生物元件”的概念: 介绍BioBricks等标准化DNA片段的意义,以及它们如何加速生命系统的设计与构建。 从“理解”到“创造”: 阐述合成生物学与传统生物学在研究范式上的根本区别。 第二章:构建生命的积木——关键技术平台 成功的生命工程离不开强大的技术支撑。本章将重点介绍支撑合成生物学发展的几大关键技术平台,从基因的合成与编辑,到高通量的数据分析与模拟,它们共同构成了“生命蓝图”的设计与实现工具箱。 基因合成与测序技术: 详述DNA合成技术的飞速发展,如何实现任意序列的“打印”,以及高通量测序在验证和反馈中的作用。 基因编辑工具(CRISPR-Cas9及其衍生技术): 深入剖析CRISPR技术如何在基因组层面实现精确的“剪切”与“粘贴”,以及其在基因功能研究和系统改造中的巨大潜力。 代谢工程与途径设计: 讲解如何设计和构建全新的代谢途径,以优化目标产物的生产或赋予生物体新的功能。 蛋白质工程与酶的设计: 介绍如何通过改造蛋白质结构和功能,创造出具有特定催化活性或物理化学性质的“人造酶”。 计算与模拟工具: 探讨生物信息学、系统生物学建模以及机器学习等计算工具在预测、优化和设计复杂生物系统中的关键作用。 第三章:药物研发的加速器——精准医疗与新药创制 合成生物学正在以前所未有的速度改变着药物研发的面貌。本章将聚焦于合成生物学在精准医疗和新药创制领域的应用,从设计能够精确靶向疾病细胞的治疗性生物大分子,到开发新型抗生素以应对日益严峻的耐药性挑战。 设计治疗性蛋白质与核酸: 介绍如何设计具有特定识别能力和调控功能的抗体、适配体、siRNA等,用于疾病诊断和治疗。 开发智能药物递送系统: 探讨如何构建能够响应体内特定信号(如pH、温度、特定分子)而释放药物的生物载体。 微生物制药的革新: 讲解如何改造微生物,使其成为高效生产复杂药物分子(如抗生素、疫苗、多肽类药物)的“活工厂”。 肿瘤治疗的新策略: 介绍嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)疗法等合成免疫疗法,以及利用工程化细菌或病毒进行肿瘤靶向治疗的潜力。 应对耐药性挑战: 探讨合成生物学在发现和设计新型抗生素、抗病毒药物方面的作用。 第四章:生物制造的绿色革命——可持续的工业生产 传统工业生产往往伴随着高能耗和环境污染。合成生物学为构建绿色、可持续的生物制造平台提供了强大的武器。本章将展示如何利用工程化的微生物或细胞,高效、经济地生产各种化学品、材料和燃料,从而推动工业的绿色转型。 生物基化学品生产: 介绍如何设计和优化微生物发酵过程,以生产高价值的化学品,如有机酸、醇类、氨基酸、聚合物单体等。 生物基材料的创新: 探讨如何利用工程化生物体合成新型生物塑料、生物纤维、生物涂料等,实现材料的可持续化。 可再生能源的开发: 介绍利用工程化藻类或细菌生产生物燃料(如生物乙醇、生物柴油、生物氢)的潜力,以及固碳技术。 酶工程在工业催化中的应用: 讲解如何设计高效、稳定的工业用酶,替代传统的化学催化剂,实现更环保、经济的生产过程。 “细胞工厂”的设计与优化: 深入解析如何通过基因组工程、代谢工程等技术,提升微生物生产目标产物的效率和产量。 第五章:环境保护与可持续发展 环境污染和资源枯竭是人类面临的严峻挑战。合成生物学为解决这些问题提供了创新的生物学解决方案。本章将重点关注合成生物学在环境修复、资源回收以及可持续农业等领域的应用。 生物修复技术: 介绍如何设计能够降解污染物(如塑料、重金属、农药)的工程化微生物,用于土壤和水体的修复。 生物传感器与环境监测: 探讨如何构建能够检测特定环境污染物或有害物质的生物传感器。 资源回收与循环利用: 介绍利用工程化生物体处理废弃物,从中回收有价值物质的潜力。 可持续农业的创新: 讲解如何利用合成生物学技术改良作物,提高其抗逆性、营养价值,或赋予其固氮、抗病等能力。 生物多样性保护与恢复: 探讨合成生物学在物种复育、疾病防控等方面的潜在应用。 第六章:生命系统的智能控制——系统生物学与大数据融合 理解和操控复杂的生命系统,离不开系统生物学的研究范式以及大数据分析的支持。本章将深入探讨合成生物学与系统生物学的深度融合,以及如何利用大数据和人工智能技术,实现对生命系统的智能设计与控制。 系统生物学的基本原理: 介绍从整体和动态的角度研究生命系统,理解基因、蛋白质、代谢物之间的相互作用网络。 建模与仿真: 讲解如何构建数学模型来描述和预测生物系统的行为,从而指导实验设计。 高通量实验与数据整合: 介绍组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)产生的海量数据,以及如何将其整合分析。 机器学习与人工智能的应用: 探讨机器学习算法如何在海量生物数据中发现规律,预测基因功能,优化设计方案。 “设计-建造-测试-学习”循环: 阐述如何通过这种迭代过程,不断优化和完善设计出的生命系统。 第七章:伦理、安全与未来展望 任何一项颠覆性技术的发展都伴随着伦理、安全和社会责任的考量。本章将审视合成生物学在伦理、安全和监管方面面临的挑战,并展望其未来的发展趋势和潜在影响。 生物安全与风险评估: 探讨如何评估和管理合成生物学研究和应用带来的潜在风险,包括基因漂移、生物逃逸等。 伦理考量与公众参与: 讨论基因工程、人工生命创造等问题引发的伦理争议,以及公众在技术发展中的角色。 监管框架与政策制定: 分析当前各国在合成生物学领域的监管现状,以及未来政策制定需要关注的重点。 合成生物学的未来图景: 展望合成生物学在未来可能实现的更宏大的目标,如人造生命、太空殖民、延长人类寿命等。 跨学科合作的重要性: 强调合成生物学作为一门交叉学科,需要生物学家、工程师、计算机科学家、伦理学家、社会学家等共同努力,方能实现其最大价值。 结语:拥抱生命工程的未来 《生命蓝图的精雕细琢:现代合成生物学的技术与应用》致力于为读者提供一个全面、深入、前沿的视角,去理解和探索合成生物学这一蓬勃发展的领域。我们相信,通过掌握生命的设计语言,人类将能够以前所未有的智慧和能力,应对全球性挑战,创造一个更加健康、可持续和美好的未来。希望本书能激发您对生命科学的无限热情,并鼓励您加入到这场由生命工程驱动的伟大变革之中。

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读后感

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用户评价

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我花了整整一个周末的时间才勉强读完了这本书的前三分之一,坦白说,它的叙事节奏把握得极其微妙,甚至可以说是有些反直觉的。它不像那些流行的畅销书那样,开篇就抛出爆炸性的悬念,反而更像是一位经验丰富的老者,慢条斯理地铺陈着他的见解。我注意到作者非常擅长运用大段的内心独白和环境描写来烘托气氛,有时候为了描述一个角色的细微情感波动,能用上整整两页的文字,这种深度挖掘让人物的形象异常立体,简直就像是活生生地站在你面前一样。但同时,这也成了阅读过程中的一个“挑战”,尤其是在工作日晚上,注意力稍微一分散,就很容易跟不上作者那蜿蜒曲折的思绪。书中似乎对某个特定的历史时期或地理环境进行了近乎偏执的还原,那些细枝末节的描写,比如某件家具的材质,某条街道的气味,都充满了强烈的个人印记。我猜想,作者可能是在试图通过这种方式,将读者彻底“吸入”到他构建的那个特定时空之中,迫使我们去感受他想要传达的全部情绪和氛围,而不是仅仅停留在信息的层面。

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这本书给我的感觉,更像是一部充满隐喻的寓言集,而非传统意义上的小说或纪实文学。我发现自己时常会停下来,反复琢磨某一句台词,因为它们似乎都藏着更深一层的含义。比如,书中反复出现的一个意象——“破碎的罗盘”——它究竟象征着迷失的方向,还是对既定规则的反抗?作者对此绝口不提,而是让读者自己去构建解释的框架。这种开放性是它最迷人的地方,也可能是最令人沮丧的地方。我甚至找了几个同样读过这本书的朋友讨论,结果每个人对核心主题的解读都大相径庭,这说明作者在文字的选择上达到了极高的艺术水准,能够激发多重解读的可能性。而且,这本书的语言风格变化多端,前一章可能还是冷峻、精确的散文体,下一章突然就切换成了充满古典韵味的诗歌体,这种风格上的跳跃性,要求读者必须时刻保持警惕,跟上作者的思维步伐,否则很容易错过那些转瞬即逝的深层意图。

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这本书的装帧设计着实让人眼前一亮,那沉稳的深蓝色调,配上烫金的书名和作者信息,在书架上瞬间就能捕捉到目光。我当时在书店里是冲着这个设计感才把它拿起来的,原本还以为里面会是某种偏向艺术或哲学思辨的著作,毕竟现在的图书封面越来越有“说书”的能力了。翻开后,里面的排版布局也相当考究,字体大小适中,行距留得舒服,即便是初读较为晦涩的文本,也能让人在视觉上感到一丝放松。我记得当时在咖啡馆里试读了几页,内容似乎涉及某种宏大的叙事,关于文明的兴衰,或者是一种对人类存在本质的探索。那种感觉就像是打开了一扇通往遥远历史或未来图景的大门,文字的韵律感很强,读起来有一种史诗般的庄重感,让人不禁想一口气读完,去探寻作者到底想构建一个怎样宏伟的世界观。书中似乎穿插着一些非常精妙的比喻,将抽象的概念具象化,这一点我很欣赏,因为它极大地降低了理解门槛,让那些原本可能高高在上的理论变得触手可及。总体来说,从物理接触到初步阅读体验,这本书成功地营造了一种“值得细细品味”的氛围,让人对其中蕴含的知识或故事充满了期待。

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这本书带给我最深刻的体验,是它如何处理“时间”这个概念。它似乎并不遵循线性的时间流逝,而是将过去、现在和未来以一种交错叠加的方式呈现出来。有时候,我感觉自己正在阅读一段发生在几个世纪前的历史记录,下一秒,叙述者的声音又会跳跃到对当下社会现象的尖锐评论,语气中充满了对现状的某种无力和讽刺。这种非线性的叙事手法,使得阅读过程充满了“迷失感”,你很难清晰地定位故事发生的确切“此刻”。我猜想,作者可能是在尝试表达一种观点,即人类的经验和教训是循环往复的,历史的幽灵从未真正离去。书中某些章节的措辞,甚至带有一种古老的、近乎宗教宣谕的口吻,这种宏大叙事与对个体命运的细致描绘的交替,形成了强烈的张力,让人在敬畏之余,也不禁反思自身在漫长历史长河中的渺小和短暂。看完后,我感觉自己仿佛经历了一场精神上的长途跋涉,受益匪浅。

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我必须承认,在阅读这本书的过程中,我经历了几次想要放弃的冲动,但这几次挣扎最终都转化成了更强烈的求知欲。这本书在结构上展现出一种近乎数学般的严谨性,各个章节之间的逻辑关联非常紧密,仿佛是用无数条看不见的线索编织而成的一张巨网。我怀疑作者在动笔之前,可能已经为这本书建立了一个极为详尽的思维导图或大纲。其中有几处情节的设置,精妙到令人拍案叫绝,比如一个人物在第一部分看似无意中提到的小习惯,在全书的后半段竟然成为了解决关键冲突的“钥匙”。这种伏笔的回收处理得极其干净利落,没有丝毫的拖泥带水,显示了作者对整体结构布局的绝对掌控力。对于喜欢拆解故事结构、研究叙事技巧的读者来说,这本书简直是一座值得深入挖掘的宝藏,你需要做的就是耐心地梳理那些看似随机的事件,将它们归位到作者预设的宏大蓝图中。

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